RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375391.5

TMCO3-201, Transcript of transmembrane and coiled-coil domains 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMCO3, Length 2,132 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3-201ENST00000375391 KRTAP5-9P26371 169 aa7.46□□□□□ -1.21
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TMCO3-201ENST00000375391 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa7.44□□□□□ -1.22
TMCO3-201ENST00000375391 MT1EP04732 61 aa7.43□□□□□ -1.22
TMCO3-201ENST00000375391 LCE1AQ5T7P2 110 aa7.24□□□□□ -1.25
TMCO3-201ENST00000375391 MT1LQ93083 61 aa7.24□□□□□ -1.25
TMCO3-201ENST00000375391 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
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TMCO3-201ENST00000375391 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.41□□□□□ -1.38
TMCO3-201ENST00000375391 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.41□□□□□ -1.38
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TMCO3-201ENST00000375391 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.53□□□□□ -1.52
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TMCO3-201ENST00000375391 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.19□□□□□ -1.74
TMCO3-201ENST00000375391 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
TMCO3-201ENST00000375391 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
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TMCO3-201ENST00000375391 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4□□□□□ -1.77
TMCO3-201ENST00000375391 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.73□□□□□ -1.81
TMCO3-201ENST00000375391 LCE1FQ5T754 118 aa3.6□□□□□ -1.83
TMCO3-201ENST00000375391 PHGR1C9JFL3 82 aa3.48□□□□□ -1.85
TMCO3-201ENST00000375391 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.44□□□□□ -1.86
TMCO3-201ENST00000375391 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.1□□□□□ -1.91
TMCO3-201ENST00000375391 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.17□□□□□ -2.06
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