RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-210ENST00000477812 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa7.22□□□□□ -1.25
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP12-3P60328 96 aa7.2□□□□□ -1.26
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa7.2□□□□□ -1.26
ACTB-210ENST00000477812 LCE5AQ5TCM9 118 aa7.17□□□□□ -1.26
ACTB-210ENST00000477812 MT1LQ93083 61 aa7.15□□□□□ -1.26
ACTB-210ENST00000477812 PP632Q6XCG6 107 aa7.13□□□□□ -1.27
ACTB-210ENST00000477812 SPRR2DP22532 72 aa7.12□□□□□ -1.27
ACTB-210ENST00000477812 MT1GP13640 62 aa7.07□□□□□ -1.28
ACTB-210ENST00000477812 PRAC1Q96KF2 57 aa7.05□□□□□ -1.28
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.99□□□□□ -1.29
ACTB-210ENST00000477812 MT1MQ8N339 61 aa6.99□□□□□ -1.29
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.99□□□□□ -1.29
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.9□□□□□ -1.3
ACTB-210ENST00000477812 LCE3BQ5TA77 95 aa6.89□□□□□ -1.31
ACTB-210ENST00000477812 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.82□□□□□ -1.32
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.82□□□□□ -1.32
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.8□□□□□ -1.32
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.8□□□□□ -1.32
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.8□□□□□ -1.32
ACTB-210ENST00000477812 SVIPQ8NHG7 77 aa6.79□□□□□ -1.32
ACTB-210ENST00000477812 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.76□□□□□ -1.33
ACTB-210ENST00000477812 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.69□□□□□ -1.34
ACTB-210ENST00000477812 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.44□□□□□ -1.38
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.39□□□□□ -1.39
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.36□□□□□ -1.39
ACTB-210ENST00000477812 LCE4AQ5TA78 99 aa6.34□□□□□ -1.39
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.28□□□□□ -1.4
ACTB-210ENST00000477812 LCE1DQ5T752 114 aa6.22□□□□□ -1.41
ACTB-210ENST00000477812 MT4P47944 62 aa6.19□□□□□ -1.42
ACTB-210ENST00000477812 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.17□□□□□ -1.42
ACTB-210ENST00000477812 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.13□□□□□ -1.43
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.11□□□□□ -1.43
ACTB-210ENST00000477812 MT1AP04731 61 aa6.08□□□□□ -1.44
ACTB-210ENST00000477812 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.02□□□□□ -1.45
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP12-4P60329 112 aa6□□□□□ -1.45
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.96□□□□□ -1.46
ACTB-210ENST00000477812 LUZP6Q538Z0 58 aa5.91□□□□□ -1.46
ACTB-210ENST00000477812 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.9□□□□□ -1.47
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.81□□□□□ -1.48
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.79□□□□□ -1.48
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.75□□□□□ -1.49
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.7□□□□□ -1.5
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.64□□□□□ -1.51
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.6□□□□□ -1.51
ACTB-210ENST00000477812 NDUFAF8A1L188 74 aa5.52□□□□□ -1.53
ACTB-210ENST00000477812 MT3P25713 68 aa5.5□□□□□ -1.53
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.3□□□□□ -1.56
ACTB-210ENST00000477812 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.23□□□□□ -1.57
ACTB-210ENST00000477812 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP5-8O75690 187 aa5.14□□□□□ -1.59
ACTB-210ENST00000477812 MUC5ACP98088 5654 aa5.03□□□□□ -1.6
ACTB-210ENST00000477812 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5□□□□□ -1.61
ACTB-210ENST00000477812 LCE1EQ5T753 118 aa4.96□□□□□ -1.62
ACTB-210ENST00000477812 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.9□□□□□ -1.63
ACTB-210ENST00000477812 A0A0A0MQY5 61 aa4.88□□□□□ -1.63
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.71□□□□□ -1.66
ACTB-210ENST00000477812 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.7□□□□□ -1.66
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.67□□□□□ -1.66
ACTB-210ENST00000477812 INE1O15225 51 aa4.65□□□□□ -1.67
ACTB-210ENST00000477812 LCE1CQ5T751 118 aa4.6□□□□□ -1.67
ACTB-210ENST00000477812 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.6□□□□□ -1.67
ACTB-210ENST00000477812 H3BS24 57 aa4.43□□□□□ -1.7
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.14□□□□□ -1.75
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.98□□□□□ -1.77
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.98□□□□□ -1.77
ACTB-210ENST00000477812 PRM1P04553 51 aa3.88□□□□□ -1.79
ACTB-210ENST00000477812 LCE1FQ5T754 118 aa3.87□□□□□ -1.79
ACTB-210ENST00000477812 PHGR1C9JFL3 82 aa3.56□□□□□ -1.84
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.52□□□□□ -1.85
ACTB-210ENST00000477812 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.18□□□□□ -1.9
ACTB-210ENST00000477812 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.55□□□□□ -2
ACTB-210ENST00000477812 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.27□□□□□ -2.05
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