RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373619.7

CITED1-202, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 886 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-202ENST00000373619 Q1T7F1 81 aa5.06□□□□□ -1.6
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CITED1-202ENST00000373619 TNP1P09430 55 aa5.04□□□□□ -1.6
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CITED1-202ENST00000373619 V9GYY9 64 aa5.03□□□□□ -1.6
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CITED1-202ENST00000373619 MT1MQ8N339 61 aa5□□□□□ -1.61
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CITED1-202ENST00000373619 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
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CITED1-202ENST00000373619 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.31□□□□□ -1.72
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CITED1-202ENST00000373619 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.22□□□□□ -1.73
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CITED1-202ENST00000373619 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.07□□□□□ -1.76
CITED1-202ENST00000373619 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.07□□□□□ -1.76
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CITED1-202ENST00000373619 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
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CITED1-202ENST00000373619 MT3P25713 68 aa3.93□□□□□ -1.78
CITED1-202ENST00000373619 PRO0628Q9UI54 55 aa3.85□□□□□ -1.79
CITED1-202ENST00000373619 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.82□□□□□ -1.8
CITED1-202ENST00000373619 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.65□□□□□ -1.83
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CITED1-202ENST00000373619 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.46□□□□□ -1.86
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CITED1-202ENST00000373619 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.23□□□□□ -1.89
CITED1-202ENST00000373619 LUZP6Q538Z0 58 aa3.2□□□□□ -1.9
CITED1-202ENST00000373619 NDUFAF8A1L188 74 aa3.11□□□□□ -1.91
CITED1-202ENST00000373619 LCE1FQ5T754 118 aa3.08□□□□□ -1.92
CITED1-202ENST00000373619 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.06□□□□□ -1.92
CITED1-202ENST00000373619 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.06□□□□□ -1.92
CITED1-202ENST00000373619 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
CITED1-202ENST00000373619 PHGR1C9JFL3 82 aa2.89□□□□□ -1.95
CITED1-202ENST00000373619 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.75□□□□□ -1.97
CITED1-202ENST00000373619 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.55□□□□□ -2
CITED1-202ENST00000373619 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.52□□□□□ -2.01
CITED1-202ENST00000373619 PRM1P04553 51 aa2.39□□□□□ -2.03
CITED1-202ENST00000373619 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.22□□□□□ -2.05
CITED1-202ENST00000373619 INE1O15225 51 aa2.16□□□□□ -2.06
CITED1-202ENST00000373619 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.72□□□□□ -2.13
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.5 ms