RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 MT1BP07438 61 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP10-10P60014 251 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRC-210ENST00000462363 CRCT1Q9UGL9 99 aa2.37□□□□□ -2.03
PTPRC-210ENST00000462363 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP10-5P60370 271 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRC-210ENST00000462363 MT1XP80297 61 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRC-210ENST00000462363 PLAC4Q8WY50 150 aa2.32□□□□□ -2.04
PTPRC-210ENST00000462363 PP632Q6XCG6 107 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRC-210ENST00000462363 FSIP2Q5CZC0 6907 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRC-210ENST00000462363 TNP1P09430 55 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRC-210ENST00000462363 USH2AO75445 5202 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRC-210ENST00000462363 LCE3AQ5TA76 89 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP10-12P60413 245 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRC-210ENST00000462363 SSPOA2VEC9 5147 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRC-210ENST00000462363 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.19□□□□□ -2.06
PTPRC-210ENST00000462363 PRO2289Q9P1D8 64 aa2.19□□□□□ -2.06
PTPRC-210ENST00000462363 MT3P25713 68 aa2.18□□□□□ -2.06
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa2.17□□□□□ -2.06
PTPRC-210ENST00000462363 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.15□□□□□ -2.07
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP12-3P60328 96 aa2.13□□□□□ -2.07
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa2.11□□□□□ -2.07
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa2.1□□□□□ -2.07
PTPRC-210ENST00000462363 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
PTPRC-210ENST00000462363 KMT2DO14686 5537 aa2.06□□□□□ -2.08
PTPRC-210ENST00000462363 NDUFAF8A1L188 74 aa2.06□□□□□ -2.08
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRC-210ENST00000462363 MT1EP04732 61 aa2.04□□□□□ -2.08
PTPRC-210ENST00000462363 LCE1FQ5T754 118 aa2.04□□□□□ -2.08
PTPRC-210ENST00000462363 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
PTPRC-210ENST00000462363 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.02□□□□□ -2.09
PTPRC-210ENST00000462363 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
PTPRC-210ENST00000462363 MT1LQ93083 61 aa2.01□□□□□ -2.09
PTPRC-210ENST00000462363 LUZP6Q538Z0 58 aa1.97□□□□□ -2.09
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa1.95□□□□□ -2.1
PTPRC-210ENST00000462363 SPRR2FQ96RM1 72 aa1.94□□□□□ -2.1
PTPRC-210ENST00000462363 SPRR2EP22531 72 aa1.92□□□□□ -2.1
PTPRC-210ENST00000462363 SPRR2BP35325 72 aa1.92□□□□□ -2.1
PTPRC-210ENST00000462363 SPRR2AP35326 72 aa1.92□□□□□ -2.1
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa1.92□□□□□ -2.1
PTPRC-210ENST00000462363 MT1MQ8N339 61 aa1.91□□□□□ -2.1
PTPRC-210ENST00000462363 MUC12Q9UKN1 5478 aa1.9□□□□□ -2.1
PTPRC-210ENST00000462363 MT1GP13640 62 aa1.9□□□□□ -2.11
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa1.89□□□□□ -2.11
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa1.89□□□□□ -2.11
PTPRC-210ENST00000462363 NEBP20929 6669 aa1.86□□□□□ -2.11
PTPRC-210ENST00000462363 SPRR2DP22532 72 aa1.86□□□□□ -2.11
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa1.86□□□□□ -2.11
PTPRC-210ENST00000462363 MDN1Q9NU22 5596 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRC-210ENST00000462363 A0A0A0MQY5 61 aa1.78□□□□□ -2.12
PTPRC-210ENST00000462363 LCE3EQ5T5B0 92 aa1.78□□□□□ -2.12
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP1.77□□□□□ -2.13
PTPRC-210ENST00000462363 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP1.74□□□□□ -2.13
PTPRC-210ENST00000462363 INE1O15225 51 aa1.71□□□□□ -2.14
PTPRC-210ENST00000462363 MT1AP04731 61 aa1.71□□□□□ -2.14
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa1.69□□□□□ -2.14
PTPRC-210ENST00000462363 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP1.67□□□□□ -2.14
PTPRC-210ENST00000462363 MT4P47944 62 aa1.63□□□□□ -2.15
PTPRC-210ENST00000462363 LCE1CQ5T751 118 aa1.63□□□□□ -2.15
PTPRC-210ENST00000462363 LCE1BQ5T7P3 118 aa1.63□□□□□ -2.15
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP12-4P60329 112 aa1.53□□□□□ -2.16
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa1.52□□□□□ -2.17
PTPRC-210ENST00000462363 LCE3DQ9BYE3 92 aa1.5□□□□□ -2.17
PTPRC-210ENST00000462363 GPR98Q8WXG9 6306 aa1.5□□□□□ -2.17
PTPRC-210ENST00000462363 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.48□□□□□ -2.17
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa1.48□□□□□ -2.17
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa1.44□□□□□ -2.18
PTPRC-210ENST00000462363 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa1.42□□□□□ -2.18
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.4□□□□□ -2.19
PTPRC-210ENST00000462363 PRM1P04553 51 aa1.32□□□□□ -2.2
PTPRC-210ENST00000462363 MUC5ACP98088 5654 aa1.29□□□□□ -2.2
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.23□□□□□ -2.21
PTPRC-210ENST00000462363 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.17□□□□□ -2.22
PTPRC-210ENST00000462363 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.16□□□□□ -2.22
PTPRC-210ENST00000462363 PHGR1C9JFL3 82 aa0.94□□□□□ -2.26
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa0.88□□□□□ -2.27
PTPRC-210ENST00000462363 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.63□□□□□ -2.31
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