RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MT3P25713 68 aa5.97□□□□□ -1.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.94□□□□□ -1.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PSPHP1O15172 72 aa5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPRR2EP22531 72 aa5.84□□□□□ -1.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPRR2BP35325 72 aa5.84□□□□□ -1.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPRR2AP35326 72 aa5.84□□□□□ -1.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 K7ERS5 55 aa5.83□□□□□ -1.48
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TNP1P09430 55 aa5.82□□□□□ -1.48
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.82□□□□□ -1.48
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A6NED7 52 aa5.78□□□□□ -1.48
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MT1EP04732 61 aa5.67□□□□□ -1.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPRR2DP22532 72 aa5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.66□□□□□ -1.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LCE3AQ5TA76 89 aa5.64□□□□□ -1.51
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.59□□□□□ -1.51
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.59□□□□□ -1.51
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MT1GP13640 62 aa5.5□□□□□ -1.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LCE1FQ5T754 118 aa5.5□□□□□ -1.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.5□□□□□ -1.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PP632Q6XCG6 107 aa5.48□□□□□ -1.53
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP12-3P60328 96 aa5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MT1LQ93083 61 aa5.46□□□□□ -1.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ROMO1P60602 79 aa5.44□□□□□ -1.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MT1MQ8N339 61 aa5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BRK1Q8WUW1 75 aa5.23□□□□□ -1.57
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.17□□□□□ -1.58
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.16□□□□□ -1.58
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.08□□□□□ -1.6
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRO0628Q9UI54 55 aa5.01□□□□□ -1.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5□□□□□ -1.61
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PMAIP1Q13794 54 aa4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MT4P47944 62 aa4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LUZP6Q538Z0 58 aa4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP12-4P60329 112 aa4.76□□□□□ -1.65
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.74□□□□□ -1.65
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.71□□□□□ -1.66
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.68□□□□□ -1.66
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.68□□□□□ -1.66
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MT1AP04731 61 aa4.67□□□□□ -1.66
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LCE1EQ5T753 118 aa4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.64□□□□□ -1.67
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.59□□□□□ -1.68
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.58□□□□□ -1.68
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.46□□□□□ -1.7
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.34□□□□□ -1.71
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.27□□□□□ -1.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP5-8O75690 187 aa4.06□□□□□ -1.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.91□□□□□ -1.78
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MUC5ACP98088 5654 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LCE1CQ5T751 118 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.15□□□□□ -1.91
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1BP2-201ENST00000398621 INE1O15225 51 aa2.87□□□□□ -1.95
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PHGR1C9JFL3 82 aa2.77□□□□□ -1.97
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRM1P04553 51 aa2.77□□□□□ -1.97
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.49□□□□□ -2.01
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2□□□□□ -2.09
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.79□□□□□ -2.12
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