RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475304.5

TAPBP-238, Transcript of TAP binding protein, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TAPBP, Length 1,686 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAPBP-238	ENST00000475304	MT1E	P04732	61 aa		6.26	□□□□□ -1.41
TAPBP-238	ENST00000475304	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TAPBP-238	ENST00000475304	MDN1	Q9NU22	5596 aa		6.2	□□□□□ -1.42
TAPBP-238	ENST00000475304	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		6.16	□□□□□ -1.42
TAPBP-238	ENST00000475304	MT1L	Q93083	61 aa		6.15	□□□□□ -1.42
TAPBP-238	ENST00000475304	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		6.14	□□□□□ -1.43
TAPBP-238	ENST00000475304	LUZP6	Q538Z0	58 aa		6.12	□□□□□ -1.43
TAPBP-238	ENST00000475304	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TAPBP-238	ENST00000475304	SPRR2E	P22531	72 aa		6.05	□□□□□ -1.44
TAPBP-238	ENST00000475304	SPRR2B	P35325	72 aa		6.05	□□□□□ -1.44
TAPBP-238	ENST00000475304	SPRR2A	P35326	72 aa		6.05	□□□□□ -1.44
TAPBP-238	ENST00000475304	NDUFAF8	A1L188	74 aa		6.04	□□□□□ -1.44
TAPBP-238	ENST00000475304	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		6.04	□□□□□ -1.44
TAPBP-238	ENST00000475304	MT1G	P13640	62 aa		6.03	□□□□□ -1.44
TAPBP-238	ENST00000475304	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		6.01	□□□□□ -1.45
TAPBP-238	ENST00000475304	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		5.97	□□□□□ -1.45
TAPBP-238	ENST00000475304	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		5.97	□□□□□ -1.45
TAPBP-238	ENST00000475304	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		5.91	□□□□□ -1.46
TAPBP-238	ENST00000475304	MT1M	Q8N339	61 aa		5.9	□□□□□ -1.47
TAPBP-238	ENST00000475304	SPRR2D	P22532	72 aa		5.85	□□□□□ -1.47
TAPBP-238	ENST00000475304	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		5.85	□□□□□ -1.47
TAPBP-238	ENST00000475304	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		5.79	□□□□□ -1.48
TAPBP-238	ENST00000475304	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		5.79	□□□□□ -1.48
TAPBP-238	ENST00000475304	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		5.7	□□□□□ -1.5
TAPBP-238	ENST00000475304	LCE3B	Q5TA77	95 aa		5.69	□□□□□ -1.5
TAPBP-238	ENST00000475304		A0A0A0MQY5	61 aa		5.67	□□□□□ -1.5
TAPBP-238	ENST00000475304	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		5.66	□□□□□ -1.5
TAPBP-238	ENST00000475304	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		5.49	□□□□□ -1.53
TAPBP-238	ENST00000475304	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
TAPBP-238	ENST00000475304	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	5.32	□□□□□ -1.56
TAPBP-238	ENST00000475304	MT1A	P04731	61 aa		5.27	□□□□□ -1.57
TAPBP-238	ENST00000475304	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		5.26	□□□□□ -1.57
TAPBP-238	ENST00000475304	LCE4A	Q5TA78	99 aa		5.21	□□□□□ -1.58
TAPBP-238	ENST00000475304	LCE1D	Q5T752	114 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TAPBP-238	ENST00000475304	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		5.15	□□□□□ -1.59
TAPBP-238	ENST00000475304	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		5.15	□□□□□ -1.59
TAPBP-238	ENST00000475304	MT4	P47944	62 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TAPBP-238	ENST00000475304	INE1	O15225	51 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TAPBP-238	ENST00000475304	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TAPBP-238	ENST00000475304	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TAPBP-238	ENST00000475304	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TAPBP-238	ENST00000475304	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TAPBP-238	ENST00000475304	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TAPBP-238	ENST00000475304	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TAPBP-238	ENST00000475304	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		4.84	□□□□□ -1.64
TAPBP-238	ENST00000475304	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TAPBP-238	ENST00000475304	MT3	P25713	68 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TAPBP-238	ENST00000475304	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TAPBP-238	ENST00000475304	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TAPBP-238	ENST00000475304	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TAPBP-238	ENST00000475304	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TAPBP-238	ENST00000475304	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TAPBP-238	ENST00000475304	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TAPBP-238	ENST00000475304	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TAPBP-238	ENST00000475304	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.38	□□□□□ -1.71
TAPBP-238	ENST00000475304	KRTAP5-8	O75690	187 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TAPBP-238	ENST00000475304	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TAPBP-238	ENST00000475304	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TAPBP-238	ENST00000475304	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TAPBP-238	ENST00000475304	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TAPBP-238	ENST00000475304	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TAPBP-238	ENST00000475304	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
TAPBP-238	ENST00000475304	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.77
TAPBP-238	ENST00000475304	PRM1	P04553	51 aa		3.91	□□□□□ -1.78
TAPBP-238	ENST00000475304	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TAPBP-238	ENST00000475304	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TAPBP-238	ENST00000475304	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TAPBP-238	ENST00000475304	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
TAPBP-238	ENST00000475304	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TAPBP-238	ENST00000475304	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TAPBP-238	ENST00000475304	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.26	□□□□□ -1.89
TAPBP-238	ENST00000475304	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TAPBP-238	ENST00000475304	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TAPBP-238	ENST00000475304	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TAPBP-238	ENST00000475304	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.56	□□□□□ -2
TAPBP-238	ENST00000475304	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.43	□□□□□ -2.02
TAPBP-238	ENST00000475304	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.93	□□□□□ -2.1

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