RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542667.5

TM7SF3-211, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 3

Gene TM7SF3, Length 613 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-211ENST00000542667 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.26□□□□□ -1.57
TM7SF3-211ENST00000542667 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.25□□□□□ -1.57
TM7SF3-211ENST00000542667 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
TM7SF3-211ENST00000542667 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.22□□□□□ -1.57
TM7SF3-211ENST00000542667 LCE3AQ5TA76 89 aa5.2□□□□□ -1.58
TM7SF3-211ENST00000542667 LCE4AQ5TA78 99 aa5.17□□□□□ -1.58
TM7SF3-211ENST00000542667 TNP1P09430 55 aa5.16□□□□□ -1.58
TM7SF3-211ENST00000542667 UQCR11O14957 56 aa5.14□□□□□ -1.59
TM7SF3-211ENST00000542667 MT1GP13640 62 aa5.11□□□□□ -1.59
TM7SF3-211ENST00000542667 MT1LQ93083 61 aa5.11□□□□□ -1.59
TM7SF3-211ENST00000542667 MT1MQ8N339 61 aa5.08□□□□□ -1.6
TM7SF3-211ENST00000542667 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.06□□□□□ -1.6
TM7SF3-211ENST00000542667 PSPHP1O15172 72 aa5.05□□□□□ -1.6
TM7SF3-211ENST00000542667 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.05□□□□□ -1.6
TM7SF3-211ENST00000542667 PP632Q6XCG6 107 aa5.04□□□□□ -1.6
TM7SF3-211ENST00000542667 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.01□□□□□ -1.61
TM7SF3-211ENST00000542667 KRTAP12-3P60328 96 aa4.96□□□□□ -1.62
TM7SF3-211ENST00000542667 Q1T7F1 81 aa4.96□□□□□ -1.62
TM7SF3-211ENST00000542667 V9GYY9 64 aa4.93□□□□□ -1.62
TM7SF3-211ENST00000542667 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.92□□□□□ -1.62
TM7SF3-211ENST00000542667 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.89□□□□□ -1.63
TM7SF3-211ENST00000542667 K7ERS5 55 aa4.89□□□□□ -1.63
TM7SF3-211ENST00000542667 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.88□□□□□ -1.63
TM7SF3-211ENST00000542667 MT4P47944 62 aa4.87□□□□□ -1.63
TM7SF3-211ENST00000542667 A6NED7 52 aa4.84□□□□□ -1.63
TM7SF3-211ENST00000542667 PCP4P48539 62 aa4.76□□□□□ -1.65
TM7SF3-211ENST00000542667 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.76□□□□□ -1.65
TM7SF3-211ENST00000542667 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.75□□□□□ -1.65
TM7SF3-211ENST00000542667 RPS28P62857 69 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
TM7SF3-211ENST00000542667 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.67□□□□□ -1.66
TM7SF3-211ENST00000542667 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.64□□□□□ -1.67
TM7SF3-211ENST00000542667 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.64□□□□□ -1.67
TM7SF3-211ENST00000542667 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
TM7SF3-211ENST00000542667 ROMO1P60602 79 aa4.62□□□□□ -1.67
TM7SF3-211ENST00000542667 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.59□□□□□ -1.67
TM7SF3-211ENST00000542667 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.58□□□□□ -1.68
TM7SF3-211ENST00000542667 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.52□□□□□ -1.69
TM7SF3-211ENST00000542667 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
TM7SF3-211ENST00000542667 KRTAP12-4P60329 112 aa4.46□□□□□ -1.7
TM7SF3-211ENST00000542667 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.44□□□□□ -1.7
TM7SF3-211ENST00000542667 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.38□□□□□ -1.71
TM7SF3-211ENST00000542667 H3BS24 57 aa4.38□□□□□ -1.71
TM7SF3-211ENST00000542667 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.35□□□□□ -1.71
TM7SF3-211ENST00000542667 MT1AP04731 61 aa4.32□□□□□ -1.72
TM7SF3-211ENST00000542667 BRK1Q8WUW1 75 aa4.21□□□□□ -1.74
TM7SF3-211ENST00000542667 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.19□□□□□ -1.74
TM7SF3-211ENST00000542667 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
TM7SF3-211ENST00000542667 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.14□□□□□ -1.75
TM7SF3-211ENST00000542667 MUC5ACP98088 5654 aa4.11□□□□□ -1.75
TM7SF3-211ENST00000542667 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
TM7SF3-211ENST00000542667 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.99□□□□□ -1.77
TM7SF3-211ENST00000542667 KRTAP5-8O75690 187 aa3.98□□□□□ -1.77
TM7SF3-211ENST00000542667 MT3P25713 68 aa3.93□□□□□ -1.78
TM7SF3-211ENST00000542667 PMAIP1Q13794 54 aa3.93□□□□□ -1.78
TM7SF3-211ENST00000542667 PRAC1Q96KF2 57 aa3.88□□□□□ -1.79
TM7SF3-211ENST00000542667 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
TM7SF3-211ENST00000542667 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.76□□□□□ -1.81
TM7SF3-211ENST00000542667 SVIPQ8NHG7 77 aa3.61□□□□□ -1.83
TM7SF3-211ENST00000542667 PRO0628Q9UI54 55 aa3.61□□□□□ -1.83
TM7SF3-211ENST00000542667 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.6□□□□□ -1.83
TM7SF3-211ENST00000542667 LCE1EQ5T753 118 aa3.55□□□□□ -1.84
TM7SF3-211ENST00000542667 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-211ENST00000542667 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.46□□□□□ -1.86
TM7SF3-211ENST00000542667 LCE1CQ5T751 118 aa3.32□□□□□ -1.88
TM7SF3-211ENST00000542667 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.3□□□□□ -1.88
TM7SF3-211ENST00000542667 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.18□□□□□ -1.9
TM7SF3-211ENST00000542667 LUZP6Q538Z0 58 aa3.13□□□□□ -1.91
TM7SF3-211ENST00000542667 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.1□□□□□ -1.91
TM7SF3-211ENST00000542667 LCE1FQ5T754 118 aa2.86□□□□□ -1.95
TM7SF3-211ENST00000542667 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.85□□□□□ -1.95
TM7SF3-211ENST00000542667 A0A0A0MQY5 61 aa2.75□□□□□ -1.97
TM7SF3-211ENST00000542667 PHGR1C9JFL3 82 aa2.71□□□□□ -1.98
TM7SF3-211ENST00000542667 NDUFAF8A1L188 74 aa2.6□□□□□ -1.99
TM7SF3-211ENST00000542667 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.45□□□□□ -2.02
TM7SF3-211ENST00000542667 PRM1P04553 51 aa2.41□□□□□ -2.02
TM7SF3-211ENST00000542667 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.03□□□□□ -2.08
TM7SF3-211ENST00000542667 INE1O15225 51 aa1.97□□□□□ -2.09
TM7SF3-211ENST00000542667 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.71□□□□□ -2.14
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.1 ms