RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423069.1

CPT1B-206, Transcript of carnitine palmitoyltransferase 1B, human

TSL 5

Gene CPT1B, Length 719 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CPT1B-206	ENST00000423069	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		5.26	□□□□□ -1.57
CPT1B-206	ENST00000423069	PRAC1	Q96KF2	57 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CPT1B-206	ENST00000423069	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CPT1B-206	ENST00000423069	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CPT1B-206	ENST00000423069	MDN1	Q9NU22	5596 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CPT1B-206	ENST00000423069	MT1L	Q93083	61 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CPT1B-206	ENST00000423069	MT1G	P13640	62 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CPT1B-206	ENST00000423069	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.14	□□□□□ -1.59
CPT1B-206	ENST00000423069	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		5.14	□□□□□ -1.59
CPT1B-206	ENST00000423069	SPRR2D	P22532	72 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CPT1B-206	ENST00000423069	NEB	P20929	6669 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CPT1B-206	ENST00000423069	MT1M	Q8N339	61 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CPT1B-206	ENST00000423069	SVIP	Q8NHG7	77 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CPT1B-206	ENST00000423069	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		5	□□□□□ -1.61
CPT1B-206	ENST00000423069	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CPT1B-206	ENST00000423069	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CPT1B-206	ENST00000423069	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CPT1B-206	ENST00000423069	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPT1B-206	ENST00000423069	LCE3B	Q5TA77	95 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CPT1B-206	ENST00000423069	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPT1B-206	ENST00000423069	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPT1B-206	ENST00000423069	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPT1B-206	ENST00000423069	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CPT1B-206	ENST00000423069	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CPT1B-206	ENST00000423069	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CPT1B-206	ENST00000423069	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CPT1B-206	ENST00000423069	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CPT1B-206	ENST00000423069	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CPT1B-206	ENST00000423069	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CPT1B-206	ENST00000423069	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.46	□□□□□ -1.7
CPT1B-206	ENST00000423069	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.46	□□□□□ -1.7
CPT1B-206	ENST00000423069	MT4	P47944	62 aa		4.44	□□□□□ -1.7
CPT1B-206	ENST00000423069	MT1A	P04731	61 aa		4.43	□□□□□ -1.7
CPT1B-206	ENST00000423069	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.42	□□□□□ -1.7
CPT1B-206	ENST00000423069	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CPT1B-206	ENST00000423069	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CPT1B-206	ENST00000423069	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CPT1B-206	ENST00000423069	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CPT1B-206	ENST00000423069	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CPT1B-206	ENST00000423069	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CPT1B-206	ENST00000423069	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CPT1B-206	ENST00000423069	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CPT1B-206	ENST00000423069	MT3	P25713	68 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CPT1B-206	ENST00000423069	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CPT1B-206	ENST00000423069	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CPT1B-206	ENST00000423069	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CPT1B-206	ENST00000423069	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		3.86	□□□□□ -1.79
CPT1B-206	ENST00000423069	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CPT1B-206	ENST00000423069	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CPT1B-206	ENST00000423069	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CPT1B-206	ENST00000423069	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		3.7	□□□□□ -1.82
CPT1B-206	ENST00000423069	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.65	□□□□□ -1.82
CPT1B-206	ENST00000423069	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.6	□□□□□ -1.83
CPT1B-206	ENST00000423069	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.6	□□□□□ -1.83
CPT1B-206	ENST00000423069	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		3.6	□□□□□ -1.83
CPT1B-206	ENST00000423069	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.59	□□□□□ -1.83
CPT1B-206	ENST00000423069		A0A0A0MQY5	61 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CPT1B-206	ENST00000423069	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.52	□□□□□ -1.85
CPT1B-206	ENST00000423069	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.39	□□□□□ -1.87
CPT1B-206	ENST00000423069	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CPT1B-206	ENST00000423069	INE1	O15225	51 aa		3.37	□□□□□ -1.87
CPT1B-206	ENST00000423069	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CPT1B-206	ENST00000423069	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CPT1B-206	ENST00000423069	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.3	□□□□□ -1.88
CPT1B-206	ENST00000423069	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
CPT1B-206	ENST00000423069	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
CPT1B-206	ENST00000423069	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
CPT1B-206	ENST00000423069		H3BS24	57 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CPT1B-206	ENST00000423069	PRM1	P04553	51 aa		2.95	□□□□□ -1.94
CPT1B-206	ENST00000423069	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		2.94	□□□□□ -1.94
CPT1B-206	ENST00000423069	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		2.87	□□□□□ -1.95
CPT1B-206	ENST00000423069	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.86	□□□□□ -1.95
CPT1B-206	ENST00000423069	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.79	□□□□□ -1.96
CPT1B-206	ENST00000423069	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.57	□□□□□ -2
CPT1B-206	ENST00000423069	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.54	□□□□□ -2
CPT1B-206	ENST00000423069	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.22	□□□□□ -2.05
CPT1B-206	ENST00000423069	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.73	□□□□□ -2.13
CPT1B-206	ENST00000423069	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.6	□□□□□ -2.15

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