RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533860.5

APLP2-222, Transcript of amyloid beta precursor like protein 2, human

TSL 1 (best)

Gene APLP2, Length 1,424 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APLP2-222	ENST00000533860	NDUFAF8	A1L188	74 aa		5.68	□□□□□ -1.5
APLP2-222	ENST00000533860	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		5.66	□□□□□ -1.5
APLP2-222	ENST00000533860		H3BS24	57 aa		5.65	□□□□□ -1.51
APLP2-222	ENST00000533860	LUZP6	Q538Z0	58 aa		5.64	□□□□□ -1.51
APLP2-222	ENST00000533860	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		5.62	□□□□□ -1.51
APLP2-222	ENST00000533860	MT1L	Q93083	61 aa		5.6	□□□□□ -1.51
APLP2-222	ENST00000533860	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		5.52	□□□□□ -1.53
APLP2-222	ENST00000533860	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		5.51	□□□□□ -1.53
APLP2-222	ENST00000533860	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		5.5	□□□□□ -1.53
APLP2-222	ENST00000533860	NEB	P20929	6669 aa		5.48	□□□□□ -1.53
APLP2-222	ENST00000533860	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		5.46	□□□□□ -1.54
APLP2-222	ENST00000533860	SPRR2E	P22531	72 aa		5.45	□□□□□ -1.54
APLP2-222	ENST00000533860	SPRR2B	P35325	72 aa		5.45	□□□□□ -1.54
APLP2-222	ENST00000533860	SPRR2A	P35326	72 aa		5.45	□□□□□ -1.54
APLP2-222	ENST00000533860	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		5.45	□□□□□ -1.54
APLP2-222	ENST00000533860	MT1G	P13640	62 aa		5.44	□□□□□ -1.54
APLP2-222	ENST00000533860	MT1M	Q8N339	61 aa		5.42	□□□□□ -1.54
APLP2-222	ENST00000533860	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		5.4	□□□□□ -1.54
APLP2-222	ENST00000533860	MDN1	Q9NU22	5596 aa		5.4	□□□□□ -1.54
APLP2-222	ENST00000533860	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		5.36	□□□□□ -1.55
APLP2-222	ENST00000533860	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.34	□□□□□ -1.55
APLP2-222	ENST00000533860	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		5.31	□□□□□ -1.56
APLP2-222	ENST00000533860	LCE3B	Q5TA77	95 aa		5.26	□□□□□ -1.57
APLP2-222	ENST00000533860	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		5.26	□□□□□ -1.57
APLP2-222	ENST00000533860	SPRR2D	P22532	72 aa		5.25	□□□□□ -1.57
APLP2-222	ENST00000533860		A0A0A0MQY5	61 aa		5.21	□□□□□ -1.58
APLP2-222	ENST00000533860	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		5.19	□□□□□ -1.58
APLP2-222	ENST00000533860	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		5.16	□□□□□ -1.58
APLP2-222	ENST00000533860	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		5.16	□□□□□ -1.58
APLP2-222	ENST00000533860	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
APLP2-222	ENST00000533860	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		4.99	□□□□□ -1.61
APLP2-222	ENST00000533860	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		4.96	□□□□□ -1.62
APLP2-222	ENST00000533860	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		4.96	□□□□□ -1.62
APLP2-222	ENST00000533860	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
APLP2-222	ENST00000533860	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
APLP2-222	ENST00000533860	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.84	□□□□□ -1.63
APLP2-222	ENST00000533860	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		4.84	□□□□□ -1.63
APLP2-222	ENST00000533860	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.81	□□□□□ -1.64
APLP2-222	ENST00000533860	INE1	O15225	51 aa		4.79	□□□□□ -1.64
APLP2-222	ENST00000533860	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.77	□□□□□ -1.65
APLP2-222	ENST00000533860	MT1A	P04731	61 aa		4.75	□□□□□ -1.65
APLP2-222	ENST00000533860	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.75	□□□□□ -1.65
APLP2-222	ENST00000533860	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.74	□□□□□ -1.65
APLP2-222	ENST00000533860	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
APLP2-222	ENST00000533860	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.68	□□□□□ -1.66
APLP2-222	ENST00000533860	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.6	□□□□□ -1.67
APLP2-222	ENST00000533860	MT4	P47944	62 aa		4.58	□□□□□ -1.68
APLP2-222	ENST00000533860	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.5	□□□□□ -1.69
APLP2-222	ENST00000533860	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.44	□□□□□ -1.7
APLP2-222	ENST00000533860	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		4.42	□□□□□ -1.7
APLP2-222	ENST00000533860	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.37	□□□□□ -1.71
APLP2-222	ENST00000533860	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		4.33	□□□□□ -1.72
APLP2-222	ENST00000533860	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.3	□□□□□ -1.72
APLP2-222	ENST00000533860	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.29	□□□□□ -1.72
APLP2-222	ENST00000533860	MT3	P25713	68 aa		4.28	□□□□□ -1.72
APLP2-222	ENST00000533860	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		4.19	□□□□□ -1.74
APLP2-222	ENST00000533860	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		4.09	□□□□□ -1.75
APLP2-222	ENST00000533860	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		4.02	□□□□□ -1.77
APLP2-222	ENST00000533860	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.01	□□□□□ -1.77
APLP2-222	ENST00000533860	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.89	□□□□□ -1.79
APLP2-222	ENST00000533860	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
APLP2-222	ENST00000533860	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.76	□□□□□ -1.81
APLP2-222	ENST00000533860	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.74	□□□□□ -1.81
APLP2-222	ENST00000533860	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.73	□□□□□ -1.81
APLP2-222	ENST00000533860	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.66	□□□□□ -1.82
APLP2-222	ENST00000533860	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
APLP2-222	ENST00000533860	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.54	□□□□□ -1.84
APLP2-222	ENST00000533860	PRM1	P04553	51 aa		3.51	□□□□□ -1.85
APLP2-222	ENST00000533860	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APLP2-222	ENST00000533860	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.27	□□□□□ -1.89
APLP2-222	ENST00000533860	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.12	□□□□□ -1.91
APLP2-222	ENST00000533860	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.1	□□□□□ -1.91
APLP2-222	ENST00000533860	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.8	□□□□□ -1.96
APLP2-222	ENST00000533860	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.8	□□□□□ -1.96
APLP2-222	ENST00000533860	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.67	□□□□□ -1.98
APLP2-222	ENST00000533860	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.39	□□□□□ -2.03
APLP2-222	ENST00000533860	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.21	□□□□□ -2.06
APLP2-222	ENST00000533860	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.77	□□□□□ -2.13

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