RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508100.1

ITGA3-211, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 549 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP12-1P59990 96 aa5.9□□□□□ -1.46
ITGA3-211ENST00000508100 UQCR11O14957 56 aa5.89□□□□□ -1.47
ITGA3-211ENST00000508100 A8MU10 97 aa5.88□□□□□ -1.47
ITGA3-211ENST00000508100 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.87□□□□□ -1.47
ITGA3-211ENST00000508100 PSPHP1O15172 72 aa5.84□□□□□ -1.47
ITGA3-211ENST00000508100 MT1MQ8N339 61 aa5.83□□□□□ -1.48
ITGA3-211ENST00000508100 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.82□□□□□ -1.48
ITGA3-211ENST00000508100 MT1LQ93083 61 aa5.79□□□□□ -1.48
ITGA3-211ENST00000508100 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.77□□□□□ -1.49
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.73□□□□□ -1.49
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.71□□□□□ -1.5
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.71□□□□□ -1.5
ITGA3-211ENST00000508100 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.7□□□□□ -1.5
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.69□□□□□ -1.5
ITGA3-211ENST00000508100 A6NED7 52 aa5.67□□□□□ -1.5
ITGA3-211ENST00000508100 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.66□□□□□ -1.5
ITGA3-211ENST00000508100 LCE3AQ5TA76 89 aa5.64□□□□□ -1.51
ITGA3-211ENST00000508100 TNP1P09430 55 aa5.61□□□□□ -1.51
ITGA3-211ENST00000508100 K7ERS5 55 aa5.59□□□□□ -1.51
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.54□□□□□ -1.52
ITGA3-211ENST00000508100 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.53□□□□□ -1.52
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.52□□□□□ -1.53
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.48□□□□□ -1.53
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP12-3P60328 96 aa5.44□□□□□ -1.54
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.44□□□□□ -1.54
ITGA3-211ENST00000508100 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.39□□□□□ -1.55
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.39□□□□□ -1.55
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP12-4P60329 112 aa5.37□□□□□ -1.55
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
ITGA3-211ENST00000508100 PRO0628Q9UI54 55 aa5.31□□□□□ -1.56
ITGA3-211ENST00000508100 ROMO1P60602 79 aa5.29□□□□□ -1.56
ITGA3-211ENST00000508100 BRK1Q8WUW1 75 aa5.25□□□□□ -1.57
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.23□□□□□ -1.57
ITGA3-211ENST00000508100 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.21□□□□□ -1.58
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.12□□□□□ -1.59
ITGA3-211ENST00000508100 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.06□□□□□ -1.6
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.98□□□□□ -1.61
ITGA3-211ENST00000508100 PMAIP1Q13794 54 aa4.97□□□□□ -1.61
ITGA3-211ENST00000508100 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.97□□□□□ -1.61
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.96□□□□□ -1.62
ITGA3-211ENST00000508100 MT1AP04731 61 aa4.92□□□□□ -1.62
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.9□□□□□ -1.63
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP5-8O75690 187 aa4.87□□□□□ -1.63
ITGA3-211ENST00000508100 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.86□□□□□ -1.63
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.8□□□□□ -1.64
ITGA3-211ENST00000508100 MUC5ACP98088 5654 aa4.78□□□□□ -1.64
ITGA3-211ENST00000508100 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.76□□□□□ -1.65
ITGA3-211ENST00000508100 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.72□□□□□ -1.65
ITGA3-211ENST00000508100 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.69□□□□□ -1.66
ITGA3-211ENST00000508100 PRAC1Q96KF2 57 aa4.69□□□□□ -1.66
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.65□□□□□ -1.67
ITGA3-211ENST00000508100 H3BS24 57 aa4.64□□□□□ -1.67
ITGA3-211ENST00000508100 MT3P25713 68 aa4.54□□□□□ -1.68
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.5□□□□□ -1.69
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ITGA3-211ENST00000508100 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.04□□□□□ -1.76
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.99□□□□□ -1.77
ITGA3-211ENST00000508100 LCE1CQ5T751 118 aa3.92□□□□□ -1.78
ITGA3-211ENST00000508100 LUZP6Q538Z0 58 aa3.89□□□□□ -1.79
ITGA3-211ENST00000508100 NDUFAF8A1L188 74 aa3.82□□□□□ -1.8
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.77□□□□□ -1.81
ITGA3-211ENST00000508100 A0A0A0MQY5 61 aa3.63□□□□□ -1.83
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.57□□□□□ -1.84
ITGA3-211ENST00000508100 LCE1FQ5T754 118 aa3.56□□□□□ -1.84
ITGA3-211ENST00000508100 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.53□□□□□ -1.84
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
ITGA3-211ENST00000508100 PHGR1C9JFL3 82 aa3.37□□□□□ -1.87
ITGA3-211ENST00000508100 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.37□□□□□ -1.87
ITGA3-211ENST00000508100 INE1O15225 51 aa3.29□□□□□ -1.88
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.22□□□□□ -1.89
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.02□□□□□ -1.93
ITGA3-211ENST00000508100 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.89□□□□□ -1.95
ITGA3-211ENST00000508100 PRM1P04553 51 aa2.72□□□□□ -1.97
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.57□□□□□ -2
ITGA3-211ENST00000508100 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.99□□□□□ -2.09
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