RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514625.1

FAAP20-215, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 703 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-215ENST00000514625 LCE3BQ5TA77 95 aa6.52□□□□□ -1.37
FAAP20-215ENST00000514625 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.52□□□□□ -1.37
FAAP20-215ENST00000514625 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.47□□□□□ -1.37
FAAP20-215ENST00000514625 MT1GP13640 62 aa6.44□□□□□ -1.38
FAAP20-215ENST00000514625 PP632Q6XCG6 107 aa6.42□□□□□ -1.38
FAAP20-215ENST00000514625 MT1LQ93083 61 aa6.38□□□□□ -1.39
FAAP20-215ENST00000514625 KRTAP12-3P60328 96 aa6.35□□□□□ -1.39
FAAP20-215ENST00000514625 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.32□□□□□ -1.4
FAAP20-215ENST00000514625 MT1MQ8N339 61 aa6.3□□□□□ -1.4
FAAP20-215ENST00000514625 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
FAAP20-215ENST00000514625 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.24□□□□□ -1.41
FAAP20-215ENST00000514625 ROMO1P60602 79 aa6.22□□□□□ -1.41
FAAP20-215ENST00000514625 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.12□□□□□ -1.43
FAAP20-215ENST00000514625 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.06□□□□□ -1.44
FAAP20-215ENST00000514625 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.05□□□□□ -1.44
FAAP20-215ENST00000514625 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.02□□□□□ -1.45
FAAP20-215ENST00000514625 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.98□□□□□ -1.45
FAAP20-215ENST00000514625 LCE4AQ5TA78 99 aa5.97□□□□□ -1.45
FAAP20-215ENST00000514625 BRK1Q8WUW1 75 aa5.9□□□□□ -1.46
FAAP20-215ENST00000514625 LCE1DQ5T752 114 aa5.87□□□□□ -1.47
FAAP20-215ENST00000514625 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.86□□□□□ -1.47
FAAP20-215ENST00000514625 MT4P47944 62 aa5.85□□□□□ -1.47
FAAP20-215ENST00000514625 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.85□□□□□ -1.47
FAAP20-215ENST00000514625 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.73□□□□□ -1.49
FAAP20-215ENST00000514625 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
FAAP20-215ENST00000514625 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.72□□□□□ -1.49
FAAP20-215ENST00000514625 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.69□□□□□ -1.5
FAAP20-215ENST00000514625 KRTAP12-4P60329 112 aa5.6□□□□□ -1.51
FAAP20-215ENST00000514625 PMAIP1Q13794 54 aa5.57□□□□□ -1.52
FAAP20-215ENST00000514625 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.55□□□□□ -1.52
FAAP20-215ENST00000514625 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.54□□□□□ -1.52
FAAP20-215ENST00000514625 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.52□□□□□ -1.53
FAAP20-215ENST00000514625 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.47□□□□□ -1.53
FAAP20-215ENST00000514625 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
FAAP20-215ENST00000514625 MT1AP04731 61 aa5.44□□□□□ -1.54
FAAP20-215ENST00000514625 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.41□□□□□ -1.54
FAAP20-215ENST00000514625 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.38□□□□□ -1.55
FAAP20-215ENST00000514625 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.33□□□□□ -1.56
FAAP20-215ENST00000514625 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.32□□□□□ -1.56
FAAP20-215ENST00000514625 PRO0628Q9UI54 55 aa5.32□□□□□ -1.56
FAAP20-215ENST00000514625 PRAC1Q96KF2 57 aa5.27□□□□□ -1.57
FAAP20-215ENST00000514625 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.24□□□□□ -1.57
FAAP20-215ENST00000514625 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.17□□□□□ -1.58
FAAP20-215ENST00000514625 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.11□□□□□ -1.59
FAAP20-215ENST00000514625 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.1□□□□□ -1.59
FAAP20-215ENST00000514625 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.04□□□□□ -1.6
FAAP20-215ENST00000514625 MT3P25713 68 aa5□□□□□ -1.61
FAAP20-215ENST00000514625 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5□□□□□ -1.61
FAAP20-215ENST00000514625 SVIPQ8NHG7 77 aa4.85□□□□□ -1.63
FAAP20-215ENST00000514625 KRTAP5-8O75690 187 aa4.81□□□□□ -1.64
FAAP20-215ENST00000514625 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.71□□□□□ -1.65
FAAP20-215ENST00000514625 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.59□□□□□ -1.67
FAAP20-215ENST00000514625 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.57□□□□□ -1.68
FAAP20-215ENST00000514625 LUZP6Q538Z0 58 aa4.51□□□□□ -1.69
FAAP20-215ENST00000514625 LCE1EQ5T753 118 aa4.51□□□□□ -1.69
FAAP20-215ENST00000514625 MUC5ACP98088 5654 aa4.44□□□□□ -1.7
FAAP20-215ENST00000514625 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
FAAP20-215ENST00000514625 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
FAAP20-215ENST00000514625 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.29□□□□□ -1.72
FAAP20-215ENST00000514625 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.25□□□□□ -1.73
FAAP20-215ENST00000514625 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.21□□□□□ -1.74
FAAP20-215ENST00000514625 LCE1CQ5T751 118 aa4.19□□□□□ -1.74
FAAP20-215ENST00000514625 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.08□□□□□ -1.76
FAAP20-215ENST00000514625 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
FAAP20-215ENST00000514625 NDUFAF8A1L188 74 aa3.76□□□□□ -1.81
FAAP20-215ENST00000514625 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.76□□□□□ -1.81
FAAP20-215ENST00000514625 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.74□□□□□ -1.81
FAAP20-215ENST00000514625 LCE1FQ5T754 118 aa3.63□□□□□ -1.83
FAAP20-215ENST00000514625 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.54□□□□□ -1.84
FAAP20-215ENST00000514625 H3BS24 57 aa3.25□□□□□ -1.89
FAAP20-215ENST00000514625 PHGR1C9JFL3 82 aa3.24□□□□□ -1.89
FAAP20-215ENST00000514625 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.21□□□□□ -1.9
FAAP20-215ENST00000514625 PRM1P04553 51 aa3.18□□□□□ -1.9
FAAP20-215ENST00000514625 A0A0A0MQY5 61 aa3.12□□□□□ -1.91
FAAP20-215ENST00000514625 INE1O15225 51 aa3.08□□□□□ -1.92
FAAP20-215ENST00000514625 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.91□□□□□ -1.94
FAAP20-215ENST00000514625 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.37□□□□□ -2.03
FAAP20-215ENST00000514625 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.14□□□□□ -2.07
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.6 ms