RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 A0A0A0MQY5 61 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-215ENST00000549143 LCE3BQ5TA77 95 aa3.02□□□□□ -1.93
CS-215ENST00000549143 MT1EP04732 61 aa3.02□□□□□ -1.93
CS-215ENST00000549143 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.01□□□□□ -1.93
CS-215ENST00000549143 SPRR2FQ96RM1 72 aa3□□□□□ -1.93
CS-215ENST00000549143 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.98□□□□□ -1.93
CS-215ENST00000549143 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.98□□□□□ -1.93
CS-215ENST00000549143 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
CS-215ENST00000549143 MT1LQ93083 61 aa2.97□□□□□ -1.93
CS-215ENST00000549143 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa2.97□□□□□ -1.93
CS-215ENST00000549143 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.97□□□□□ -1.93
CS-215ENST00000549143 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.94□□□□□ -1.94
CS-215ENST00000549143 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa2.94□□□□□ -1.94
CS-215ENST00000549143 LCE4AQ5TA78 99 aa2.92□□□□□ -1.94
CS-215ENST00000549143 MDN1Q9NU22 5596 aa2.92□□□□□ -1.94
CS-215ENST00000549143 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.89□□□□□ -1.95
CS-215ENST00000549143 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa2.89□□□□□ -1.95
CS-215ENST00000549143 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa2.88□□□□□ -1.95
CS-215ENST00000549143 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.87□□□□□ -1.95
CS-215ENST00000549143 MT1GP13640 62 aa2.86□□□□□ -1.95
CS-215ENST00000549143 MT1MQ8N339 61 aa2.84□□□□□ -1.95
CS-215ENST00000549143 LCE5AQ5TCM9 118 aa2.82□□□□□ -1.96
CS-215ENST00000549143 KRTAP5-9P26371 169 aa2.81□□□□□ -1.96
CS-215ENST00000549143 LCE1DQ5T752 114 aa2.81□□□□□ -1.96
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CS-215ENST00000549143 SPRR2BP35325 72 aa2.79□□□□□ -1.96
CS-215ENST00000549143 SPRR2AP35326 72 aa2.79□□□□□ -1.96
CS-215ENST00000549143 LCE1AQ5T7P2 110 aa2.79□□□□□ -1.96
CS-215ENST00000549143 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.77□□□□□ -1.97
CS-215ENST00000549143 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa2.76□□□□□ -1.97
CS-215ENST00000549143 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.75□□□□□ -1.97
CS-215ENST00000549143 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa2.73□□□□□ -1.97
CS-215ENST00000549143 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
CS-215ENST00000549143 SPRR2DP22532 72 aa2.68□□□□□ -1.98
CS-215ENST00000549143 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.6□□□□□ -1.99
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CS-215ENST00000549143 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa2.59□□□□□ -1.99
CS-215ENST00000549143 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa2.59□□□□□ -1.99
CS-215ENST00000549143 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.56□□□□□ -2
CS-215ENST00000549143 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.54□□□□□ -2
CS-215ENST00000549143 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
CS-215ENST00000549143 MT1AP04731 61 aa2.49□□□□□ -2.01
CS-215ENST00000549143 INE1O15225 51 aa2.44□□□□□ -2.02
CS-215ENST00000549143 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa2.44□□□□□ -2.02
CS-215ENST00000549143 MT4P47944 62 aa2.4□□□□□ -2.03
CS-215ENST00000549143 KRTAP12-4P60329 112 aa2.37□□□□□ -2.03
CS-215ENST00000549143 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa2.36□□□□□ -2.03
CS-215ENST00000549143 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.34□□□□□ -2.03
CS-215ENST00000549143 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.34□□□□□ -2.03
CS-215ENST00000549143 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.29□□□□□ -2.04
CS-215ENST00000549143 MT3P25713 68 aa2.27□□□□□ -2.05
CS-215ENST00000549143 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.27□□□□□ -2.05
CS-215ENST00000549143 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.24□□□□□ -2.05
CS-215ENST00000549143 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.2□□□□□ -2.06
CS-215ENST00000549143 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.13□□□□□ -2.07
CS-215ENST00000549143 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.09□□□□□ -2.07
CS-215ENST00000549143 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
CS-215ENST00000549143 PRM1P04553 51 aa1.99□□□□□ -2.09
CS-215ENST00000549143 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.96□□□□□ -2.1
CS-215ENST00000549143 LCE1BQ5T7P3 118 aa1.95□□□□□ -2.1
CS-215ENST00000549143 LCE1FQ5T754 118 aa1.94□□□□□ -2.1
CS-215ENST00000549143 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa1.9□□□□□ -2.1
CS-215ENST00000549143 LCE1EQ5T753 118 aa1.9□□□□□ -2.11
CS-215ENST00000549143 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa1.9□□□□□ -2.11
CS-215ENST00000549143 MUC5ACP98088 5654 aa1.88□□□□□ -2.11
CS-215ENST00000549143 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa1.88□□□□□ -2.11
CS-215ENST00000549143 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.87□□□□□ -2.11
CS-215ENST00000549143 KRTAP5-8O75690 187 aa1.85□□□□□ -2.11
CS-215ENST00000549143 LCE1CQ5T751 118 aa1.79□□□□□ -2.12
CS-215ENST00000549143 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.74□□□□□ -2.13
CS-215ENST00000549143 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
CS-215ENST00000549143 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.63□□□□□ -2.15
CS-215ENST00000549143 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.62□□□□□ -2.15
CS-215ENST00000549143 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.55□□□□□ -2.16
CS-215ENST00000549143 PHGR1C9JFL3 82 aa1.36□□□□□ -2.19
CS-215ENST00000549143 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.16□□□□□ -2.22
CS-215ENST00000549143 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.81□□□□□ -2.28
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