RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472004.5

GYS1-204, Transcript of glycogen synthase 1, human

TSL 3

Gene GYS1, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GYS1-204	ENST00000472004	SPRR2A	P35326	72 aa		5.21	□□□□□ -1.58
GYS1-204	ENST00000472004	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		5.17	□□□□□ -1.58
GYS1-204	ENST00000472004	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		5.12	□□□□□ -1.59
GYS1-204	ENST00000472004	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		5.11	□□□□□ -1.59
GYS1-204	ENST00000472004	MT1L	Q93083	61 aa		5.11	□□□□□ -1.59
GYS1-204	ENST00000472004	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GYS1-204	ENST00000472004	NEB	P20929	6669 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GYS1-204	ENST00000472004	MT1G	P13640	62 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GYS1-204	ENST00000472004	SPRR2D	P22532	72 aa		5.03	□□□□□ -1.6
GYS1-204	ENST00000472004	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.03	□□□□□ -1.6
GYS1-204	ENST00000472004	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GYS1-204	ENST00000472004	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GYS1-204	ENST00000472004	MT1M	Q8N339	61 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GYS1-204	ENST00000472004	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GYS1-204	ENST00000472004	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GYS1-204	ENST00000472004	MDN1	Q9NU22	5596 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GYS1-204	ENST00000472004	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GYS1-204	ENST00000472004	LCE3B	Q5TA77	95 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GYS1-204	ENST00000472004	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GYS1-204	ENST00000472004	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GYS1-204	ENST00000472004	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GYS1-204	ENST00000472004	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GYS1-204	ENST00000472004	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GYS1-204	ENST00000472004	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GYS1-204	ENST00000472004	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GYS1-204	ENST00000472004	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GYS1-204	ENST00000472004	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GYS1-204	ENST00000472004	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
GYS1-204	ENST00000472004	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.42	□□□□□ -1.7
GYS1-204	ENST00000472004	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.42	□□□□□ -1.7
GYS1-204	ENST00000472004	MT1A	P04731	61 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GYS1-204	ENST00000472004	MT4	P47944	62 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GYS1-204	ENST00000472004	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GYS1-204	ENST00000472004	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.34	□□□□□ -1.71
GYS1-204	ENST00000472004	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.33	□□□□□ -1.72
GYS1-204	ENST00000472004	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.3	□□□□□ -1.72
GYS1-204	ENST00000472004	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GYS1-204	ENST00000472004	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GYS1-204	ENST00000472004	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GYS1-204	ENST00000472004	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.17	□□□□□ -1.74
GYS1-204	ENST00000472004	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GYS1-204	ENST00000472004	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GYS1-204	ENST00000472004	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.03	□□□□□ -1.76
GYS1-204	ENST00000472004	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
GYS1-204	ENST00000472004	MT3	P25713	68 aa		4.01	□□□□□ -1.77
GYS1-204	ENST00000472004	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		3.99	□□□□□ -1.77
GYS1-204	ENST00000472004	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		3.97	□□□□□ -1.77
GYS1-204	ENST00000472004	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		3.95	□□□□□ -1.78
GYS1-204	ENST00000472004	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		3.93	□□□□□ -1.78
GYS1-204	ENST00000472004	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		3.89	□□□□□ -1.79
GYS1-204	ENST00000472004		A0A0A0MQY5	61 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GYS1-204	ENST00000472004	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.71	□□□□□ -1.82
GYS1-204	ENST00000472004	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		3.64	□□□□□ -1.83
GYS1-204	ENST00000472004	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
GYS1-204	ENST00000472004	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.59	□□□□□ -1.83
GYS1-204	ENST00000472004	INE1	O15225	51 aa		3.5	□□□□□ -1.85
GYS1-204	ENST00000472004	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.49	□□□□□ -1.85
GYS1-204	ENST00000472004	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.48	□□□□□ -1.85
GYS1-204	ENST00000472004	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.46	□□□□□ -1.86
GYS1-204	ENST00000472004	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.46	□□□□□ -1.86
GYS1-204	ENST00000472004	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.45	□□□□□ -1.86
GYS1-204	ENST00000472004	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.4	□□□□□ -1.87
GYS1-204	ENST00000472004	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.36	□□□□□ -1.87
GYS1-204	ENST00000472004	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.3	□□□□□ -1.88
GYS1-204	ENST00000472004		H3BS24	57 aa		3.29	□□□□□ -1.88
GYS1-204	ENST00000472004	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.23	□□□□□ -1.89
GYS1-204	ENST00000472004	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.21	□□□□□ -1.9
GYS1-204	ENST00000472004	PRM1	P04553	51 aa		3.01	□□□□□ -1.93
GYS1-204	ENST00000472004	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
GYS1-204	ENST00000472004	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		2.87	□□□□□ -1.95
GYS1-204	ENST00000472004	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		2.81	□□□□□ -1.96
GYS1-204	ENST00000472004	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.78	□□□□□ -1.96
GYS1-204	ENST00000472004	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.68	□□□□□ -1.98
GYS1-204	ENST00000472004	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.55	□□□□□ -2
GYS1-204	ENST00000472004	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.46	□□□□□ -2.02
GYS1-204	ENST00000472004	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.06	□□□□□ -2.08
GYS1-204	ENST00000472004	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.83	□□□□□ -2.12
GYS1-204	ENST00000472004	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.54	□□□□□ -2.16

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