RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421019.1

SMIM25-201, Transcript of small integral membrane protein 25, humanhuman

TSL 2

Gene SMIM25, Length 686 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM25-201ENST00000421019 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.35□□□□□ -1.71
SMIM25-201ENST00000421019 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.32□□□□□ -1.72
SMIM25-201ENST00000421019 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa4.3□□□□□ -1.72
SMIM25-201ENST00000421019 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.28□□□□□ -1.72
SMIM25-201ENST00000421019 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
SMIM25-201ENST00000421019 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.18□□□□□ -1.74
SMIM25-201ENST00000421019 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.15□□□□□ -1.75
SMIM25-201ENST00000421019 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.11□□□□□ -1.75
SMIM25-201ENST00000421019 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.1□□□□□ -1.75
SMIM25-201ENST00000421019 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.09□□□□□ -1.75
SMIM25-201ENST00000421019 MT1EP04732 61 aa4.07□□□□□ -1.76
SMIM25-201ENST00000421019 LCE1DQ5T752 114 aa4.07□□□□□ -1.76
SMIM25-201ENST00000421019 PP632Q6XCG6 107 aa4.05□□□□□ -1.76
SMIM25-201ENST00000421019 TNP1P09430 55 aa4.04□□□□□ -1.76
SMIM25-201ENST00000421019 LCE4AQ5TA78 99 aa4.02□□□□□ -1.77
SMIM25-201ENST00000421019 KRTAP23-1A1A580 65 aa4□□□□□ -1.77
SMIM25-201ENST00000421019 MT1GP13640 62 aa4□□□□□ -1.77
SMIM25-201ENST00000421019 MT4P47944 62 aa3.99□□□□□ -1.77
SMIM25-201ENST00000421019 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.92□□□□□ -1.78
SMIM25-201ENST00000421019 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.91□□□□□ -1.78
SMIM25-201ENST00000421019 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.9□□□□□ -1.79
SMIM25-201ENST00000421019 MT1MQ8N339 61 aa3.9□□□□□ -1.79
SMIM25-201ENST00000421019 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.9□□□□□ -1.79
SMIM25-201ENST00000421019 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.88□□□□□ -1.79
SMIM25-201ENST00000421019 MT1LQ93083 61 aa3.86□□□□□ -1.79
SMIM25-201ENST00000421019 LCE3AQ5TA76 89 aa3.85□□□□□ -1.79
SMIM25-201ENST00000421019 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.84□□□□□ -1.79
SMIM25-201ENST00000421019 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.83□□□□□ -1.8
SMIM25-201ENST00000421019 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.81□□□□□ -1.8
SMIM25-201ENST00000421019 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.79□□□□□ -1.8
SMIM25-201ENST00000421019 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.77□□□□□ -1.81
SMIM25-201ENST00000421019 KRTAP12-3P60328 96 aa3.73□□□□□ -1.81
SMIM25-201ENST00000421019 NDUFAF8A1L188 74 aa3.68□□□□□ -1.82
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SMIM25-201ENST00000421019 LUZP6Q538Z0 58 aa3.66□□□□□ -1.82
SMIM25-201ENST00000421019 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.65□□□□□ -1.83
SMIM25-201ENST00000421019 H3BS24 57 aa3.63□□□□□ -1.83
SMIM25-201ENST00000421019 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.63□□□□□ -1.83
SMIM25-201ENST00000421019 KRTAP12-4P60329 112 aa3.61□□□□□ -1.83
SMIM25-201ENST00000421019 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.6□□□□□ -1.83
SMIM25-201ENST00000421019 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
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SMIM25-201ENST00000421019 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.47□□□□□ -1.85
SMIM25-201ENST00000421019 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.45□□□□□ -1.86
SMIM25-201ENST00000421019 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.43□□□□□ -1.86
SMIM25-201ENST00000421019 A0A0A0MQY5 61 aa3.37□□□□□ -1.87
SMIM25-201ENST00000421019 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.34□□□□□ -1.87
SMIM25-201ENST00000421019 KRTAP5-8O75690 187 aa3.31□□□□□ -1.88
SMIM25-201ENST00000421019 MT1AP04731 61 aa3.28□□□□□ -1.88
SMIM25-201ENST00000421019 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.27□□□□□ -1.89
SMIM25-201ENST00000421019 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.26□□□□□ -1.89
SMIM25-201ENST00000421019 MUC5ACP98088 5654 aa3.26□□□□□ -1.89
SMIM25-201ENST00000421019 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
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SMIM25-201ENST00000421019 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.21□□□□□ -1.9
SMIM25-201ENST00000421019 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.21□□□□□ -1.9
SMIM25-201ENST00000421019 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.18□□□□□ -1.9
SMIM25-201ENST00000421019 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
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SMIM25-201ENST00000421019 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.05□□□□□ -1.92
SMIM25-201ENST00000421019 MT3P25713 68 aa3.03□□□□□ -1.92
SMIM25-201ENST00000421019 LCE1EQ5T753 118 aa2.85□□□□□ -1.95
SMIM25-201ENST00000421019 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.7□□□□□ -1.98
SMIM25-201ENST00000421019 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.69□□□□□ -1.98
SMIM25-201ENST00000421019 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.69□□□□□ -1.98
SMIM25-201ENST00000421019 LCE1CQ5T751 118 aa2.64□□□□□ -1.99
SMIM25-201ENST00000421019 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.59□□□□□ -1.99
SMIM25-201ENST00000421019 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.54□□□□□ -2
SMIM25-201ENST00000421019 LCE1FQ5T754 118 aa2.43□□□□□ -2.02
SMIM25-201ENST00000421019 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.42□□□□□ -2.02
SMIM25-201ENST00000421019 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
SMIM25-201ENST00000421019 PHGR1C9JFL3 82 aa2.3□□□□□ -2.04
SMIM25-201ENST00000421019 PRM1P04553 51 aa2.28□□□□□ -2.04
SMIM25-201ENST00000421019 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.15□□□□□ -2.07
SMIM25-201ENST00000421019 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.01□□□□□ -2.09
SMIM25-201ENST00000421019 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.01□□□□□ -2.09
SMIM25-201ENST00000421019 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.77□□□□□ -2.13
SMIM25-201ENST00000421019 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.36□□□□□ -2.19
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