RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PTPA-222	ENST00000445241	SPRR2E	P22531	72 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PTPA-222	ENST00000445241	SPRR2B	P35325	72 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PTPA-222	ENST00000445241	SPRR2A	P35326	72 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PTPA-222	ENST00000445241	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		5.6	□□□□□ -1.51
PTPA-222	ENST00000445241	NEB	P20929	6669 aa		5.59	□□□□□ -1.51
PTPA-222	ENST00000445241	TNP1	P09430	55 aa		5.54	□□□□□ -1.52
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		5.54	□□□□□ -1.52
PTPA-222	ENST00000445241	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		5.53	□□□□□ -1.52
PTPA-222	ENST00000445241	MDN1	Q9NU22	5596 aa		5.52	□□□□□ -1.53
PTPA-222	ENST00000445241	ROMO1	P60602	79 aa		5.51	□□□□□ -1.53
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		5.5	□□□□□ -1.53
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		5.48	□□□□□ -1.53
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		5.48	□□□□□ -1.53
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		5.48	□□□□□ -1.53
PTPA-222	ENST00000445241	SPRR2D	P22532	72 aa		5.44	□□□□□ -1.54
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		5.44	□□□□□ -1.54
PTPA-222	ENST00000445241	MT1E	P04732	61 aa		5.43	□□□□□ -1.54
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PTPA-222	ENST00000445241	LCE3A	Q5TA76	89 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PTPA-222	ENST00000445241	PRAC1	Q96KF2	57 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		5.32	□□□□□ -1.56
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		5.32	□□□□□ -1.56
PTPA-222	ENST00000445241	MT1G	P13640	62 aa		5.28	□□□□□ -1.56
PTPA-222	ENST00000445241	PP632	Q6XCG6	107 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PTPA-222	ENST00000445241	MT1L	Q93083	61 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP12-3	P60328	96 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PTPA-222	ENST00000445241	MT1M	Q8N339	61 aa		5.14	□□□□□ -1.59
PTPA-222	ENST00000445241	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPA-222	ENST00000445241	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PTPA-222	ENST00000445241	MT4	P47944	62 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPA-222	ENST00000445241	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPA-222	ENST00000445241	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPA-222	ENST00000445241	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PTPA-222	ENST00000445241	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PTPA-222	ENST00000445241	MT1A	P04731	61 aa		4.47	□□□□□ -1.69
PTPA-222	ENST00000445241	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PTPA-222	ENST00000445241		A0A0A0MQY5	61 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		4.33	□□□□□ -1.72
PTPA-222	ENST00000445241	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.31	□□□□□ -1.72
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPA-222	ENST00000445241	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PTPA-222	ENST00000445241	MT3	P25713	68 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.91	□□□□□ -1.78
PTPA-222	ENST00000445241	INE1	O15225	51 aa		3.85	□□□□□ -1.79
PTPA-222	ENST00000445241	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.8	□□□□□ -1.8
PTPA-222	ENST00000445241	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.79	□□□□□ -1.8
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.77	□□□□□ -1.81
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
PTPA-222	ENST00000445241	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.58	□□□□□ -1.84
PTPA-222	ENST00000445241	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.52	□□□□□ -1.85
PTPA-222	ENST00000445241	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.52	□□□□□ -1.85
PTPA-222	ENST00000445241	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
PTPA-222	ENST00000445241	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PTPA-222	ENST00000445241	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PTPA-222	ENST00000445241	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
PTPA-222	ENST00000445241	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.94	□□□□□ -1.94
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.9	□□□□□ -1.95
PTPA-222	ENST00000445241	PRM1	P04553	51 aa		2.8	□□□□□ -1.96
PTPA-222	ENST00000445241	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PTPA-222	ENST00000445241	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.3	□□□□□ -2.04
PTPA-222	ENST00000445241	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.93	□□□□□ -2.1
PTPA-222	ENST00000445241	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.7	□□□□□ -2.14

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