RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 COX7CP15954 63 aa4.13□□□□□ -1.75
CS-217ENST00000550044 LINC01554Q52M75 96 aa4.09□□□□□ -1.75
CS-217ENST00000550044 PLAC4Q8WY50 150 aa4.09□□□□□ -1.75
CS-217ENST00000550044 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.08□□□□□ -1.76
CS-217ENST00000550044 CYSTM1Q9H1C7 97 aa4.08□□□□□ -1.76
CS-217ENST00000550044 COA5Q86WW8 74 aa4.06□□□□□ -1.76
CS-217ENST00000550044 H7BZZ5 65 aa4.05□□□□□ -1.76
CS-217ENST00000550044 SPRR2DP22532 72 aa4.05□□□□□ -1.76
CS-217ENST00000550044 MT1XP80297 61 aa4.02□□□□□ -1.77
CS-217ENST00000550044 PRO2289Q9P1D8 64 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-217ENST00000550044 CCDC179H3BU77 68 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-217ENST00000550044 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
CS-217ENST00000550044 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.96□□□□□ -1.78
CS-217ENST00000550044 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.96□□□□□ -1.78
CS-217ENST00000550044 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.95□□□□□ -1.78
CS-217ENST00000550044 SERP1Q9Y6X1 66 aa3.95□□□□□ -1.78
CS-217ENST00000550044 LCE1FQ5T754 118 aa3.94□□□□□ -1.78
CS-217ENST00000550044 A0A1B0GU33 70 aa3.89□□□□□ -1.79
CS-217ENST00000550044 SPATA8Q6RVD6 105 aa3.89□□□□□ -1.79
CS-217ENST00000550044 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.89□□□□□ -1.79
CS-217ENST00000550044 A0A0D9SG42 100 aa3.88□□□□□ -1.79
CS-217ENST00000550044 A8MU10 97 aa3.87□□□□□ -1.79
CS-217ENST00000550044 KRTAP12-2P59991 146 aa3.87□□□□□ -1.79
CS-217ENST00000550044 RPS28P62857 69 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
CS-217ENST00000550044 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.86□□□□□ -1.79
CS-217ENST00000550044 A0A1B0GU69 56 aa3.85□□□□□ -1.79
CS-217ENST00000550044 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
CS-217ENST00000550044 LCE3AQ5TA76 89 aa3.82□□□□□ -1.8
CS-217ENST00000550044 TMEM258P61165 79 aa3.79□□□□□ -1.8
CS-217ENST00000550044 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.78□□□□□ -1.8
CS-217ENST00000550044 KRTAP12-1P59990 96 aa3.77□□□□□ -1.81
CS-217ENST00000550044 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.77□□□□□ -1.81
CS-217ENST00000550044 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.76□□□□□ -1.81
CS-217ENST00000550044 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-217ENST00000550044 PRR15LQ9BU68 103 aa3.74□□□□□ -1.81
CS-217ENST00000550044 UQCR11O14957 56 aa3.63□□□□□ -1.83
CS-217ENST00000550044 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.63□□□□□ -1.83
CS-217ENST00000550044 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.61□□□□□ -1.83
CS-217ENST00000550044 MT4P47944 62 aa3.59□□□□□ -1.83
CS-217ENST00000550044 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.59□□□□□ -1.83
CS-217ENST00000550044 MIR22HGQ0VDD5 57 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-217ENST00000550044 BRK1Q8WUW1 75 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-217ENST00000550044 TNP1P09430 55 aa3.56□□□□□ -1.84
CS-217ENST00000550044 Q1T7F1 81 aa3.56□□□□□ -1.84
CS-217ENST00000550044 MT1EP04732 61 aa3.55□□□□□ -1.84
CS-217ENST00000550044 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.55□□□□□ -1.84
CS-217ENST00000550044 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.54□□□□□ -1.84
CS-217ENST00000550044 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.5□□□□□ -1.85
CS-217ENST00000550044 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.5□□□□□ -1.85
CS-217ENST00000550044 KRTAP5-8O75690 187 aa3.49□□□□□ -1.85
CS-217ENST00000550044 ROMO1P60602 79 aa3.45□□□□□ -1.86
CS-217ENST00000550044 MT1GP13640 62 aa3.43□□□□□ -1.86
CS-217ENST00000550044 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.43□□□□□ -1.86
CS-217ENST00000550044 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
CS-217ENST00000550044 MT1LQ93083 61 aa3.42□□□□□ -1.86
CS-217ENST00000550044 PP632Q6XCG6 107 aa3.39□□□□□ -1.87
CS-217ENST00000550044 KRTAP12-3P60328 96 aa3.38□□□□□ -1.87
CS-217ENST00000550044 LCE1CQ5T751 118 aa3.38□□□□□ -1.87
CS-217ENST00000550044 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.38□□□□□ -1.87
CS-217ENST00000550044 MT1MQ8N339 61 aa3.38□□□□□ -1.87
CS-217ENST00000550044 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.3□□□□□ -1.88
CS-217ENST00000550044 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
CS-217ENST00000550044 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.23□□□□□ -1.89
CS-217ENST00000550044 MUC5ACP98088 5654 aa3.19□□□□□ -1.9
CS-217ENST00000550044 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.9
CS-217ENST00000550044 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.92
CS-217ENST00000550044 KRTAP12-4P60329 112 aa3.07□□□□□ -1.92
CS-217ENST00000550044 INE1O15225 51 aa2.98□□□□□ -1.93
CS-217ENST00000550044 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.95□□□□□ -1.94
CS-217ENST00000550044 MT1AP04731 61 aa2.9□□□□□ -1.95
CS-217ENST00000550044 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.9□□□□□ -1.95
CS-217ENST00000550044 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.82□□□□□ -1.96
CS-217ENST00000550044 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.75□□□□□ -1.97
CS-217ENST00000550044 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.43□□□□□ -2.02
CS-217ENST00000550044 PHGR1C9JFL3 82 aa2.16□□□□□ -2.06
CS-217ENST00000550044 PRM1P04553 51 aa1.69□□□□□ -2.14
CS-217ENST00000550044 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.63□□□□□ -2.15
CS-217ENST00000550044 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.29□□□□□ -2.2
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