RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429755.8

HOXB-AS3-201, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 435 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-201ENST00000429755 BRK1Q8WUW1 75 aa5.75□□□□□ -1.49
HOXB-AS3-201ENST00000429755 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MT1GP13640 62 aa5.67□□□□□ -1.5
HOXB-AS3-201ENST00000429755 TNP1P09430 55 aa5.64□□□□□ -1.51
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PP632Q6XCG6 107 aa5.63□□□□□ -1.51
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.61□□□□□ -1.51
HOXB-AS3-201ENST00000429755 ROMO1P60602 79 aa5.59□□□□□ -1.51
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.58□□□□□ -1.52
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.58□□□□□ -1.52
HOXB-AS3-201ENST00000429755 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.56□□□□□ -1.52
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LCE4AQ5TA78 99 aa5.55□□□□□ -1.52
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LCE1DQ5T752 114 aa5.5□□□□□ -1.53
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PRO0628Q9UI54 55 aa5.5□□□□□ -1.53
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MT1MQ8N339 61 aa5.49□□□□□ -1.53
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MT1LQ93083 61 aa5.47□□□□□ -1.53
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LCE3AQ5TA76 89 aa5.45□□□□□ -1.54
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PMAIP1Q13794 54 aa5.44□□□□□ -1.54
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.43□□□□□ -1.54
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MT4P47944 62 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.28□□□□□ -1.56
HOXB-AS3-201ENST00000429755 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.27□□□□□ -1.57
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KRTAP12-3P60328 96 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.24□□□□□ -1.57
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.13□□□□□ -1.59
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB-AS3-201ENST00000429755 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PRAC1Q96KF2 57 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.1□□□□□ -1.59
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.08□□□□□ -1.6
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.08□□□□□ -1.6
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.08□□□□□ -1.6
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.06□□□□□ -1.6
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KRTAP12-4P60329 112 aa5.03□□□□□ -1.6
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.9□□□□□ -1.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.85□□□□□ -1.63
HOXB-AS3-201ENST00000429755 SVIPQ8NHG7 77 aa4.8□□□□□ -1.64
HOXB-AS3-201ENST00000429755 H3BS24 57 aa4.75□□□□□ -1.65
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MT1AP04731 61 aa4.68□□□□□ -1.66
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.68□□□□□ -1.66
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.68□□□□□ -1.66
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.62□□□□□ -1.67
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.6□□□□□ -1.67
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.55□□□□□ -1.68
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KRTAP5-8O75690 187 aa4.52□□□□□ -1.69
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.44□□□□□ -1.7
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.34□□□□□ -1.71
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MT3P25713 68 aa4.32□□□□□ -1.72
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MUC5ACP98088 5654 aa4.31□□□□□ -1.72
HOXB-AS3-201ENST00000429755 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.3□□□□□ -1.72
HOXB-AS3-201ENST00000429755 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LUZP6Q538Z0 58 aa4.23□□□□□ -1.73
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.22□□□□□ -1.73
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LCE1EQ5T753 118 aa4.06□□□□□ -1.76
HOXB-AS3-201ENST00000429755 NDUFAF8A1L188 74 aa3.89□□□□□ -1.79
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.76□□□□□ -1.81
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LCE1CQ5T751 118 aa3.74□□□□□ -1.81
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.74□□□□□ -1.81
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.72□□□□□ -1.81
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.61□□□□□ -1.83
HOXB-AS3-201ENST00000429755 A0A0A0MQY5 61 aa3.51□□□□□ -1.85
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.48□□□□□ -1.85
HOXB-AS3-201ENST00000429755 LCE1FQ5T754 118 aa3.41□□□□□ -1.86
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.39□□□□□ -1.87
HOXB-AS3-201ENST00000429755 INE1O15225 51 aa3.25□□□□□ -1.89
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.07□□□□□ -1.92
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PHGR1C9JFL3 82 aa3.04□□□□□ -1.92
HOXB-AS3-201ENST00000429755 PRM1P04553 51 aa2.88□□□□□ -1.95
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.74□□□□□ -1.97
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.7□□□□□ -1.98
HOXB-AS3-201ENST00000429755 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.36□□□□□ -2.03
HOXB-AS3-201ENST00000429755 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.87□□□□□ -2.11
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.3 ms