RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 A8MUU9 505 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRK-211ENST00000429595 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRK-211ENST00000429595 SPATA8Q6RVD6 105 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRK-211ENST00000429595 C7orf65Q6ZTY9 151 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRK-211ENST00000429595 SPTSSBQ8NFR3 76 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRK-211ENST00000429595 A6NN06 94 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1B0GU69 56 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRK-211ENST00000429595 UQCR11O14957 56 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRK-211ENST00000429595 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.03□□□□□ -1.92
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PTPRK-211ENST00000429595 SPRR2BP35325 72 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRK-211ENST00000429595 SPRR2AP35326 72 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRK-211ENST00000429595 MIR22HGQ0VDD5 57 aa2.98□□□□□ -1.93
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PTPRK-211ENST00000429595 R4GN34 69 aa2.58□□□□□ -2
PTPRK-211ENST00000429595 SPINT4Q6UDR6 99 aa2.57□□□□□ -2
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PTPRK-211ENST00000429595 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa2.43□□□□□ -2.02
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PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRK-211ENST00000429595 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
PTPRK-211ENST00000429595 MT1EP04732 61 aa2.2□□□□□ -2.06
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa2.17□□□□□ -2.06
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP12-3P60328 96 aa2.15□□□□□ -2.07
PTPRK-211ENST00000429595 MT1MQ8N339 61 aa2.14□□□□□ -2.07
PTPRK-211ENST00000429595 INE1O15225 51 aa2.07□□□□□ -2.08
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa2.03□□□□□ -2.08
PTPRK-211ENST00000429595 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.09
PTPRK-211ENST00000429595 MT1LQ93083 61 aa2.02□□□□□ -2.09
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PTPRK-211ENST00000429595 MT1AP04731 61 aa1.73□□□□□ -2.13
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa1.72□□□□□ -2.13
PTPRK-211ENST00000429595 PHGR1C9JFL3 82 aa1.64□□□□□ -2.15
PTPRK-211ENST00000429595 PRM1P04553 51 aa1.39□□□□□ -2.19
PTPRK-211ENST00000429595 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.31□□□□□ -2.2
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.25□□□□□ -2.21
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