RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468576.1

PTPRG-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRG, Length 854 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-202ENST00000468576 RPL39P5Q59GN2 51 aa0.09□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 PYY3Q5JQD4 70 aa0.09□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 ENHOQ6UWT2 76 aa0.09□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 WFDC10BQ8IUB3 73 aa0.09□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 SNHG12Q9BXW3 62 aa0.09□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 UBL5Q9BZL1 73 aa0.09□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 SMCO4Q9NRQ5 59 aa0.09□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 HSPG2P98160 4391 aa0.09□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 DNAH2Q9P225 4427 aa0.09□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 DNAH9Q9NYC9 4486 aa0.09□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 MYCBP2O75592 4640 aa0.09□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 HERC2O95714 4834 aa0.08□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 MUC12Q9UKN1 5478 aa0.08□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 BIRC6Q9NR09 4857 aa0.08□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 PKD1P98161 4303 aa0.08□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 DNAH11Q96DT5 4516 aa0.08□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 A0A096LNI7 61 aa0.08□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa0.08□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 H7BZZ5 65 aa0.08□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 MT1FP04733 61 aa0.08□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 TNP1P09430 55 aa0.08□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 SMIM13P0DJ93 91 aa0.08□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 DEFB130BP0DP73 79 aa0.08□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 DEFB130AP0DP74 79 aa0.08□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 MT1GP13640 62 aa0.08□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 RPS27P42677 84 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 LINC00158P58513 81 aa0.08□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 DEFB1P60022 68 aa0.08□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 MT1HP80294 61 aa0.08□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 ADIRFQ15847 76 aa0.08□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa0.08□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa0.08□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 CLPSL2Q6UWE3 100 aa0.08□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 LINC00643Q86TS7 51 aa0.08□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 C18orf32Q8TCD1 76 aa0.08□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 LINC00308Q8TCZ7 52 aa0.08□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 GNG13Q9P2W3 67 aa0.08□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 C6orf48Q9UBA6 75 aa0.08□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 FAT3Q8TDW7 4589 aa0.08□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 SACSQ9NZJ4 4579 aa0.08□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 LRP1BQ9NZR2 4599 aa0.08□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 MUC17Q685J3 4493 aa0.07□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 DNAH17Q9UFH2 4485 aa0.07□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 LRP2P98164 4655 aa0.07□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 LPAP08519 4548 aa0.07□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 DNAH5Q8TE73 4624 aa0.07□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 DNAH10Q8IVF4 4471 aa0.07□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 MT2AP02795 61 aa0.07□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 MT1EP04732 61 aa0.07□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 MT1BP07438 61 aa0.07□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 RPL39P62891 51 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 PRLHP81277 87 aa0.07□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 NREPQ16612 68 aa0.07□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa0.07□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa0.07□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa0.07□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 MT1MQ8N339 61 aa0.07□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 MT1LQ93083 61 aa0.07□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 TOMM7Q9P0U1 55 aa0.07□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 S4R3F8 94 aa0.07□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 APOBP04114 4563 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 DNAH8Q96JB1 4490 aa0.07□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 USH2AO75445 5202 aa0.06□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 FAT1Q14517 4588 aa0.06□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 H3BUT2 72 aa0.06□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 DEFB4AO15263 64 aa0.06□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 MT1AP04731 61 aa0.06□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 APELAP0DMC3 54 aa0.06□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 MT1XP80297 61 aa0.06□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa0.04□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa0.03□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 PRM1P04553 51 aa0.01□□□□□ -2.41
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 335.1 ms