RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481079.1

PTPRD-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-210ENST00000481079 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
PTPRD-210ENST00000481079 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRD-210ENST00000481079 MT1GP13640 62 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-210ENST00000481079 LCE3AQ5TA76 89 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-210ENST00000481079 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRD-210ENST00000481079 MT1LQ93083 61 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRD-210ENST00000481079 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRD-210ENST00000481079 PP632Q6XCG6 107 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRD-210ENST00000481079 MT1MQ8N339 61 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRD-210ENST00000481079 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPRD-210ENST00000481079 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRD-210ENST00000481079 KRTAP12-3P60328 96 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRD-210ENST00000481079 KRTAP23-1A1A580 65 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRD-210ENST00000481079 ROMO1P60602 79 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRD-210ENST00000481079 LCE1DQ5T752 114 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRD-210ENST00000481079 LCE4AQ5TA78 99 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRD-210ENST00000481079 GPR98Q8WXG9 6306 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRD-210ENST00000481079 HMCN1Q96RW7 5635 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRD-210ENST00000481079 MT4P47944 62 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-210ENST00000481079 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-210ENST00000481079 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-210ENST00000481079 BRK1Q8WUW1 75 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-210ENST00000481079 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRD-210ENST00000481079 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRD-210ENST00000481079 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRD-210ENST00000481079 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRD-210ENST00000481079 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRD-210ENST00000481079 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRD-210ENST00000481079 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRD-210ENST00000481079 LCE3CQ5T5A8 94 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRD-210ENST00000481079 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRD-210ENST00000481079 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRD-210ENST00000481079 PMAIP1Q13794 54 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRD-210ENST00000481079 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRD-210ENST00000481079 KRTAP12-4P60329 112 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRD-210ENST00000481079 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRD-210ENST00000481079 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRD-210ENST00000481079 PRO0628Q9UI54 55 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRD-210ENST00000481079 MT1AP04731 61 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRD-210ENST00000481079 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRD-210ENST00000481079 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRD-210ENST00000481079 PRAC1Q96KF2 57 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRD-210ENST00000481079 KRTAP5-2Q701N4 177 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRD-210ENST00000481079 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-210ENST00000481079 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRD-210ENST00000481079 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRD-210ENST00000481079 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRD-210ENST00000481079 KRTAP5-8O75690 187 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRD-210ENST00000481079 OBSCNQ5VST9 7968 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRD-210ENST00000481079 MT3P25713 68 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRD-210ENST00000481079 SVIPQ8NHG7 77 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRD-210ENST00000481079 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRD-210ENST00000481079 MUC5ACP98088 5654 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRD-210ENST00000481079 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-210ENST00000481079 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRD-210ENST00000481079 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRD-210ENST00000481079 LCE1EQ5T753 118 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRD-210ENST00000481079 LUZP6Q538Z0 58 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRD-210ENST00000481079 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRD-210ENST00000481079 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRD-210ENST00000481079 LCE1CQ5T751 118 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRD-210ENST00000481079 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRD-210ENST00000481079 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRD-210ENST00000481079 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRD-210ENST00000481079 NDUFAF8A1L188 74 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRD-210ENST00000481079 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
PTPRD-210ENST00000481079 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRD-210ENST00000481079 LCE1FQ5T754 118 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRD-210ENST00000481079 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-210ENST00000481079 PHGR1C9JFL3 82 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-210ENST00000481079 A0A0A0MQY5 61 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRD-210ENST00000481079 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRD-210ENST00000481079 INE1O15225 51 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRD-210ENST00000481079 PRM1P04553 51 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-210ENST00000481079 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRD-210ENST00000481079 H3BS24 57 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRD-210ENST00000481079 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRD-210ENST00000481079 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.92□□□□□ -1.94
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