RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486115.1

C7orf49-210, humanhuman

TSL 2

Gene C7orf49, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf49-210ENST00000486115 SPRR2DP22532 72 aa6.6□□□□□ -1.35
C7orf49-210ENST00000486115 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.58□□□□□ -1.36
C7orf49-210ENST00000486115 KRTAP12-3P60328 96 aa6.57□□□□□ -1.36
C7orf49-210ENST00000486115 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.56□□□□□ -1.36
C7orf49-210ENST00000486115 PMAIP1Q13794 54 aa6.54□□□□□ -1.36
C7orf49-210ENST00000486115 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.53□□□□□ -1.36
C7orf49-210ENST00000486115 PP632Q6XCG6 107 aa6.51□□□□□ -1.37
C7orf49-210ENST00000486115 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.5□□□□□ -1.37
C7orf49-210ENST00000486115 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.5□□□□□ -1.37
C7orf49-210ENST00000486115 MT1GP13640 62 aa6.49□□□□□ -1.37
C7orf49-210ENST00000486115 MT1LQ93083 61 aa6.49□□□□□ -1.37
C7orf49-210ENST00000486115 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.43□□□□□ -1.38
C7orf49-210ENST00000486115 LCE3BQ5TA77 95 aa6.38□□□□□ -1.39
C7orf49-210ENST00000486115 MT1MQ8N339 61 aa6.36□□□□□ -1.39
C7orf49-210ENST00000486115 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.32□□□□□ -1.4
C7orf49-210ENST00000486115 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.32□□□□□ -1.4
C7orf49-210ENST00000486115 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.29□□□□□ -1.4
C7orf49-210ENST00000486115 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.29□□□□□ -1.4
C7orf49-210ENST00000486115 H3BS24 57 aa6.28□□□□□ -1.4
C7orf49-210ENST00000486115 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
C7orf49-210ENST00000486115 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.14□□□□□ -1.43
C7orf49-210ENST00000486115 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.14□□□□□ -1.43
C7orf49-210ENST00000486115 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.08□□□□□ -1.44
C7orf49-210ENST00000486115 PRAC1Q96KF2 57 aa5.96□□□□□ -1.46
C7orf49-210ENST00000486115 LCE4AQ5TA78 99 aa5.87□□□□□ -1.47
C7orf49-210ENST00000486115 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.8□□□□□ -1.48
C7orf49-210ENST00000486115 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.79□□□□□ -1.48
C7orf49-210ENST00000486115 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.78□□□□□ -1.48
C7orf49-210ENST00000486115 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
C7orf49-210ENST00000486115 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.77□□□□□ -1.49
C7orf49-210ENST00000486115 MT4P47944 62 aa5.71□□□□□ -1.5
C7orf49-210ENST00000486115 LCE1DQ5T752 114 aa5.71□□□□□ -1.5
C7orf49-210ENST00000486115 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.67□□□□□ -1.5
C7orf49-210ENST00000486115 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.59□□□□□ -1.52
C7orf49-210ENST00000486115 KRTAP12-4P60329 112 aa5.58□□□□□ -1.52
C7orf49-210ENST00000486115 MT1AP04731 61 aa5.54□□□□□ -1.52
C7orf49-210ENST00000486115 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.51□□□□□ -1.53
C7orf49-210ENST00000486115 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.46□□□□□ -1.54
C7orf49-210ENST00000486115 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.45□□□□□ -1.54
C7orf49-210ENST00000486115 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
C7orf49-210ENST00000486115 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.39□□□□□ -1.55
C7orf49-210ENST00000486115 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.3□□□□□ -1.56
C7orf49-210ENST00000486115 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.26□□□□□ -1.57
C7orf49-210ENST00000486115 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.23□□□□□ -1.57
C7orf49-210ENST00000486115 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.21□□□□□ -1.57
C7orf49-210ENST00000486115 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.16□□□□□ -1.58
C7orf49-210ENST00000486115 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.13□□□□□ -1.59
C7orf49-210ENST00000486115 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.12□□□□□ -1.59
C7orf49-210ENST00000486115 MT3P25713 68 aa5.08□□□□□ -1.6
C7orf49-210ENST00000486115 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.08□□□□□ -1.6
C7orf49-210ENST00000486115 LUZP6Q538Z0 58 aa5.06□□□□□ -1.6
C7orf49-210ENST00000486115 NDUFAF8A1L188 74 aa5□□□□□ -1.61
C7orf49-210ENST00000486115 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.88□□□□□ -1.63
C7orf49-210ENST00000486115 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.84□□□□□ -1.63
C7orf49-210ENST00000486115 A0A0A0MQY5 61 aa4.72□□□□□ -1.65
C7orf49-210ENST00000486115 KRTAP5-8O75690 187 aa4.68□□□□□ -1.66
C7orf49-210ENST00000486115 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.65□□□□□ -1.66
C7orf49-210ENST00000486115 LCE1EQ5T753 118 aa4.55□□□□□ -1.68
C7orf49-210ENST00000486115 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.54□□□□□ -1.68
C7orf49-210ENST00000486115 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.53□□□□□ -1.68
C7orf49-210ENST00000486115 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.49□□□□□ -1.69
C7orf49-210ENST00000486115 MUC5ACP98088 5654 aa4.41□□□□□ -1.7
C7orf49-210ENST00000486115 INE1O15225 51 aa4.34□□□□□ -1.71
C7orf49-210ENST00000486115 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.3□□□□□ -1.72
C7orf49-210ENST00000486115 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
C7orf49-210ENST00000486115 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.23□□□□□ -1.73
C7orf49-210ENST00000486115 LCE1CQ5T751 118 aa4.21□□□□□ -1.74
C7orf49-210ENST00000486115 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
C7orf49-210ENST00000486115 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
C7orf49-210ENST00000486115 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.78□□□□□ -1.8
C7orf49-210ENST00000486115 LCE1FQ5T754 118 aa3.59□□□□□ -1.83
C7orf49-210ENST00000486115 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.58□□□□□ -1.84
C7orf49-210ENST00000486115 PRM1P04553 51 aa3.45□□□□□ -1.86
C7orf49-210ENST00000486115 PHGR1C9JFL3 82 aa3.23□□□□□ -1.89
C7orf49-210ENST00000486115 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.2□□□□□ -1.9
C7orf49-210ENST00000486115 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.85□□□□□ -1.95
C7orf49-210ENST00000486115 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.27□□□□□ -2.05
C7orf49-210ENST00000486115 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.13□□□□□ -2.07
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms