RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488157.5

NISCH-210, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 590 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-210ENST00000488157 TNP1P09430 55 aa4.47□□□□□ -1.69
NISCH-210ENST00000488157 LCE3AQ5TA76 89 aa4.46□□□□□ -1.7
NISCH-210ENST00000488157 SVIPQ8NHG7 77 aa4.46□□□□□ -1.7
NISCH-210ENST00000488157 ROMO1P60602 79 aa4.44□□□□□ -1.7
NISCH-210ENST00000488157 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.42□□□□□ -1.7
NISCH-210ENST00000488157 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.42□□□□□ -1.7
NISCH-210ENST00000488157 LCE3BQ5TA77 95 aa4.41□□□□□ -1.7
NISCH-210ENST00000488157 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.41□□□□□ -1.7
NISCH-210ENST00000488157 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.41□□□□□ -1.7
NISCH-210ENST00000488157 MT1LQ93083 61 aa4.33□□□□□ -1.72
NISCH-210ENST00000488157 MT1GP13640 62 aa4.32□□□□□ -1.72
NISCH-210ENST00000488157 PRAC1Q96KF2 57 aa4.32□□□□□ -1.72
NISCH-210ENST00000488157 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.31□□□□□ -1.72
NISCH-210ENST00000488157 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
NISCH-210ENST00000488157 MT1MQ8N339 61 aa4.28□□□□□ -1.72
NISCH-210ENST00000488157 KRTAP12-3P60328 96 aa4.26□□□□□ -1.73
NISCH-210ENST00000488157 PP632Q6XCG6 107 aa4.24□□□□□ -1.73
NISCH-210ENST00000488157 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.24□□□□□ -1.73
NISCH-210ENST00000488157 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.2□□□□□ -1.74
NISCH-210ENST00000488157 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.19□□□□□ -1.74
NISCH-210ENST00000488157 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.11□□□□□ -1.75
NISCH-210ENST00000488157 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.03□□□□□ -1.76
NISCH-210ENST00000488157 LCE1DQ5T752 114 aa4□□□□□ -1.77
NISCH-210ENST00000488157 MT4P47944 62 aa3.99□□□□□ -1.77
NISCH-210ENST00000488157 LCE4AQ5TA78 99 aa3.99□□□□□ -1.77
NISCH-210ENST00000488157 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.98□□□□□ -1.77
NISCH-210ENST00000488157 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.96□□□□□ -1.78
NISCH-210ENST00000488157 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.95□□□□□ -1.78
NISCH-210ENST00000488157 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.94□□□□□ -1.78
NISCH-210ENST00000488157 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
NISCH-210ENST00000488157 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.91□□□□□ -1.78
NISCH-210ENST00000488157 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.84□□□□□ -1.8
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NISCH-210ENST00000488157 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.78□□□□□ -1.8
NISCH-210ENST00000488157 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.75□□□□□ -1.81
NISCH-210ENST00000488157 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
NISCH-210ENST00000488157 KRTAP12-4P60329 112 aa3.72□□□□□ -1.81
NISCH-210ENST00000488157 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.71□□□□□ -1.82
NISCH-210ENST00000488157 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.68□□□□□ -1.82
NISCH-210ENST00000488157 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.67□□□□□ -1.82
NISCH-210ENST00000488157 MT1AP04731 61 aa3.67□□□□□ -1.82
NISCH-210ENST00000488157 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.64□□□□□ -1.83
NISCH-210ENST00000488157 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.62□□□□□ -1.83
NISCH-210ENST00000488157 LUZP6Q538Z0 58 aa3.61□□□□□ -1.83
NISCH-210ENST00000488157 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.55□□□□□ -1.84
NISCH-210ENST00000488157 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.51□□□□□ -1.85
NISCH-210ENST00000488157 NDUFAF8A1L188 74 aa3.48□□□□□ -1.85
NISCH-210ENST00000488157 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.47□□□□□ -1.85
NISCH-210ENST00000488157 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.44□□□□□ -1.86
NISCH-210ENST00000488157 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.38□□□□□ -1.87
NISCH-210ENST00000488157 MT3P25713 68 aa3.33□□□□□ -1.88
NISCH-210ENST00000488157 KRTAP5-8O75690 187 aa3.28□□□□□ -1.88
NISCH-210ENST00000488157 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.27□□□□□ -1.89
NISCH-210ENST00000488157 A0A0A0MQY5 61 aa3.15□□□□□ -1.91
NISCH-210ENST00000488157 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.14□□□□□ -1.91
NISCH-210ENST00000488157 H3BS24 57 aa3.12□□□□□ -1.91
NISCH-210ENST00000488157 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.04□□□□□ -1.92
NISCH-210ENST00000488157 LCE1EQ5T753 118 aa3.01□□□□□ -1.93
NISCH-210ENST00000488157 MUC5ACP98088 5654 aa3□□□□□ -1.93
NISCH-210ENST00000488157 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
NISCH-210ENST00000488157 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
NISCH-210ENST00000488157 INE1O15225 51 aa2.91□□□□□ -1.94
NISCH-210ENST00000488157 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.89□□□□□ -1.95
NISCH-210ENST00000488157 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.88□□□□□ -1.95
NISCH-210ENST00000488157 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.86□□□□□ -1.95
NISCH-210ENST00000488157 LCE1CQ5T751 118 aa2.8□□□□□ -1.96
NISCH-210ENST00000488157 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.71□□□□□ -1.98
NISCH-210ENST00000488157 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.59□□□□□ -1.99
NISCH-210ENST00000488157 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
NISCH-210ENST00000488157 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.52□□□□□ -2.01
NISCH-210ENST00000488157 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.42□□□□□ -2.02
NISCH-210ENST00000488157 LCE1FQ5T754 118 aa2.39□□□□□ -2.03
NISCH-210ENST00000488157 PRM1P04553 51 aa2.31□□□□□ -2.04
NISCH-210ENST00000488157 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.23□□□□□ -2.05
NISCH-210ENST00000488157 PHGR1C9JFL3 82 aa2.19□□□□□ -2.06
NISCH-210ENST00000488157 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2□□□□□ -2.09
NISCH-210ENST00000488157 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.56□□□□□ -2.16
NISCH-210ENST00000488157 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.45□□□□□ -2.18
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