RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		6.48	□□□□□ -1.37
USP19-210	ENST00000465902	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		6.44	□□□□□ -1.38
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		6.38	□□□□□ -1.39
USP19-210	ENST00000465902	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	6.37	□□□□□ -1.39
USP19-210	ENST00000465902	MT1G	P13640	62 aa		6.35	□□□□□ -1.39
USP19-210	ENST00000465902	PP632	Q6XCG6	107 aa		6.33	□□□□□ -1.4
USP19-210	ENST00000465902	MT1L	Q93083	61 aa		6.32	□□□□□ -1.4
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP12-3	P60328	96 aa		6.29	□□□□□ -1.4
USP19-210	ENST00000465902	MT1M	Q8N339	61 aa		6.25	□□□□□ -1.41
USP19-210	ENST00000465902	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		6.24	□□□□□ -1.41
USP19-210	ENST00000465902	ROMO1	P60602	79 aa		6.15	□□□□□ -1.42
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		6.15	□□□□□ -1.42
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		6.12	□□□□□ -1.43
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		6.1	□□□□□ -1.43
USP19-210	ENST00000465902	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		6.08	□□□□□ -1.44
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		6.05	□□□□□ -1.44
USP19-210	ENST00000465902	LCE1D	Q5T752	114 aa		6.01	□□□□□ -1.45
USP19-210	ENST00000465902	LCE4A	Q5TA78	99 aa		5.99	□□□□□ -1.45
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		5.95	□□□□□ -1.46
USP19-210	ENST00000465902	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		5.94	□□□□□ -1.46
USP19-210	ENST00000465902	MT4	P47944	62 aa		5.91	□□□□□ -1.46
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		5.89	□□□□□ -1.47
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.88	□□□□□ -1.47
USP19-210	ENST00000465902	BRK1	Q8WUW1	75 aa		5.86	□□□□□ -1.47
USP19-210	ENST00000465902	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		5.8	□□□□□ -1.48
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		5.76	□□□□□ -1.49
USP19-210	ENST00000465902	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		5.75	□□□□□ -1.49
USP19-210	ENST00000465902	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		5.73	□□□□□ -1.49
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		5.64	□□□□□ -1.51
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP12-4	P60329	112 aa		5.54	□□□□□ -1.52
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		5.54	□□□□□ -1.52
USP19-210	ENST00000465902	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		5.52	□□□□□ -1.53
USP19-210	ENST00000465902	PMAIP1	Q13794	54 aa		5.52	□□□□□ -1.53
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		5.49	□□□□□ -1.53
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		5.43	□□□□□ -1.54
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		5.43	□□□□□ -1.54
USP19-210	ENST00000465902	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
USP19-210	ENST00000465902	MT1A	P04731	61 aa		5.38	□□□□□ -1.55
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		5.35	□□□□□ -1.55
USP19-210	ENST00000465902	PRAC1	Q96KF2	57 aa		5.25	□□□□□ -1.57
USP19-210	ENST00000465902	PRO0628	Q9UI54	55 aa		5.23	□□□□□ -1.57
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		5.14	□□□□□ -1.59
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		5.09	□□□□□ -1.59
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		5.08	□□□□□ -1.6
USP19-210	ENST00000465902	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP19-210	ENST00000465902	MT3	P25713	68 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP5-8	O75690	187 aa		4.92	□□□□□ -1.62
USP19-210	ENST00000465902	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.85	□□□□□ -1.63
USP19-210	ENST00000465902	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.83	□□□□□ -1.64
USP19-210	ENST00000465902	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
USP19-210	ENST00000465902	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
USP19-210	ENST00000465902	MUC5AC	P98088	5654 aa		4.71	□□□□□ -1.66
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.67	□□□□□ -1.66
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP19-210	ENST00000465902	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.45	□□□□□ -1.7
USP19-210	ENST00000465902	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.43	□□□□□ -1.7
USP19-210	ENST00000465902	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		4.25	□□□□□ -1.73
USP19-210	ENST00000465902	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		4.25	□□□□□ -1.73
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.16	□□□□□ -1.74
USP19-210	ENST00000465902	LCE1C	Q5T751	118 aa		4.12	□□□□□ -1.75
USP19-210	ENST00000465902	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		4.03	□□□□□ -1.76
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.77	□□□□□ -1.81
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
USP19-210	ENST00000465902	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.74	□□□□□ -1.81
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.7	□□□□□ -1.82
USP19-210	ENST00000465902	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.63	□□□□□ -1.83
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.49	□□□□□ -1.85
USP19-210	ENST00000465902	PHGR1	C9JFL3	82 aa		3.27	□□□□□ -1.89
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.23	□□□□□ -1.89
USP19-210	ENST00000465902	PRM1	P04553	51 aa		3.17	□□□□□ -1.9
USP19-210	ENST00000465902		A0A0A0MQY5	61 aa		3.09	□□□□□ -1.91
USP19-210	ENST00000465902	INE1	O15225	51 aa		3	□□□□□ -1.93
USP19-210	ENST00000465902	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.99	□□□□□ -1.93
USP19-210	ENST00000465902		H3BS24	57 aa		2.78	□□□□□ -1.96
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.5	□□□□□ -2.01
USP19-210	ENST00000465902	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		2.1	□□□□□ -2.07

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