RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417058.6

CD27-AS1-202, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD27-AS1, Length 1,497 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-202ENST00000417058 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.95□□□□□ -1.78
CD27-AS1-202ENST00000417058 KRTAP10-12P60413 245 aa3.93□□□□□ -1.78
CD27-AS1-202ENST00000417058 KMT2DO14686 5537 aa3.93□□□□□ -1.78
CD27-AS1-202ENST00000417058 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
CD27-AS1-202ENST00000417058 LCE1EQ5T753 118 aa3.91□□□□□ -1.78
CD27-AS1-202ENST00000417058 TNP1P09430 55 aa3.89□□□□□ -1.79
CD27-AS1-202ENST00000417058 ROMO1P60602 79 aa3.87□□□□□ -1.79
CD27-AS1-202ENST00000417058 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.87□□□□□ -1.79
CD27-AS1-202ENST00000417058 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.85□□□□□ -1.79
CD27-AS1-202ENST00000417058 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.82□□□□□ -1.8
CD27-AS1-202ENST00000417058 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.78□□□□□ -1.8
CD27-AS1-202ENST00000417058 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.78□□□□□ -1.8
CD27-AS1-202ENST00000417058 A0A0A0MQY5 61 aa3.77□□□□□ -1.81
CD27-AS1-202ENST00000417058 LCE3AQ5TA76 89 aa3.76□□□□□ -1.81
CD27-AS1-202ENST00000417058 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.75□□□□□ -1.81
CD27-AS1-202ENST00000417058 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.71□□□□□ -1.82
CD27-AS1-202ENST00000417058 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.7□□□□□ -1.82
CD27-AS1-202ENST00000417058 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.69□□□□□ -1.82
CD27-AS1-202ENST00000417058 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.68□□□□□ -1.82
CD27-AS1-202ENST00000417058 MDN1Q9NU22 5596 aa3.68□□□□□ -1.82
CD27-AS1-202ENST00000417058 PP632Q6XCG6 107 aa3.67□□□□□ -1.82
CD27-AS1-202ENST00000417058 MT1EP04732 61 aa3.64□□□□□ -1.83
CD27-AS1-202ENST00000417058 NEBP20929 6669 aa3.63□□□□□ -1.83
CD27-AS1-202ENST00000417058 KRTAP12-3P60328 96 aa3.62□□□□□ -1.83
CD27-AS1-202ENST00000417058 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.57□□□□□ -1.84
CD27-AS1-202ENST00000417058 PRAC1Q96KF2 57 aa3.57□□□□□ -1.84
CD27-AS1-202ENST00000417058 SPRR2EP22531 72 aa3.54□□□□□ -1.84
CD27-AS1-202ENST00000417058 SPRR2BP35325 72 aa3.54□□□□□ -1.84
CD27-AS1-202ENST00000417058 SPRR2AP35326 72 aa3.54□□□□□ -1.84
CD27-AS1-202ENST00000417058 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.54□□□□□ -1.84
CD27-AS1-202ENST00000417058 MT1LQ93083 61 aa3.54□□□□□ -1.84
CD27-AS1-202ENST00000417058 MT1GP13640 62 aa3.49□□□□□ -1.85
CD27-AS1-202ENST00000417058 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.48□□□□□ -1.85
CD27-AS1-202ENST00000417058 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.47□□□□□ -1.85
CD27-AS1-202ENST00000417058 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.47□□□□□ -1.85
CD27-AS1-202ENST00000417058 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.45□□□□□ -1.86
CD27-AS1-202ENST00000417058 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
CD27-AS1-202ENST00000417058 MT1MQ8N339 61 aa3.43□□□□□ -1.86
CD27-AS1-202ENST00000417058 SPRR2DP22532 72 aa3.42□□□□□ -1.86
CD27-AS1-202ENST00000417058 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.42□□□□□ -1.86
CD27-AS1-202ENST00000417058 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.41□□□□□ -1.86
CD27-AS1-202ENST00000417058 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.41□□□□□ -1.86
CD27-AS1-202ENST00000417058 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.37□□□□□ -1.87
CD27-AS1-202ENST00000417058 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.31□□□□□ -1.88
CD27-AS1-202ENST00000417058 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.2□□□□□ -1.9
CD27-AS1-202ENST00000417058 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.19□□□□□ -1.9
CD27-AS1-202ENST00000417058 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
CD27-AS1-202ENST00000417058 NDUFAF8A1L188 74 aa3.07□□□□□ -1.92
CD27-AS1-202ENST00000417058 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
CD27-AS1-202ENST00000417058 KRTAP5-8O75690 187 aa3.02□□□□□ -1.93
CD27-AS1-202ENST00000417058 MT1AP04731 61 aa3.01□□□□□ -1.93
CD27-AS1-202ENST00000417058 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.97□□□□□ -1.93
CD27-AS1-202ENST00000417058 MT4P47944 62 aa2.97□□□□□ -1.93
CD27-AS1-202ENST00000417058 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.97□□□□□ -1.93
CD27-AS1-202ENST00000417058 LUZP6Q538Z0 58 aa2.94□□□□□ -1.94
CD27-AS1-202ENST00000417058 KRTAP12-4P60329 112 aa2.93□□□□□ -1.94
CD27-AS1-202ENST00000417058 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.88□□□□□ -1.95
CD27-AS1-202ENST00000417058 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.83□□□□□ -1.96
CD27-AS1-202ENST00000417058 MT3P25713 68 aa2.82□□□□□ -1.96
CD27-AS1-202ENST00000417058 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.77□□□□□ -1.97
CD27-AS1-202ENST00000417058 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.77□□□□□ -1.97
CD27-AS1-202ENST00000417058 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.73□□□□□ -1.97
CD27-AS1-202ENST00000417058 INE1O15225 51 aa2.61□□□□□ -1.99
CD27-AS1-202ENST00000417058 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.6□□□□□ -1.99
CD27-AS1-202ENST00000417058 LCE1FQ5T754 118 aa2.52□□□□□ -2.01
CD27-AS1-202ENST00000417058 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.5□□□□□ -2.01
CD27-AS1-202ENST00000417058 LCE1CQ5T751 118 aa2.46□□□□□ -2.02
CD27-AS1-202ENST00000417058 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.46□□□□□ -2.02
CD27-AS1-202ENST00000417058 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.4□□□□□ -2.02
CD27-AS1-202ENST00000417058 MUC5ACP98088 5654 aa2.37□□□□□ -2.03
CD27-AS1-202ENST00000417058 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
CD27-AS1-202ENST00000417058 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
CD27-AS1-202ENST00000417058 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.16□□□□□ -2.06
CD27-AS1-202ENST00000417058 PRM1P04553 51 aa2.01□□□□□ -2.09
CD27-AS1-202ENST00000417058 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.96□□□□□ -2.1
CD27-AS1-202ENST00000417058 PHGR1C9JFL3 82 aa1.73□□□□□ -2.13
CD27-AS1-202ENST00000417058 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.2□□□□□ -2.22
CD27-AS1-202ENST00000417058 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.12□□□□□ -2.23
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.3 ms