RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544999.2

HOXD8-204, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,235 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-204ENST00000544999 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
HOXD8-204ENST00000544999 A8MU10 97 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-204ENST00000544999 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.26□□□□□ -1.41
HOXD8-204ENST00000544999 PRR15LQ9BU68 103 aa6.24□□□□□ -1.41
HOXD8-204ENST00000544999 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.2□□□□□ -1.42
HOXD8-204ENST00000544999 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.18□□□□□ -1.42
HOXD8-204ENST00000544999 TMEM258P61165 79 aa6.13□□□□□ -1.43
HOXD8-204ENST00000544999 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.13□□□□□ -1.43
HOXD8-204ENST00000544999 TNP1P09430 55 aa6.12□□□□□ -1.43
HOXD8-204ENST00000544999 MT1GP13640 62 aa6.11□□□□□ -1.43
HOXD8-204ENST00000544999 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
HOXD8-204ENST00000544999 LCE3AQ5TA76 89 aa6.07□□□□□ -1.44
HOXD8-204ENST00000544999 PP632Q6XCG6 107 aa6.07□□□□□ -1.44
HOXD8-204ENST00000544999 UQCR11O14957 56 aa6.03□□□□□ -1.44
HOXD8-204ENST00000544999 MT1LQ93083 61 aa6.03□□□□□ -1.44
HOXD8-204ENST00000544999 MT1MQ8N339 61 aa6□□□□□ -1.45
HOXD8-204ENST00000544999 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-204ENST00000544999 KRTAP12-3P60328 96 aa5.84□□□□□ -1.47
HOXD8-204ENST00000544999 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.83□□□□□ -1.48
HOXD8-204ENST00000544999 V9GYY9 64 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-204ENST00000544999 K7ERS5 55 aa5.78□□□□□ -1.48
HOXD8-204ENST00000544999 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.78□□□□□ -1.48
HOXD8-204ENST00000544999 Q1T7F1 81 aa5.76□□□□□ -1.49
HOXD8-204ENST00000544999 PSPHP1O15172 72 aa5.75□□□□□ -1.49
HOXD8-204ENST00000544999 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.74□□□□□ -1.49
HOXD8-204ENST00000544999 MT4P47944 62 aa5.73□□□□□ -1.49
HOXD8-204ENST00000544999 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.72□□□□□ -1.49
HOXD8-204ENST00000544999 A0A0A0MQY5 61 aa5.71□□□□□ -1.5
HOXD8-204ENST00000544999 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.61□□□□□ -1.51
HOXD8-204ENST00000544999 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
HOXD8-204ENST00000544999 A6NED7 52 aa5.57□□□□□ -1.52
HOXD8-204ENST00000544999 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa5.56□□□□□ -1.52
HOXD8-204ENST00000544999 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
HOXD8-204ENST00000544999 PRO0628Q9UI54 55 aa5.49□□□□□ -1.53
HOXD8-204ENST00000544999 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.47□□□□□ -1.53
HOXD8-204ENST00000544999 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
HOXD8-204ENST00000544999 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.41□□□□□ -1.54
HOXD8-204ENST00000544999 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.4□□□□□ -1.54
HOXD8-204ENST00000544999 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXD8-204ENST00000544999 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.38□□□□□ -1.55
HOXD8-204ENST00000544999 ROMO1P60602 79 aa5.38□□□□□ -1.55
HOXD8-204ENST00000544999 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.38□□□□□ -1.55
HOXD8-204ENST00000544999 KRTAP12-4P60329 112 aa5.36□□□□□ -1.55
HOXD8-204ENST00000544999 LCE1EQ5T753 118 aa5.32□□□□□ -1.56
HOXD8-204ENST00000544999 PMAIP1Q13794 54 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-204ENST00000544999 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
HOXD8-204ENST00000544999 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.19□□□□□ -1.58
HOXD8-204ENST00000544999 MT1AP04731 61 aa5.14□□□□□ -1.59
HOXD8-204ENST00000544999 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.1□□□□□ -1.59
HOXD8-204ENST00000544999 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.06□□□□□ -1.6
HOXD8-204ENST00000544999 MT3P25713 68 aa5.05□□□□□ -1.6
HOXD8-204ENST00000544999 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.02□□□□□ -1.61
HOXD8-204ENST00000544999 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.9□□□□□ -1.63
HOXD8-204ENST00000544999 BRK1Q8WUW1 75 aa4.89□□□□□ -1.63
HOXD8-204ENST00000544999 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.87□□□□□ -1.63
HOXD8-204ENST00000544999 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.85□□□□□ -1.63
HOXD8-204ENST00000544999 KRTAP5-8O75690 187 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXD8-204ENST00000544999 PRAC1Q96KF2 57 aa4.74□□□□□ -1.65
HOXD8-204ENST00000544999 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.67□□□□□ -1.66
HOXD8-204ENST00000544999 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.59□□□□□ -1.67
HOXD8-204ENST00000544999 LCE1FQ5T754 118 aa4.52□□□□□ -1.69
HOXD8-204ENST00000544999 LUZP6Q538Z0 58 aa4.5□□□□□ -1.69
HOXD8-204ENST00000544999 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
HOXD8-204ENST00000544999 MUC5ACP98088 5654 aa4.39□□□□□ -1.71
HOXD8-204ENST00000544999 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
HOXD8-204ENST00000544999 NDUFAF8A1L188 74 aa4.06□□□□□ -1.76
HOXD8-204ENST00000544999 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.04□□□□□ -1.76
HOXD8-204ENST00000544999 LCE1CQ5T751 118 aa4.01□□□□□ -1.77
HOXD8-204ENST00000544999 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.92□□□□□ -1.78
HOXD8-204ENST00000544999 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.88□□□□□ -1.79
HOXD8-204ENST00000544999 INE1O15225 51 aa3.52□□□□□ -1.85
HOXD8-204ENST00000544999 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.36□□□□□ -1.87
HOXD8-204ENST00000544999 PHGR1C9JFL3 82 aa3.13□□□□□ -1.91
HOXD8-204ENST00000544999 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.9□□□□□ -1.95
HOXD8-204ENST00000544999 PRM1P04553 51 aa2.74□□□□□ -1.97
HOXD8-204ENST00000544999 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.39□□□□□ -2.03
HOXD8-204ENST00000544999 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.08□□□□□ -2.08
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.5 ms