RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP12-3P60328 96 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRK-218ENST00000525459 PP632Q6XCG6 107 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRK-218ENST00000525459 SPRR2DP22532 72 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-218ENST00000525459 PRO0628Q9UI54 55 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-218ENST00000525459 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-218ENST00000525459 MT1GP13640 62 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-218ENST00000525459 MT1LQ93083 61 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-218ENST00000525459 PMAIP1Q13794 54 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-218ENST00000525459 H3BS24 57 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRK-218ENST00000525459 MT1MQ8N339 61 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRK-218ENST00000525459 LCE3BQ5TA77 95 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRK-218ENST00000525459 A0A0A0MQY5 61 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-218ENST00000525459 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-218ENST00000525459 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-218ENST00000525459 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-218ENST00000525459 PRAC1Q96KF2 57 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-218ENST00000525459 LCE4AQ5TA78 99 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.45
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRK-218ENST00000525459 LCE1DQ5T752 114 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRK-218ENST00000525459 MT4P47944 62 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP12-4P60329 112 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRK-218ENST00000525459 MT1AP04731 61 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRK-218ENST00000525459 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRK-218ENST00000525459 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRK-218ENST00000525459 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.4□□□□□ -1.55
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRK-218ENST00000525459 LUZP6Q538Z0 58 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRK-218ENST00000525459 MT3P25713 68 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRK-218ENST00000525459 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRK-218ENST00000525459 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRK-218ENST00000525459 NDUFAF8A1L188 74 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP5-8O75690 187 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-218ENST00000525459 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRK-218ENST00000525459 LCE1EQ5T753 118 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRK-218ENST00000525459 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-218ENST00000525459 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRK-218ENST00000525459 MUC5ACP98088 5654 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRK-218ENST00000525459 LCE1CQ5T751 118 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRK-218ENST00000525459 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRK-218ENST00000525459 INE1O15225 51 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRK-218ENST00000525459 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
PTPRK-218ENST00000525459 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRK-218ENST00000525459 LCE1FQ5T754 118 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRK-218ENST00000525459 PRM1P04553 51 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRK-218ENST00000525459 PHGR1C9JFL3 82 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRK-218ENST00000525459 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRK-218ENST00000525459 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRK-218ENST00000525459 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.03□□□□□ -2.08
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms