RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431068.5

GNB2-208, Transcript of G protein subunit beta 2, human

TSL 5

Gene GNB2, Length 910 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GNB2-208	ENST00000431068	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
GNB2-208	ENST00000431068	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		6.24	□□□□□ -1.41
GNB2-208	ENST00000431068	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		6.22	□□□□□ -1.41
GNB2-208	ENST00000431068	MT1M	Q8N339	61 aa		6.19	□□□□□ -1.42
GNB2-208	ENST00000431068	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		6.15	□□□□□ -1.42
GNB2-208	ENST00000431068	UQCR11	O14957	56 aa		6.13	□□□□□ -1.43
GNB2-208	ENST00000431068		Q1T7F1	81 aa		6.13	□□□□□ -1.43
GNB2-208	ENST00000431068	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		6.12	□□□□□ -1.43
GNB2-208	ENST00000431068	MT1L	Q93083	61 aa		6.11	□□□□□ -1.43
GNB2-208	ENST00000431068		V9GYY9	64 aa		6.1	□□□□□ -1.43
GNB2-208	ENST00000431068	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		6.06	□□□□□ -1.44
GNB2-208	ENST00000431068	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		6.06	□□□□□ -1.44
GNB2-208	ENST00000431068	PSPHP1	O15172	72 aa		6.04	□□□□□ -1.44
GNB2-208	ENST00000431068	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		6.02	□□□□□ -1.45
GNB2-208	ENST00000431068	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		6.01	□□□□□ -1.45
GNB2-208	ENST00000431068	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		6	□□□□□ -1.45
GNB2-208	ENST00000431068	TNP1	P09430	55 aa		5.88	□□□□□ -1.47
GNB2-208	ENST00000431068	LCE3A	Q5TA76	89 aa		5.87	□□□□□ -1.47
GNB2-208	ENST00000431068	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		5.85	□□□□□ -1.47
GNB2-208	ENST00000431068		A6NED7	52 aa		5.82	□□□□□ -1.48
GNB2-208	ENST00000431068	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		5.81	□□□□□ -1.48
GNB2-208	ENST00000431068		K7ERS5	55 aa		5.79	□□□□□ -1.48
GNB2-208	ENST00000431068	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		5.78	□□□□□ -1.48
GNB2-208	ENST00000431068	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
GNB2-208	ENST00000431068	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		5.7	□□□□□ -1.5
GNB2-208	ENST00000431068	KRTAP12-4	P60329	112 aa		5.67	□□□□□ -1.5
GNB2-208	ENST00000431068	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		5.66	□□□□□ -1.5
GNB2-208	ENST00000431068	KRTAP12-3	P60328	96 aa		5.63	□□□□□ -1.51
GNB2-208	ENST00000431068	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
GNB2-208	ENST00000431068	BRK1	Q8WUW1	75 aa		5.57	□□□□□ -1.52
GNB2-208	ENST00000431068	PRO0628	Q9UI54	55 aa		5.55	□□□□□ -1.52
GNB2-208	ENST00000431068	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		5.54	□□□□□ -1.52
GNB2-208	ENST00000431068	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		5.51	□□□□□ -1.53
GNB2-208	ENST00000431068	ROMO1	P60602	79 aa		5.51	□□□□□ -1.53
GNB2-208	ENST00000431068	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		5.44	□□□□□ -1.54
GNB2-208	ENST00000431068	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
GNB2-208	ENST00000431068	MUC5AC	P98088	5654 aa		5.36	□□□□□ -1.55
GNB2-208	ENST00000431068	SVIP	Q8NHG7	77 aa		5.33	□□□□□ -1.56
GNB2-208	ENST00000431068	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		5.32	□□□□□ -1.56
GNB2-208	ENST00000431068	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	5.32	□□□□□ -1.56
GNB2-208	ENST00000431068	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.31	□□□□□ -1.56
GNB2-208	ENST00000431068	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		5.3	□□□□□ -1.56
GNB2-208	ENST00000431068	PMAIP1	Q13794	54 aa		5.29	□□□□□ -1.56
GNB2-208	ENST00000431068	KRTAP5-8	O75690	187 aa		5.27	□□□□□ -1.57
GNB2-208	ENST00000431068	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		5.21	□□□□□ -1.58
GNB2-208	ENST00000431068	MT1A	P04731	61 aa		5.19	□□□□□ -1.58
GNB2-208	ENST00000431068	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		5.19	□□□□□ -1.58
GNB2-208	ENST00000431068	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		5.18	□□□□□ -1.58
GNB2-208	ENST00000431068	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		5.14	□□□□□ -1.59
GNB2-208	ENST00000431068	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GNB2-208	ENST00000431068	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GNB2-208	ENST00000431068	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		5.05	□□□□□ -1.6
GNB2-208	ENST00000431068	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GNB2-208	ENST00000431068	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GNB2-208	ENST00000431068	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GNB2-208	ENST00000431068	MT3	P25713	68 aa		4.76	□□□□□ -1.65
GNB2-208	ENST00000431068	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.47	□□□□□ -1.69
GNB2-208	ENST00000431068	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.28	□□□□□ -1.72
GNB2-208	ENST00000431068	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		4.27	□□□□□ -1.73
GNB2-208	ENST00000431068	LCE1C	Q5T751	118 aa		4.15	□□□□□ -1.75
GNB2-208	ENST00000431068	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GNB2-208	ENST00000431068	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.04	□□□□□ -1.76
GNB2-208	ENST00000431068	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.95	□□□□□ -1.78
GNB2-208	ENST00000431068	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.84	□□□□□ -1.79
GNB2-208	ENST00000431068	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.8	□□□□□ -1.8
GNB2-208	ENST00000431068	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.77	□□□□□ -1.81
GNB2-208	ENST00000431068	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
GNB2-208	ENST00000431068	PHGR1	C9JFL3	82 aa		3.67	□□□□□ -1.82
GNB2-208	ENST00000431068		H3BS24	57 aa		3.63	□□□□□ -1.83
GNB2-208	ENST00000431068		A0A0A0MQY5	61 aa		3.6	□□□□□ -1.83
GNB2-208	ENST00000431068	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.59	□□□□□ -1.83
GNB2-208	ENST00000431068	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.41	□□□□□ -1.86
GNB2-208	ENST00000431068	INE1	O15225	51 aa		3.38	□□□□□ -1.87
GNB2-208	ENST00000431068	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		3.24	□□□□□ -1.89
GNB2-208	ENST00000431068	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.2	□□□□□ -1.9
GNB2-208	ENST00000431068	PRM1	P04553	51 aa		2.83	□□□□□ -1.96
GNB2-208	ENST00000431068	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.78	□□□□□ -1.96
GNB2-208	ENST00000431068	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		2.18	□□□□□ -2.06

Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.8 ms