RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375425.9

NELFE-201, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene NELFE, Length 1,405 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-201ENST00000375425 A8MU10 97 aa5.19□□□□□ -1.58
NELFE-201ENST00000375425 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.19□□□□□ -1.58
NELFE-201ENST00000375425 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.19□□□□□ -1.58
NELFE-201ENST00000375425 UQCR11O14957 56 aa5.15□□□□□ -1.58
NELFE-201ENST00000375425 MT1GP13640 62 aa5.15□□□□□ -1.58
NELFE-201ENST00000375425 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.11□□□□□ -1.59
NELFE-201ENST00000375425 PP632Q6XCG6 107 aa5.1□□□□□ -1.59
NELFE-201ENST00000375425 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.08□□□□□ -1.6
NELFE-201ENST00000375425 MT1MQ8N339 61 aa5.06□□□□□ -1.6
NELFE-201ENST00000375425 MT1LQ93083 61 aa5.06□□□□□ -1.6
NELFE-201ENST00000375425 LCE1DQ5T752 114 aa5.04□□□□□ -1.6
NELFE-201ENST00000375425 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.02□□□□□ -1.61
NELFE-201ENST00000375425 LCE3AQ5TA76 89 aa5□□□□□ -1.61
NELFE-201ENST00000375425 LCE4AQ5TA78 99 aa5□□□□□ -1.61
NELFE-201ENST00000375425 C10orf95Q9H7T3 257 aa5□□□□□ -1.61
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NELFE-201ENST00000375425 MT4P47944 62 aa4.98□□□□□ -1.61
NELFE-201ENST00000375425 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.97□□□□□ -1.61
NELFE-201ENST00000375425 K7ERS5 55 aa4.94□□□□□ -1.62
NELFE-201ENST00000375425 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.9□□□□□ -1.63
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NELFE-201ENST00000375425 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.83□□□□□ -1.64
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NELFE-201ENST00000375425 KRTAP12-3P60328 96 aa4.81□□□□□ -1.64
NELFE-201ENST00000375425 PRAC1Q96KF2 57 aa4.8□□□□□ -1.64
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NELFE-201ENST00000375425 ROMO1P60602 79 aa4.67□□□□□ -1.66
NELFE-201ENST00000375425 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
NELFE-201ENST00000375425 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.63□□□□□ -1.67
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NELFE-201ENST00000375425 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.61□□□□□ -1.67
NELFE-201ENST00000375425 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
NELFE-201ENST00000375425 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.58□□□□□ -1.68
NELFE-201ENST00000375425 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.58□□□□□ -1.68
NELFE-201ENST00000375425 H3BS24 57 aa4.58□□□□□ -1.68
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NELFE-201ENST00000375425 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.29□□□□□ -1.72
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NELFE-201ENST00000375425 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.25□□□□□ -1.73
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NELFE-201ENST00000375425 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.18□□□□□ -1.74
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NELFE-201ENST00000375425 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.12□□□□□ -1.75
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NELFE-201ENST00000375425 MT3P25713 68 aa3.95□□□□□ -1.78
NELFE-201ENST00000375425 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.93□□□□□ -1.78
NELFE-201ENST00000375425 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.86□□□□□ -1.79
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NELFE-201ENST00000375425 INE1O15225 51 aa3.4□□□□□ -1.87
NELFE-201ENST00000375425 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.4□□□□□ -1.87
NELFE-201ENST00000375425 LCE1CQ5T751 118 aa3.38□□□□□ -1.87
NELFE-201ENST00000375425 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.17□□□□□ -1.9
NELFE-201ENST00000375425 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.06□□□□□ -1.92
NELFE-201ENST00000375425 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
NELFE-201ENST00000375425 LCE1FQ5T754 118 aa3.01□□□□□ -1.93
NELFE-201ENST00000375425 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.96□□□□□ -1.94
NELFE-201ENST00000375425 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.83□□□□□ -1.96
NELFE-201ENST00000375425 PHGR1C9JFL3 82 aa2.76□□□□□ -1.97
NELFE-201ENST00000375425 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.62□□□□□ -1.99
NELFE-201ENST00000375425 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.62□□□□□ -1.99
NELFE-201ENST00000375425 PRM1P04553 51 aa2.42□□□□□ -2.02
NELFE-201ENST00000375425 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.09□□□□□ -2.07
NELFE-201ENST00000375425 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.75□□□□□ -2.13
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