RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460909.1

RPUSD3-210, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-210ENST00000460909 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa7.45□□□□□ -1.22
RPUSD3-210ENST00000460909 LCE3BQ5TA77 95 aa7.44□□□□□ -1.22
RPUSD3-210ENST00000460909 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.41□□□□□ -1.22
RPUSD3-210ENST00000460909 MT1GP13640 62 aa7.38□□□□□ -1.23
RPUSD3-210ENST00000460909 MT1LQ93083 61 aa7.37□□□□□ -1.23
RPUSD3-210ENST00000460909 KRTAP12-3P60328 96 aa7.28□□□□□ -1.24
RPUSD3-210ENST00000460909 PP632Q6XCG6 107 aa7.27□□□□□ -1.25
RPUSD3-210ENST00000460909 MT1MQ8N339 61 aa7.27□□□□□ -1.25
RPUSD3-210ENST00000460909 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.27□□□□□ -1.25
RPUSD3-210ENST00000460909 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RPUSD3-210ENST00000460909 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.16□□□□□ -1.26
RPUSD3-210ENST00000460909 ROMO1P60602 79 aa7.13□□□□□ -1.27
RPUSD3-210ENST00000460909 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa7.1□□□□□ -1.27
RPUSD3-210ENST00000460909 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.03□□□□□ -1.28
RPUSD3-210ENST00000460909 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.9□□□□□ -1.3
RPUSD3-210ENST00000460909 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.89□□□□□ -1.31
RPUSD3-210ENST00000460909 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.85□□□□□ -1.31
RPUSD3-210ENST00000460909 LCE4AQ5TA78 99 aa6.8□□□□□ -1.32
RPUSD3-210ENST00000460909 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.78□□□□□ -1.32
RPUSD3-210ENST00000460909 BRK1Q8WUW1 75 aa6.78□□□□□ -1.32
RPUSD3-210ENST00000460909 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.75□□□□□ -1.33
RPUSD3-210ENST00000460909 LCE1DQ5T752 114 aa6.73□□□□□ -1.33
RPUSD3-210ENST00000460909 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.7□□□□□ -1.34
RPUSD3-210ENST00000460909 MT4P47944 62 aa6.67□□□□□ -1.34
RPUSD3-210ENST00000460909 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RPUSD3-210ENST00000460909 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.65□□□□□ -1.34
RPUSD3-210ENST00000460909 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.59□□□□□ -1.35
RPUSD3-210ENST00000460909 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.56□□□□□ -1.36
RPUSD3-210ENST00000460909 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.41□□□□□ -1.38
RPUSD3-210ENST00000460909 PMAIP1Q13794 54 aa6.39□□□□□ -1.39
RPUSD3-210ENST00000460909 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-210ENST00000460909 KRTAP12-4P60329 112 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-210ENST00000460909 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.35□□□□□ -1.39
RPUSD3-210ENST00000460909 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RPUSD3-210ENST00000460909 MT1AP04731 61 aa6.26□□□□□ -1.41
RPUSD3-210ENST00000460909 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.22□□□□□ -1.41
RPUSD3-210ENST00000460909 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.21□□□□□ -1.41
RPUSD3-210ENST00000460909 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.19□□□□□ -1.42
RPUSD3-210ENST00000460909 PRO0628Q9UI54 55 aa6.15□□□□□ -1.42
RPUSD3-210ENST00000460909 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-210ENST00000460909 PRAC1Q96KF2 57 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-210ENST00000460909 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.03□□□□□ -1.44
RPUSD3-210ENST00000460909 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6□□□□□ -1.45
RPUSD3-210ENST00000460909 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.93□□□□□ -1.46
RPUSD3-210ENST00000460909 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.88□□□□□ -1.47
RPUSD3-210ENST00000460909 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.82□□□□□ -1.48
RPUSD3-210ENST00000460909 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.72□□□□□ -1.49
RPUSD3-210ENST00000460909 MT3P25713 68 aa5.7□□□□□ -1.5
RPUSD3-210ENST00000460909 KRTAP5-8O75690 187 aa5.55□□□□□ -1.52
RPUSD3-210ENST00000460909 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.52□□□□□ -1.53
RPUSD3-210ENST00000460909 SVIPQ8NHG7 77 aa5.49□□□□□ -1.53
RPUSD3-210ENST00000460909 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.32□□□□□ -1.56
RPUSD3-210ENST00000460909 LCE1EQ5T753 118 aa5.19□□□□□ -1.58
RPUSD3-210ENST00000460909 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
RPUSD3-210ENST00000460909 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.15□□□□□ -1.59
RPUSD3-210ENST00000460909 MUC5ACP98088 5654 aa5.15□□□□□ -1.59
RPUSD3-210ENST00000460909 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
RPUSD3-210ENST00000460909 LUZP6Q538Z0 58 aa5.05□□□□□ -1.6
RPUSD3-210ENST00000460909 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.91□□□□□ -1.62
RPUSD3-210ENST00000460909 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.89□□□□□ -1.63
RPUSD3-210ENST00000460909 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.82□□□□□ -1.64
RPUSD3-210ENST00000460909 LCE1CQ5T751 118 aa4.81□□□□□ -1.64
RPUSD3-210ENST00000460909 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.66□□□□□ -1.66
RPUSD3-210ENST00000460909 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
RPUSD3-210ENST00000460909 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.34□□□□□ -1.71
RPUSD3-210ENST00000460909 NDUFAF8A1L188 74 aa4.33□□□□□ -1.72
RPUSD3-210ENST00000460909 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.29□□□□□ -1.72
RPUSD3-210ENST00000460909 LCE1FQ5T754 118 aa4.14□□□□□ -1.75
RPUSD3-210ENST00000460909 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.12□□□□□ -1.75
RPUSD3-210ENST00000460909 PHGR1C9JFL3 82 aa3.74□□□□□ -1.81
RPUSD3-210ENST00000460909 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.69□□□□□ -1.82
RPUSD3-210ENST00000460909 PRM1P04553 51 aa3.67□□□□□ -1.82
RPUSD3-210ENST00000460909 INE1O15225 51 aa3.52□□□□□ -1.85
RPUSD3-210ENST00000460909 A0A0A0MQY5 61 aa3.49□□□□□ -1.85
RPUSD3-210ENST00000460909 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.39□□□□□ -1.87
RPUSD3-210ENST00000460909 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.76□□□□□ -1.97
RPUSD3-210ENST00000460909 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.39□□□□□ -2.03
RPUSD3-210ENST00000460909 H3BS24 57 aa2.14□□□□□ -2.07
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