RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526080.1

PTPRU-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 424 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-209ENST00000526080 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRU-209ENST00000526080 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRU-209ENST00000526080 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRU-209ENST00000526080 LCE3AQ5TA76 89 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRU-209ENST00000526080 COA5Q86WW8 74 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRU-209ENST00000526080 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP12-4P60329 112 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRU-209ENST00000526080 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRU-209ENST00000526080 MUC5ACP98088 5654 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP12-1P59990 96 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRU-209ENST00000526080 SERP1Q9Y6X1 66 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRU-209ENST00000526080 SPATA8Q6RVD6 105 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRU-209ENST00000526080 SEC61GP60059 68 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRU-209ENST00000526080 RPS28P62857 69 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
PTPRU-209ENST00000526080 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRU-209ENST00000526080 TNP1P09430 55 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP12-3P60328 96 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRU-209ENST00000526080 SMIM26A0A096LP01 95 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRU-209ENST00000526080 PRR15LQ9BU68 103 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRU-209ENST00000526080 V9GYY9 64 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRU-209ENST00000526080 A0A1B0GU69 56 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRU-209ENST00000526080 A0A1B0GU33 70 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP5-8O75690 187 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRU-209ENST00000526080 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRU-209ENST00000526080 Q1T7F1 81 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRU-209ENST00000526080 A8MU10 97 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRU-209ENST00000526080 PSPHP1O15172 72 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRU-209ENST00000526080 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRU-209ENST00000526080 UQCR11O14957 56 aa4.2□□□□□ -1.74
PTPRU-209ENST00000526080 A6NED7 52 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRU-209ENST00000526080 MT1AP04731 61 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRU-209ENST00000526080 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRU-209ENST00000526080 K7ERS5 55 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRU-209ENST00000526080 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRU-209ENST00000526080 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRU-209ENST00000526080 BRK1Q8WUW1 75 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRU-209ENST00000526080 PRO0628Q9UI54 55 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRU-209ENST00000526080 MT3P25713 68 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRU-209ENST00000526080 ROMO1P60602 79 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRU-209ENST00000526080 PMAIP1Q13794 54 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRU-209ENST00000526080 LCE1EQ5T753 118 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRU-209ENST00000526080 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRU-209ENST00000526080 PRAC1Q96KF2 57 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRU-209ENST00000526080 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRU-209ENST00000526080 SVIPQ8NHG7 77 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRU-209ENST00000526080 LCE1CQ5T751 118 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRU-209ENST00000526080 LCE1FQ5T754 118 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
PTPRU-209ENST00000526080 PHGR1C9JFL3 82 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRU-209ENST00000526080 LUZP6Q538Z0 58 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRU-209ENST00000526080 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRU-209ENST00000526080 NDUFAF8A1L188 74 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRU-209ENST00000526080 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.55□□□□□ -2
PTPRU-209ENST00000526080 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.51□□□□□ -2.01
PTPRU-209ENST00000526080 A0A0A0MQY5 61 aa2.43□□□□□ -2.02
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRU-209ENST00000526080 INE1O15225 51 aa2.28□□□□□ -2.04
PTPRU-209ENST00000526080 H3BS24 57 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRU-209ENST00000526080 PRM1P04553 51 aa1.93□□□□□ -2.1
PTPRU-209ENST00000526080 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.78□□□□□ -2.12
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