RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487290.5

HCLS1-208, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, human

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCLS1-208	ENST00000487290	SPRR2B	P35325	72 aa		6.26	□□□□□ -1.41
HCLS1-208	ENST00000487290	SPRR2A	P35326	72 aa		6.26	□□□□□ -1.41
HCLS1-208	ENST00000487290	TNP1	P09430	55 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HCLS1-208	ENST00000487290	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		6.25	□□□□□ -1.41
HCLS1-208	ENST00000487290		A6NED7	52 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HCLS1-208	ENST00000487290		K7ERS5	55 aa		6.21	□□□□□ -1.42
HCLS1-208	ENST00000487290	MT1E	P04732	61 aa		6.17	□□□□□ -1.42
HCLS1-208	ENST00000487290	LCE3A	Q5TA76	89 aa		6.12	□□□□□ -1.43
HCLS1-208	ENST00000487290	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		6.11	□□□□□ -1.43
HCLS1-208	ENST00000487290	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		6.1	□□□□□ -1.43
HCLS1-208	ENST00000487290	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		6.1	□□□□□ -1.43
HCLS1-208	ENST00000487290	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		6.09	□□□□□ -1.43
HCLS1-208	ENST00000487290	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		6.05	□□□□□ -1.44
HCLS1-208	ENST00000487290	SPRR2D	P22532	72 aa		6.05	□□□□□ -1.44
HCLS1-208	ENST00000487290	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		6.05	□□□□□ -1.44
HCLS1-208	ENST00000487290	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		6.05	□□□□□ -1.44
HCLS1-208	ENST00000487290	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		5.96	□□□□□ -1.46
HCLS1-208	ENST00000487290	MT1G	P13640	62 aa		5.94	□□□□□ -1.46
HCLS1-208	ENST00000487290	MT1L	Q93083	61 aa		5.94	□□□□□ -1.46
HCLS1-208	ENST00000487290	KRTAP12-3	P60328	96 aa		5.9	□□□□□ -1.46
HCLS1-208	ENST00000487290	ROMO1	P60602	79 aa		5.88	□□□□□ -1.47
HCLS1-208	ENST00000487290	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		5.88	□□□□□ -1.47
HCLS1-208	ENST00000487290	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		5.88	□□□□□ -1.47
HCLS1-208	ENST00000487290	PP632	Q6XCG6	107 aa		5.85	□□□□□ -1.47
HCLS1-208	ENST00000487290	MT1M	Q8N339	61 aa		5.84	□□□□□ -1.47
HCLS1-208	ENST00000487290	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
HCLS1-208	ENST00000487290	BRK1	Q8WUW1	75 aa		5.66	□□□□□ -1.5
HCLS1-208	ENST00000487290	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		5.63	□□□□□ -1.51
HCLS1-208	ENST00000487290	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		5.61	□□□□□ -1.51
HCLS1-208	ENST00000487290	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		5.47	□□□□□ -1.53
HCLS1-208	ENST00000487290	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		5.46	□□□□□ -1.54
HCLS1-208	ENST00000487290	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
HCLS1-208	ENST00000487290	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		5.36	□□□□□ -1.55
HCLS1-208	ENST00000487290	PMAIP1	Q13794	54 aa		5.34	□□□□□ -1.55
HCLS1-208	ENST00000487290	PRO0628	Q9UI54	55 aa		5.27	□□□□□ -1.57
HCLS1-208	ENST00000487290	MT4	P47944	62 aa		5.22	□□□□□ -1.57
HCLS1-208	ENST00000487290	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		5.18	□□□□□ -1.58
HCLS1-208	ENST00000487290	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
HCLS1-208	ENST00000487290	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
HCLS1-208	ENST00000487290	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		5.12	□□□□□ -1.59
HCLS1-208	ENST00000487290	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		5.11	□□□□□ -1.59
HCLS1-208	ENST00000487290	MT1A	P04731	61 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HCLS1-208	ENST00000487290	KRTAP12-4	P60329	112 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HCLS1-208	ENST00000487290	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HCLS1-208	ENST00000487290	PRAC1	Q96KF2	57 aa		5.07	□□□□□ -1.6
HCLS1-208	ENST00000487290	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		5.04	□□□□□ -1.6
HCLS1-208	ENST00000487290	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HCLS1-208	ENST00000487290	SVIP	Q8NHG7	77 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HCLS1-208	ENST00000487290	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HCLS1-208	ENST00000487290	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HCLS1-208	ENST00000487290	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HCLS1-208	ENST00000487290	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HCLS1-208	ENST00000487290	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.68	□□□□□ -1.66
HCLS1-208	ENST00000487290	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HCLS1-208	ENST00000487290	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		4.62	□□□□□ -1.67
HCLS1-208	ENST00000487290	MT3	P25713	68 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCLS1-208	ENST00000487290		A0A0A0MQY5	61 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HCLS1-208	ENST00000487290	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.45	□□□□□ -1.7
HCLS1-208	ENST00000487290	KRTAP5-8	O75690	187 aa		4.4	□□□□□ -1.71
HCLS1-208	ENST00000487290	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.4	□□□□□ -1.71
HCLS1-208	ENST00000487290	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		4.31	□□□□□ -1.72
HCLS1-208	ENST00000487290	MUC5AC	P98088	5654 aa		4.25	□□□□□ -1.73
HCLS1-208	ENST00000487290	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.23	□□□□□ -1.73
HCLS1-208	ENST00000487290	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
HCLS1-208	ENST00000487290	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
HCLS1-208	ENST00000487290	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.99	□□□□□ -1.77
HCLS1-208	ENST00000487290	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.9	□□□□□ -1.79
HCLS1-208	ENST00000487290	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.9	□□□□□ -1.79
HCLS1-208	ENST00000487290	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.81	□□□□□ -1.8
HCLS1-208	ENST00000487290	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.74	□□□□□ -1.81
HCLS1-208	ENST00000487290	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.7	□□□□□ -1.82
HCLS1-208	ENST00000487290	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.32	□□□□□ -1.88
HCLS1-208	ENST00000487290	INE1	O15225	51 aa		3.06	□□□□□ -1.92
HCLS1-208	ENST00000487290	PHGR1	C9JFL3	82 aa		3.01	□□□□□ -1.93
HCLS1-208	ENST00000487290	PRM1	P04553	51 aa		3	□□□□□ -1.93
HCLS1-208	ENST00000487290	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.68	□□□□□ -1.98
HCLS1-208	ENST00000487290	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.11	□□□□□ -2.07
HCLS1-208	ENST00000487290	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.94	□□□□□ -2.1

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