RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP12-1P59990 96 aa3.89□□□□□ -1.79
ACTB-209ENST00000473257 LCE3AQ5TA76 89 aa3.87□□□□□ -1.79
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.87□□□□□ -1.79
ACTB-209ENST00000473257 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.87□□□□□ -1.79
ACTB-209ENST00000473257 COA5Q86WW8 74 aa3.85□□□□□ -1.79
ACTB-209ENST00000473257 V9GYY9 64 aa3.85□□□□□ -1.79
ACTB-209ENST00000473257 A0A1B0GU33 70 aa3.82□□□□□ -1.8
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.82□□□□□ -1.8
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.82□□□□□ -1.8
ACTB-209ENST00000473257 SVIPQ8NHG7 77 aa3.82□□□□□ -1.8
ACTB-209ENST00000473257 SEC61GP60059 68 aa3.8□□□□□ -1.8
ACTB-209ENST00000473257 Q1T7F1 81 aa3.79□□□□□ -1.8
ACTB-209ENST00000473257 A8MU10 97 aa3.78□□□□□ -1.8
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.75□□□□□ -1.81
ACTB-209ENST00000473257 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.72□□□□□ -1.81
ACTB-209ENST00000473257 TNP1P09430 55 aa3.71□□□□□ -1.82
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
ACTB-209ENST00000473257 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa3.68□□□□□ -1.82
ACTB-209ENST00000473257 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.67□□□□□ -1.82
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP12-3P60328 96 aa3.67□□□□□ -1.82
ACTB-209ENST00000473257 PRO0628Q9UI54 55 aa3.67□□□□□ -1.82
ACTB-209ENST00000473257 PRR15LQ9BU68 103 aa3.64□□□□□ -1.83
ACTB-209ENST00000473257 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
ACTB-209ENST00000473257 A0A1B0GU69 56 aa3.62□□□□□ -1.83
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP12-4P60329 112 aa3.61□□□□□ -1.83
ACTB-209ENST00000473257 PSPHP1O15172 72 aa3.58□□□□□ -1.84
ACTB-209ENST00000473257 BRK1Q8WUW1 75 aa3.58□□□□□ -1.84
ACTB-209ENST00000473257 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
ACTB-209ENST00000473257 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.56□□□□□ -1.84
ACTB-209ENST00000473257 A6NED7 52 aa3.54□□□□□ -1.84
ACTB-209ENST00000473257 UQCR11O14957 56 aa3.52□□□□□ -1.85
ACTB-209ENST00000473257 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.48□□□□□ -1.85
ACTB-209ENST00000473257 MUC5ACP98088 5654 aa3.48□□□□□ -1.85
ACTB-209ENST00000473257 MIR22HGQ0VDD5 57 aa3.44□□□□□ -1.86
ACTB-209ENST00000473257 PMAIP1Q13794 54 aa3.43□□□□□ -1.86
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.4□□□□□ -1.87
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.4□□□□□ -1.87
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP5-8O75690 187 aa3.38□□□□□ -1.87
ACTB-209ENST00000473257 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.37□□□□□ -1.87
ACTB-209ENST00000473257 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.36□□□□□ -1.87
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.36□□□□□ -1.87
ACTB-209ENST00000473257 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.36□□□□□ -1.87
ACTB-209ENST00000473257 K7ERS5 55 aa3.35□□□□□ -1.87
ACTB-209ENST00000473257 MT1AP04731 61 aa3.34□□□□□ -1.87
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.33□□□□□ -1.88
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.3□□□□□ -1.88
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.28□□□□□ -1.88
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.26□□□□□ -1.89
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.25□□□□□ -1.89
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.21□□□□□ -1.9
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.18□□□□□ -1.9
ACTB-209ENST00000473257 ROMO1P60602 79 aa3.16□□□□□ -1.9
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.12□□□□□ -1.91
ACTB-209ENST00000473257 PRAC1Q96KF2 57 aa3.06□□□□□ -1.92
ACTB-209ENST00000473257 MT3P25713 68 aa3.05□□□□□ -1.92
ACTB-209ENST00000473257 LCE1EQ5T753 118 aa2.82□□□□□ -1.96
ACTB-209ENST00000473257 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.8□□□□□ -1.96
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.77□□□□□ -1.97
ACTB-209ENST00000473257 H3BS24 57 aa2.72□□□□□ -1.97
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.68□□□□□ -1.98
ACTB-209ENST00000473257 LUZP6Q538Z0 58 aa2.65□□□□□ -1.99
ACTB-209ENST00000473257 LCE1CQ5T751 118 aa2.64□□□□□ -1.99
ACTB-209ENST00000473257 NDUFAF8A1L188 74 aa2.56□□□□□ -2
ACTB-209ENST00000473257 A0A0A0MQY5 61 aa2.55□□□□□ -2
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.43□□□□□ -2.02
ACTB-209ENST00000473257 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.36□□□□□ -2.03
ACTB-209ENST00000473257 LCE1FQ5T754 118 aa2.35□□□□□ -2.03
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
ACTB-209ENST00000473257 PHGR1C9JFL3 82 aa2.33□□□□□ -2.04
ACTB-209ENST00000473257 INE1O15225 51 aa2.29□□□□□ -2.04
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.22□□□□□ -2.05
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.17□□□□□ -2.06
ACTB-209ENST00000473257 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.16□□□□□ -2.06
ACTB-209ENST00000473257 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.08□□□□□ -2.08
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.73□□□□□ -2.13
ACTB-209ENST00000473257 PRM1P04553 51 aa1.59□□□□□ -2.15
ACTB-209ENST00000473257 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.45□□□□□ -2.18
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