RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515697.5

FAM200B-222, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, human

TSL 3

Gene FAM200B, Length 607 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM200B-222	ENST00000515697	LCE3A	Q5TA76	89 aa		7.16	□□□□□ -1.26
FAM200B-222	ENST00000515697	TNP1	P09430	55 aa		7.11	□□□□□ -1.27
FAM200B-222	ENST00000515697	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
FAM200B-222	ENST00000515697	LCE1D	Q5T752	114 aa		7.06	□□□□□ -1.28
FAM200B-222	ENST00000515697	PRR15L	Q9BU68	103 aa		7.06	□□□□□ -1.28
FAM200B-222	ENST00000515697	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		7.05	□□□□□ -1.28
FAM200B-222	ENST00000515697	LCE4A	Q5TA78	99 aa		7.03	□□□□□ -1.28
FAM200B-222	ENST00000515697	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FAM200B-222	ENST00000515697	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		7.02	□□□□□ -1.29
FAM200B-222	ENST00000515697	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		7	□□□□□ -1.29
FAM200B-222	ENST00000515697	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		6.95	□□□□□ -1.3
FAM200B-222	ENST00000515697	MT4	P47944	62 aa		6.93	□□□□□ -1.3
FAM200B-222	ENST00000515697	KRTAP12-3	P60328	96 aa		6.88	□□□□□ -1.31
FAM200B-222	ENST00000515697	TMEM258	P61165	79 aa		6.87	□□□□□ -1.31
FAM200B-222	ENST00000515697	UQCR11	O14957	56 aa		6.85	□□□□□ -1.31
FAM200B-222	ENST00000515697	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		6.81	□□□□□ -1.32
FAM200B-222	ENST00000515697	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		6.8	□□□□□ -1.32
FAM200B-222	ENST00000515697	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		6.71	□□□□□ -1.34
FAM200B-222	ENST00000515697	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		6.7	□□□□□ -1.34
FAM200B-222	ENST00000515697	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		6.7	□□□□□ -1.34
FAM200B-222	ENST00000515697	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		6.69	□□□□□ -1.34
FAM200B-222	ENST00000515697	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
FAM200B-222	ENST00000515697	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FAM200B-222	ENST00000515697	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		6.58	□□□□□ -1.36
FAM200B-222	ENST00000515697	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FAM200B-222	ENST00000515697		K7ERS5	55 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FAM200B-222	ENST00000515697	PSPHP1	O15172	72 aa		6.5	□□□□□ -1.37
FAM200B-222	ENST00000515697		Q1T7F1	81 aa		6.5	□□□□□ -1.37
FAM200B-222	ENST00000515697		V9GYY9	64 aa		6.5	□□□□□ -1.37
FAM200B-222	ENST00000515697	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FAM200B-222	ENST00000515697	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		6.48	□□□□□ -1.37
FAM200B-222	ENST00000515697	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FAM200B-222	ENST00000515697	KRTAP12-4	P60329	112 aa		6.4	□□□□□ -1.38
FAM200B-222	ENST00000515697	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		6.4	□□□□□ -1.38
FAM200B-222	ENST00000515697	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	6.39	□□□□□ -1.39
FAM200B-222	ENST00000515697	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		6.34	□□□□□ -1.39
FAM200B-222	ENST00000515697		A6NED7	52 aa		6.25	□□□□□ -1.41
FAM200B-222	ENST00000515697	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		6.2	□□□□□ -1.42
FAM200B-222	ENST00000515697	MT1A	P04731	61 aa		6.12	□□□□□ -1.43
FAM200B-222	ENST00000515697	ROMO1	P60602	79 aa		6.12	□□□□□ -1.43
FAM200B-222	ENST00000515697	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		6.1	□□□□□ -1.43
FAM200B-222	ENST00000515697	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		6.09	□□□□□ -1.43
FAM200B-222	ENST00000515697	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		6.04	□□□□□ -1.44
FAM200B-222	ENST00000515697	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
FAM200B-222	ENST00000515697	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
FAM200B-222	ENST00000515697	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		5.83	□□□□□ -1.48
FAM200B-222	ENST00000515697	KRTAP5-8	O75690	187 aa		5.8	□□□□□ -1.48
FAM200B-222	ENST00000515697	MUC5AC	P98088	5654 aa		5.79	□□□□□ -1.48
FAM200B-222	ENST00000515697	PCP4	P48539	62 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FAM200B-222	ENST00000515697	SVIP	Q8NHG7	77 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FAM200B-222	ENST00000515697	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
FAM200B-222	ENST00000515697	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		5.61	□□□□□ -1.51
FAM200B-222	ENST00000515697	MT3	P25713	68 aa		5.57	□□□□□ -1.52
FAM200B-222	ENST00000515697	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		5.46	□□□□□ -1.54
FAM200B-222	ENST00000515697		A0A0A0MQY5	61 aa		5.34	□□□□□ -1.55
FAM200B-222	ENST00000515697	BRK1	Q8WUW1	75 aa		5.2	□□□□□ -1.58
FAM200B-222	ENST00000515697	LCE1E	Q5T753	118 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FAM200B-222	ENST00000515697	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM200B-222	ENST00000515697	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		4.82	□□□□□ -1.64
FAM200B-222	ENST00000515697	LCE1C	Q5T751	118 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAM200B-222	ENST00000515697	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAM200B-222	ENST00000515697	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
FAM200B-222	ENST00000515697	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAM200B-222	ENST00000515697	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.45	□□□□□ -1.7
FAM200B-222	ENST00000515697	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.39	□□□□□ -1.71
FAM200B-222	ENST00000515697	LCE1F	Q5T754	118 aa		4.28	□□□□□ -1.72
FAM200B-222	ENST00000515697	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.25	□□□□□ -1.73
FAM200B-222	ENST00000515697	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		4.24	□□□□□ -1.73
FAM200B-222	ENST00000515697	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.14	□□□□□ -1.75
FAM200B-222	ENST00000515697	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		4.04	□□□□□ -1.76
FAM200B-222	ENST00000515697	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.99	□□□□□ -1.77
FAM200B-222	ENST00000515697	PHGR1	C9JFL3	82 aa		3.98	□□□□□ -1.77
FAM200B-222	ENST00000515697	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.89	□□□□□ -1.79
FAM200B-222	ENST00000515697	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		3.48	□□□□□ -1.85
FAM200B-222	ENST00000515697	PRM1	P04553	51 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FAM200B-222	ENST00000515697	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		3.05	□□□□□ -1.92
FAM200B-222	ENST00000515697	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		2.5	□□□□□ -2.01
FAM200B-222	ENST00000515697	INE1	O15225	51 aa		2.39	□□□□□ -2.03

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