RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531691.5

TXNRD1-223, Transcript of thioredoxin reductase 1, human

TSL 2

Gene TXNRD1, Length 728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TXNRD1-223	ENST00000531691		A0A0A0MQY5	61 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TXNRD1-223	ENST00000531691	MT1E	P04732	61 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TXNRD1-223	ENST00000531691	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TXNRD1-223	ENST00000531691	CHKB-CPT1B	H3BT56	60 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TXNRD1-223	ENST00000531691	PP632	Q6XCG6	107 aa		4.12	□□□□□ -1.75
TXNRD1-223	ENST00000531691	MT1G	P13640	62 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TXNRD1-223	ENST00000531691	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TXNRD1-223	ENST00000531691	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TXNRD1-223	ENST00000531691	PRR15L	Q9BU68	103 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TXNRD1-223	ENST00000531691	PSPHP1	O15172	72 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TXNRD1-223	ENST00000531691	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TXNRD1-223	ENST00000531691	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TXNRD1-223	ENST00000531691		A0A1B0GU69	56 aa		4	□□□□□ -1.77
TXNRD1-223	ENST00000531691	MT1M	Q8N339	61 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TXNRD1-223	ENST00000531691	SEC61G	P60059	68 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TXNRD1-223	ENST00000531691	BRK1	Q8WUW1	75 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TXNRD1-223	ENST00000531691		A6NED7	52 aa		3.96	□□□□□ -1.78
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		3.96	□□□□□ -1.78
TXNRD1-223	ENST00000531691	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		3.96	□□□□□ -1.78
TXNRD1-223	ENST00000531691	UQCR11	O14957	56 aa		3.93	□□□□□ -1.78
TXNRD1-223	ENST00000531691		A0A0D9SG42	100 aa		3.92	□□□□□ -1.78
TXNRD1-223	ENST00000531691	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TXNRD1-223	ENST00000531691	MT1L	Q93083	61 aa		3.9	□□□□□ -1.79
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		3.89	□□□□□ -1.79
TXNRD1-223	ENST00000531691	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TXNRD1-223	ENST00000531691		A0A1B0GU33	70 aa		3.86	□□□□□ -1.79
TXNRD1-223	ENST00000531691	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		3.86	□□□□□ -1.79
TXNRD1-223	ENST00000531691		A8MU10	97 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRTAP12-4	P60329	112 aa		3.8	□□□□□ -1.8
TXNRD1-223	ENST00000531691	PMAIP1	Q13794	54 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
TXNRD1-223	ENST00000531691	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TXNRD1-223	ENST00000531691	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
TXNRD1-223	ENST00000531691		K7ERS5	55 aa		3.72	□□□□□ -1.81
TXNRD1-223	ENST00000531691	MT3	P25713	68 aa		3.72	□□□□□ -1.81
TXNRD1-223	ENST00000531691	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.71	□□□□□ -1.82
TXNRD1-223	ENST00000531691	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		3.7	□□□□□ -1.82
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	3.69	□□□□□ -1.82
TXNRD1-223	ENST00000531691	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		3.69	□□□□□ -1.82
TXNRD1-223	ENST00000531691	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		3.68	□□□□□ -1.82
TXNRD1-223	ENST00000531691	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
TXNRD1-223	ENST00000531691	LCE3A	Q5TA76	89 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRTAP12-1	P59990	96 aa		3.6	□□□□□ -1.83
TXNRD1-223	ENST00000531691	TNP1	P09430	55 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TXNRD1-223	ENST00000531691	ROMO1	P60602	79 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRTAP12-3	P60328	96 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TXNRD1-223	ENST00000531691	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TXNRD1-223	ENST00000531691	PRAC1	Q96KF2	57 aa		3.46	□□□□□ -1.86
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		3.45	□□□□□ -1.86
TXNRD1-223	ENST00000531691	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TXNRD1-223	ENST00000531691	MT1A	P04731	61 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		3.31	□□□□□ -1.88
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TXNRD1-223	ENST00000531691	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.26	□□□□□ -1.89
TXNRD1-223	ENST00000531691	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		3.21	□□□□□ -1.9
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TXNRD1-223	ENST00000531691	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TXNRD1-223	ENST00000531691	LUZP6	Q538Z0	58 aa		2.89	□□□□□ -1.95
TXNRD1-223	ENST00000531691	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TXNRD1-223	ENST00000531691	LCE1C	Q5T751	118 aa		2.72	□□□□□ -1.97
TXNRD1-223	ENST00000531691	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.54	□□□□□ -2
TXNRD1-223	ENST00000531691	INE1	O15225	51 aa		2.44	□□□□□ -2.02
TXNRD1-223	ENST00000531691	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		2.38	□□□□□ -2.03
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.18	□□□□□ -2.06
TXNRD1-223	ENST00000531691	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.18	□□□□□ -2.06
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.96	□□□□□ -2.1
TXNRD1-223	ENST00000531691	PRM1	P04553	51 aa		1.82	□□□□□ -2.12
TXNRD1-223	ENST00000531691	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.47	□□□□□ -2.17

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