RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496024.1

CALD1-223, Transcript of caldesmon 1, human

TSL 4

Gene CALD1, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALD1-223	ENST00000496024		A6NED7	52 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CALD1-223	ENST00000496024	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CALD1-223	ENST00000496024	BRK1	Q8WUW1	75 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CALD1-223	ENST00000496024	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CALD1-223	ENST00000496024	PRO0628	Q9UI54	55 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CALD1-223	ENST00000496024	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CALD1-223	ENST00000496024	SPRR2D	P22532	72 aa		3.69	□□□□□ -1.82
CALD1-223	ENST00000496024	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		3.69	□□□□□ -1.82
CALD1-223	ENST00000496024	TNP1	P09430	55 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CALD1-223	ENST00000496024	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CALD1-223	ENST00000496024	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CALD1-223	ENST00000496024	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		3.68	□□□□□ -1.82
CALD1-223	ENST00000496024	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		3.65	□□□□□ -1.83
CALD1-223	ENST00000496024		K7ERS5	55 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALD1-223	ENST00000496024	MT1E	P04732	61 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALD1-223	ENST00000496024	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		3.64	□□□□□ -1.83
CALD1-223	ENST00000496024	LCE3A	Q5TA76	89 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CALD1-223	ENST00000496024	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CALD1-223	ENST00000496024	SVIP	Q8NHG7	77 aa		3.58	□□□□□ -1.84
CALD1-223	ENST00000496024	PMAIP1	Q13794	54 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CALD1-223	ENST00000496024	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CALD1-223	ENST00000496024	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CALD1-223	ENST00000496024	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CALD1-223	ENST00000496024	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		3.52	□□□□□ -1.85
CALD1-223	ENST00000496024	MT1G	P13640	62 aa		3.5	□□□□□ -1.85
CALD1-223	ENST00000496024	MT1L	Q93083	61 aa		3.5	□□□□□ -1.85
CALD1-223	ENST00000496024	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		3.49	□□□□□ -1.85
CALD1-223	ENST00000496024	KRTAP12-3	P60328	96 aa		3.48	□□□□□ -1.85
CALD1-223	ENST00000496024	PP632	Q6XCG6	107 aa		3.48	□□□□□ -1.85
CALD1-223	ENST00000496024	MT1M	Q8N339	61 aa		3.46	□□□□□ -1.86
CALD1-223	ENST00000496024	ROMO1	P60602	79 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CALD1-223	ENST00000496024	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CALD1-223	ENST00000496024	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CALD1-223	ENST00000496024	PRAC1	Q96KF2	57 aa		3.32	□□□□□ -1.88
CALD1-223	ENST00000496024	MT4	P47944	62 aa		3.23	□□□□□ -1.89
CALD1-223	ENST00000496024	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		3.22	□□□□□ -1.89
CALD1-223	ENST00000496024	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		3.21	□□□□□ -1.9
CALD1-223	ENST00000496024	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		3.19	□□□□□ -1.9
CALD1-223	ENST00000496024	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
CALD1-223	ENST00000496024	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		3.13	□□□□□ -1.91
CALD1-223	ENST00000496024	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CALD1-223	ENST00000496024	KRTAP12-4	P60329	112 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CALD1-223	ENST00000496024	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
CALD1-223	ENST00000496024	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		3.04	□□□□□ -1.92
CALD1-223	ENST00000496024	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		3.02	□□□□□ -1.93
CALD1-223	ENST00000496024	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		3	□□□□□ -1.93
CALD1-223	ENST00000496024	MT1A	P04731	61 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CALD1-223	ENST00000496024	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CALD1-223	ENST00000496024	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		2.9	□□□□□ -1.95
CALD1-223	ENST00000496024	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.95
CALD1-223	ENST00000496024	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		2.81	□□□□□ -1.96
CALD1-223	ENST00000496024	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		2.81	□□□□□ -1.96
CALD1-223	ENST00000496024	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CALD1-223	ENST00000496024	MT3	P25713	68 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CALD1-223	ENST00000496024	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CALD1-223	ENST00000496024	LUZP6	Q538Z0	58 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CALD1-223	ENST00000496024	NDUFAF8	A1L188	74 aa		2.69	□□□□□ -1.98
CALD1-223	ENST00000496024	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		2.69	□□□□□ -1.98
CALD1-223	ENST00000496024		A0A0A0MQY5	61 aa		2.65	□□□□□ -1.99
CALD1-223	ENST00000496024	KRTAP5-8	O75690	187 aa		2.63	□□□□□ -1.99
CALD1-223	ENST00000496024	LCE1E	Q5T753	118 aa		2.62	□□□□□ -1.99
CALD1-223	ENST00000496024	MUC5AC	P98088	5654 aa		2.56	□□□□□ -2
CALD1-223	ENST00000496024	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
CALD1-223	ENST00000496024	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	2.53	□□□□□ -2.01
CALD1-223	ENST00000496024	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		2.51	□□□□□ -2.01
CALD1-223	ENST00000496024	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.37	□□□□□ -2.03
CALD1-223	ENST00000496024	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.36	□□□□□ -2.03
CALD1-223	ENST00000496024	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		2.35	□□□□□ -2.03
CALD1-223	ENST00000496024	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		2.35	□□□□□ -2.03
CALD1-223	ENST00000496024	LCE1C	Q5T751	118 aa		2.26	□□□□□ -2.05
CALD1-223	ENST00000496024	INE1	O15225	51 aa		2.23	□□□□□ -2.05
CALD1-223	ENST00000496024	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		2.23	□□□□□ -2.05
CALD1-223	ENST00000496024	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		1.94	□□□□□ -2.1
CALD1-223	ENST00000496024	PRM1	P04553	51 aa		1.77	□□□□□ -2.13
CALD1-223	ENST00000496024	PHGR1	C9JFL3	82 aa		1.76	□□□□□ -2.13
CALD1-223	ENST00000496024	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		1.69	□□□□□ -2.14
CALD1-223	ENST00000496024	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.27	□□□□□ -2.21
CALD1-223	ENST00000496024	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.21	□□□□□ -2.22

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