RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546585.1

CS-203, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,803 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-203ENST00000546585 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
CS-203ENST00000546585 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
CS-203ENST00000546585 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
CS-203ENST00000546585 TNP1P09430 55 aa2.77□□□□□ -1.97
CS-203ENST00000546585 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa2.77□□□□□ -1.97
CS-203ENST00000546585 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
CS-203ENST00000546585 INE1O15225 51 aa2.74□□□□□ -1.97
CS-203ENST00000546585 PP632Q6XCG6 107 aa2.74□□□□□ -1.97
CS-203ENST00000546585 LCE3AQ5TA76 89 aa2.73□□□□□ -1.97
CS-203ENST00000546585 KRTAP10-12P60413 245 aa2.72□□□□□ -1.97
CS-203ENST00000546585 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa2.7□□□□□ -1.98
CS-203ENST00000546585 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.69□□□□□ -1.98
CS-203ENST00000546585 KMT2DO14686 5537 aa2.68□□□□□ -1.98
CS-203ENST00000546585 LCE1AQ5T7P2 110 aa2.65□□□□□ -1.98
CS-203ENST00000546585 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa2.65□□□□□ -1.99
CS-203ENST00000546585 MUC12Q9UKN1 5478 aa2.63□□□□□ -1.99
CS-203ENST00000546585 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-203ENST00000546585 NEBP20929 6669 aa2.59□□□□□ -1.99
CS-203ENST00000546585 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa2.59□□□□□ -1.99
CS-203ENST00000546585 KRTAP12-3P60328 96 aa2.58□□□□□ -2
CS-203ENST00000546585 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa2.58□□□□□ -2
CS-203ENST00000546585 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa2.54□□□□□ -2
CS-203ENST00000546585 MT3P25713 68 aa2.52□□□□□ -2.01
CS-203ENST00000546585 MT1EP04732 61 aa2.5□□□□□ -2.01
CS-203ENST00000546585 MDN1Q9NU22 5596 aa2.47□□□□□ -2.01
CS-203ENST00000546585 KRTAP5-9P26371 169 aa2.47□□□□□ -2.01
CS-203ENST00000546585 MT1LQ93083 61 aa2.47□□□□□ -2.01
CS-203ENST00000546585 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.44□□□□□ -2.02
CS-203ENST00000546585 SPRR2FQ96RM1 72 aa2.44□□□□□ -2.02
CS-203ENST00000546585 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.42□□□□□ -2.02
CS-203ENST00000546585 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa2.42□□□□□ -2.02
CS-203ENST00000546585 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa2.41□□□□□ -2.02
CS-203ENST00000546585 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa2.41□□□□□ -2.02
CS-203ENST00000546585 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa2.38□□□□□ -2.03
CS-203ENST00000546585 MT1GP13640 62 aa2.37□□□□□ -2.03
CS-203ENST00000546585 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
CS-203ENST00000546585 MT1MQ8N339 61 aa2.35□□□□□ -2.03
CS-203ENST00000546585 SPRR2EP22531 72 aa2.34□□□□□ -2.03
CS-203ENST00000546585 SPRR2BP35325 72 aa2.34□□□□□ -2.03
CS-203ENST00000546585 SPRR2AP35326 72 aa2.34□□□□□ -2.03
CS-203ENST00000546585 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.34□□□□□ -2.03
CS-203ENST00000546585 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa2.33□□□□□ -2.04
CS-203ENST00000546585 LCE1FQ5T754 118 aa2.31□□□□□ -2.04
CS-203ENST00000546585 SPRR2DP22532 72 aa2.26□□□□□ -2.05
CS-203ENST00000546585 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
CS-203ENST00000546585 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.18□□□□□ -2.06
CS-203ENST00000546585 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.17□□□□□ -2.06
CS-203ENST00000546585 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.09□□□□□ -2.08
CS-203ENST00000546585 MT1AP04731 61 aa2.07□□□□□ -2.08
CS-203ENST00000546585 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.05□□□□□ -2.08
CS-203ENST00000546585 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.03□□□□□ -2.08
CS-203ENST00000546585 MT4P47944 62 aa2.03□□□□□ -2.09
CS-203ENST00000546585 LCE1EQ5T753 118 aa2.02□□□□□ -2.09
CS-203ENST00000546585 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
CS-203ENST00000546585 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2□□□□□ -2.09
CS-203ENST00000546585 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.98□□□□□ -2.09
CS-203ENST00000546585 KRTAP12-4P60329 112 aa1.96□□□□□ -2.1
CS-203ENST00000546585 LCE3EQ5T5B0 92 aa1.96□□□□□ -2.1
CS-203ENST00000546585 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.95□□□□□ -2.1
CS-203ENST00000546585 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa1.94□□□□□ -2.1
CS-203ENST00000546585 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.91□□□□□ -2.1
CS-203ENST00000546585 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa1.9□□□□□ -2.11
CS-203ENST00000546585 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa1.88□□□□□ -2.11
CS-203ENST00000546585 KRTAP5-2Q701N4 177 aa1.85□□□□□ -2.11
CS-203ENST00000546585 KRTAP5-8O75690 187 aa1.82□□□□□ -2.12
CS-203ENST00000546585 LCE3DQ9BYE3 92 aa1.82□□□□□ -2.12
CS-203ENST00000546585 OBSCNQ5VST9 7968 aa1.76□□□□□ -2.13
CS-203ENST00000546585 PRM1P04553 51 aa1.67□□□□□ -2.14
CS-203ENST00000546585 MUC5ACP98088 5654 aa1.67□□□□□ -2.14
CS-203ENST00000546585 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.66□□□□□ -2.14
CS-203ENST00000546585 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.64□□□□□ -2.15
CS-203ENST00000546585 LCE1CQ5T751 118 aa1.53□□□□□ -2.16
CS-203ENST00000546585 LCE1BQ5T7P3 118 aa1.53□□□□□ -2.16
CS-203ENST00000546585 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.39□□□□□ -2.19
CS-203ENST00000546585 PHGR1C9JFL3 82 aa1.17□□□□□ -2.22
CS-203ENST00000546585 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.12□□□□□ -2.23
CS-203ENST00000546585 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.1□□□□□ -2.23
CS-203ENST00000546585 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.73□□□□□ -2.29
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