RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432502.1

NUP50-AS1-202, humanhuman

TSL 2

Gene NUP50-AS1, Length 596 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.79□□□□□ -1.32
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.78□□□□□ -1.32
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TNP1P09430 55 aa6.77□□□□□ -1.33
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TMEM258P61165 79 aa6.77□□□□□ -1.33
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PRR15LQ9BU68 103 aa6.75□□□□□ -1.33
NUP50-AS1-202ENST00000432502 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.69□□□□□ -1.34
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.66□□□□□ -1.34
NUP50-AS1-202ENST00000432502 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.63□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.61□□□□□ -1.35
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.57□□□□□ -1.36
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KRTAP12-3P60328 96 aa6.56□□□□□ -1.36
NUP50-AS1-202ENST00000432502 UQCR11O14957 56 aa6.52□□□□□ -1.37
NUP50-AS1-202ENST00000432502 V9GYY9 64 aa6.45□□□□□ -1.38
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.4□□□□□ -1.38
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.4□□□□□ -1.38
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.38□□□□□ -1.39
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.36□□□□□ -1.39
NUP50-AS1-202ENST00000432502 Q1T7F1 81 aa6.36□□□□□ -1.39
NUP50-AS1-202ENST00000432502 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.35□□□□□ -1.39
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.29□□□□□ -1.4
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KRTAP12-4P60329 112 aa6.28□□□□□ -1.4
NUP50-AS1-202ENST00000432502 K7ERS5 55 aa6.27□□□□□ -1.41
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PSPHP1O15172 72 aa6.26□□□□□ -1.41
NUP50-AS1-202ENST00000432502 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.23□□□□□ -1.41
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.22□□□□□ -1.41
NUP50-AS1-202ENST00000432502 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PCP4P48539 62 aa6.15□□□□□ -1.42
NUP50-AS1-202ENST00000432502 A6NED7 52 aa6.09□□□□□ -1.43
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.08□□□□□ -1.44
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.06□□□□□ -1.44
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
NUP50-AS1-202ENST00000432502 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.03□□□□□ -1.44
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.92□□□□□ -1.46
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.91□□□□□ -1.46
NUP50-AS1-202ENST00000432502 MT1AP04731 61 aa5.89□□□□□ -1.47
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.89□□□□□ -1.47
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.87□□□□□ -1.47
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ROMO1P60602 79 aa5.82□□□□□ -1.48
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.73□□□□□ -1.49
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.71□□□□□ -1.5
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KRTAP5-8O75690 187 aa5.71□□□□□ -1.5
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.64□□□□□ -1.51
NUP50-AS1-202ENST00000432502 MUC5ACP98088 5654 aa5.52□□□□□ -1.53
NUP50-AS1-202ENST00000432502 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
NUP50-AS1-202ENST00000432502 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.43□□□□□ -1.54
NUP50-AS1-202ENST00000432502 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.42□□□□□ -1.54
NUP50-AS1-202ENST00000432502 MT3P25713 68 aa5.4□□□□□ -1.54
NUP50-AS1-202ENST00000432502 BRK1Q8WUW1 75 aa5.37□□□□□ -1.55
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.34□□□□□ -1.55
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PMAIP1Q13794 54 aa5.1□□□□□ -1.59
NUP50-AS1-202ENST00000432502 LCE1EQ5T753 118 aa5.03□□□□□ -1.6
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PRO0628Q9UI54 55 aa4.84□□□□□ -1.63
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.78□□□□□ -1.64
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PRAC1Q96KF2 57 aa4.77□□□□□ -1.65
NUP50-AS1-202ENST00000432502 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.7□□□□□ -1.66
NUP50-AS1-202ENST00000432502 LCE1CQ5T751 118 aa4.67□□□□□ -1.66
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.58□□□□□ -1.68
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.36□□□□□ -1.71
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SVIPQ8NHG7 77 aa4.33□□□□□ -1.72
NUP50-AS1-202ENST00000432502 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.29□□□□□ -1.72
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.25□□□□□ -1.73
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
NUP50-AS1-202ENST00000432502 LCE1FQ5T754 118 aa4.19□□□□□ -1.74
NUP50-AS1-202ENST00000432502 LUZP6Q538Z0 58 aa4.15□□□□□ -1.75
NUP50-AS1-202ENST00000432502 H3BS24 57 aa4.05□□□□□ -1.76
NUP50-AS1-202ENST00000432502 LCE3EQ5T5B0 92 aa4□□□□□ -1.77
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.89□□□□□ -1.79
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PHGR1C9JFL3 82 aa3.83□□□□□ -1.8
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.55□□□□□ -1.84
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NDUFAF8A1L188 74 aa3.35□□□□□ -1.87
NUP50-AS1-202ENST00000432502 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.34□□□□□ -1.87
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PRM1P04553 51 aa2.93□□□□□ -1.94
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.93□□□□□ -1.94
NUP50-AS1-202ENST00000432502 INE1O15225 51 aa2.81□□□□□ -1.96
NUP50-AS1-202ENST00000432502 A0A0A0MQY5 61 aa2.78□□□□□ -1.96
NUP50-AS1-202ENST00000432502 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.39□□□□□ -2.03
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