RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498160.5

CTDSP1-215, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 877 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-215ENST00000498160 MDN1Q9NU22 5596 aa6.39□□□□□ -1.39
CTDSP1-215ENST00000498160 NEBP20929 6669 aa6.35□□□□□ -1.39
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.34□□□□□ -1.39
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.3□□□□□ -1.4
CTDSP1-215ENST00000498160 MT1GP13640 62 aa6.29□□□□□ -1.4
CTDSP1-215ENST00000498160 MT1LQ93083 61 aa6.28□□□□□ -1.4
CTDSP1-215ENST00000498160 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.27□□□□□ -1.41
CTDSP1-215ENST00000498160 SPRR2DP22532 72 aa6.24□□□□□ -1.41
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.21□□□□□ -1.42
CTDSP1-215ENST00000498160 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.17□□□□□ -1.42
CTDSP1-215ENST00000498160 MT1MQ8N339 61 aa6.12□□□□□ -1.43
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.1□□□□□ -1.43
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.1□□□□□ -1.43
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.1□□□□□ -1.43
CTDSP1-215ENST00000498160 PRAC1Q96KF2 57 aa6.07□□□□□ -1.44
CTDSP1-215ENST00000498160 LCE3BQ5TA77 95 aa6.02□□□□□ -1.45
CTDSP1-215ENST00000498160 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.97□□□□□ -1.45
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.95□□□□□ -1.46
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.95□□□□□ -1.46
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.88□□□□□ -1.47
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.84□□□□□ -1.47
CTDSP1-215ENST00000498160 SVIPQ8NHG7 77 aa5.82□□□□□ -1.48
CTDSP1-215ENST00000498160 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
CTDSP1-215ENST00000498160 LCE4AQ5TA78 99 aa5.61□□□□□ -1.51
CTDSP1-215ENST00000498160 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.55□□□□□ -1.52
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.54□□□□□ -1.52
CTDSP1-215ENST00000498160 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.53□□□□□ -1.52
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.51□□□□□ -1.53
CTDSP1-215ENST00000498160 MT1AP04731 61 aa5.39□□□□□ -1.55
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP12-4P60329 112 aa5.37□□□□□ -1.55
CTDSP1-215ENST00000498160 LCE1DQ5T752 114 aa5.36□□□□□ -1.55
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.36□□□□□ -1.55
CTDSP1-215ENST00000498160 MT4P47944 62 aa5.35□□□□□ -1.55
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.25□□□□□ -1.57
CTDSP1-215ENST00000498160 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.24□□□□□ -1.57
CTDSP1-215ENST00000498160 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
CTDSP1-215ENST00000498160 LUZP6Q538Z0 58 aa5.23□□□□□ -1.57
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.23□□□□□ -1.57
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.18□□□□□ -1.58
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.13□□□□□ -1.59
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5□□□□□ -1.61
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.95□□□□□ -1.62
CTDSP1-215ENST00000498160 MT3P25713 68 aa4.93□□□□□ -1.62
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.92□□□□□ -1.62
CTDSP1-215ENST00000498160 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.89□□□□□ -1.63
CTDSP1-215ENST00000498160 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.85□□□□□ -1.63
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.72□□□□□ -1.65
CTDSP1-215ENST00000498160 NDUFAF8A1L188 74 aa4.64□□□□□ -1.67
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.61□□□□□ -1.67
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.5□□□□□ -1.69
CTDSP1-215ENST00000498160 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.44□□□□□ -1.7
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP5-8O75690 187 aa4.42□□□□□ -1.7
CTDSP1-215ENST00000498160 LCE1EQ5T753 118 aa4.42□□□□□ -1.7
CTDSP1-215ENST00000498160 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.42□□□□□ -1.7
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.31□□□□□ -1.72
CTDSP1-215ENST00000498160 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.27□□□□□ -1.73
CTDSP1-215ENST00000498160 MUC5ACP98088 5654 aa4.17□□□□□ -1.74
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.16□□□□□ -1.74
CTDSP1-215ENST00000498160 A0A0A0MQY5 61 aa4.1□□□□□ -1.75
CTDSP1-215ENST00000498160 LCE1CQ5T751 118 aa4.08□□□□□ -1.76
CTDSP1-215ENST00000498160 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.08□□□□□ -1.76
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.03□□□□□ -1.76
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.96□□□□□ -1.78
CTDSP1-215ENST00000498160 INE1O15225 51 aa3.95□□□□□ -1.78
CTDSP1-215ENST00000498160 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
CTDSP1-215ENST00000498160 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.65□□□□□ -1.83
CTDSP1-215ENST00000498160 LCE1FQ5T754 118 aa3.47□□□□□ -1.85
CTDSP1-215ENST00000498160 PRM1P04553 51 aa3.46□□□□□ -1.86
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.46□□□□□ -1.86
CTDSP1-215ENST00000498160 H3BS24 57 aa3.25□□□□□ -1.89
CTDSP1-215ENST00000498160 PHGR1C9JFL3 82 aa3.11□□□□□ -1.91
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.01□□□□□ -1.93
CTDSP1-215ENST00000498160 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.67□□□□□ -1.98
CTDSP1-215ENST00000498160 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.12□□□□□ -2.07
CTDSP1-215ENST00000498160 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.05□□□□□ -2.08
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