RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359957.7

BRMS1-201, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BRMS1, Length 1,445 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-201ENST00000359957 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.54□□□□□ -1.52
BRMS1-201ENST00000359957 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.54□□□□□ -1.52
BRMS1-201ENST00000359957 SPRR2DP22532 72 aa5.53□□□□□ -1.52
BRMS1-201ENST00000359957 LCE3AQ5TA76 89 aa5.49□□□□□ -1.53
BRMS1-201ENST00000359957 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.44□□□□□ -1.54
BRMS1-201ENST00000359957 H3BS24 57 aa5.42□□□□□ -1.54
BRMS1-201ENST00000359957 MT1EP04732 61 aa5.4□□□□□ -1.54
BRMS1-201ENST00000359957 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.38□□□□□ -1.55
BRMS1-201ENST00000359957 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.38□□□□□ -1.55
BRMS1-201ENST00000359957 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.38□□□□□ -1.55
BRMS1-201ENST00000359957 LCE3BQ5TA77 95 aa5.35□□□□□ -1.55
BRMS1-201ENST00000359957 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.35□□□□□ -1.55
BRMS1-201ENST00000359957 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.31□□□□□ -1.56
BRMS1-201ENST00000359957 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.3□□□□□ -1.56
BRMS1-201ENST00000359957 MT1GP13640 62 aa5.26□□□□□ -1.57
BRMS1-201ENST00000359957 KRTAP12-3P60328 96 aa5.25□□□□□ -1.57
BRMS1-201ENST00000359957 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.25□□□□□ -1.57
BRMS1-201ENST00000359957 MT1LQ93083 61 aa5.2□□□□□ -1.58
BRMS1-201ENST00000359957 MT1MQ8N339 61 aa5.14□□□□□ -1.59
BRMS1-201ENST00000359957 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
BRMS1-201ENST00000359957 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.06□□□□□ -1.6
BRMS1-201ENST00000359957 NDUFAF8A1L188 74 aa5.05□□□□□ -1.6
BRMS1-201ENST00000359957 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.97□□□□□ -1.61
BRMS1-201ENST00000359957 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.95□□□□□ -1.62
BRMS1-201ENST00000359957 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.92□□□□□ -1.62
BRMS1-201ENST00000359957 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.91□□□□□ -1.62
BRMS1-201ENST00000359957 LCE4AQ5TA78 99 aa4.89□□□□□ -1.63
BRMS1-201ENST00000359957 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.89□□□□□ -1.63
BRMS1-201ENST00000359957 LUZP6Q538Z0 58 aa4.88□□□□□ -1.63
BRMS1-201ENST00000359957 MT4P47944 62 aa4.8□□□□□ -1.64
BRMS1-201ENST00000359957 LCE1DQ5T752 114 aa4.8□□□□□ -1.64
BRMS1-201ENST00000359957 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.78□□□□□ -1.64
BRMS1-201ENST00000359957 A0A0A0MQY5 61 aa4.73□□□□□ -1.65
BRMS1-201ENST00000359957 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.71□□□□□ -1.65
BRMS1-201ENST00000359957 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.69□□□□□ -1.66
BRMS1-201ENST00000359957 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.68□□□□□ -1.66
BRMS1-201ENST00000359957 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
BRMS1-201ENST00000359957 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.65□□□□□ -1.66
BRMS1-201ENST00000359957 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.63□□□□□ -1.67
BRMS1-201ENST00000359957 KRTAP12-4P60329 112 aa4.6□□□□□ -1.67
BRMS1-201ENST00000359957 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.52□□□□□ -1.69
BRMS1-201ENST00000359957 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.49□□□□□ -1.69
BRMS1-201ENST00000359957 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
BRMS1-201ENST00000359957 MT1AP04731 61 aa4.44□□□□□ -1.7
BRMS1-201ENST00000359957 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.38□□□□□ -1.71
BRMS1-201ENST00000359957 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.37□□□□□ -1.71
BRMS1-201ENST00000359957 INE1O15225 51 aa4.34□□□□□ -1.71
BRMS1-201ENST00000359957 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.34□□□□□ -1.71
BRMS1-201ENST00000359957 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.27□□□□□ -1.73
BRMS1-201ENST00000359957 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.21□□□□□ -1.74
BRMS1-201ENST00000359957 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.17□□□□□ -1.74
BRMS1-201ENST00000359957 MT3P25713 68 aa4.09□□□□□ -1.75
BRMS1-201ENST00000359957 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.09□□□□□ -1.75
BRMS1-201ENST00000359957 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
BRMS1-201ENST00000359957 MUC5ACP98088 5654 aa3.93□□□□□ -1.78
BRMS1-201ENST00000359957 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.93□□□□□ -1.78
BRMS1-201ENST00000359957 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
BRMS1-201ENST00000359957 KRTAP5-8O75690 187 aa3.92□□□□□ -1.78
BRMS1-201ENST00000359957 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.76□□□□□ -1.81
BRMS1-201ENST00000359957 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.73□□□□□ -1.81
BRMS1-201ENST00000359957 LCE1EQ5T753 118 aa3.7□□□□□ -1.82
BRMS1-201ENST00000359957 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.7□□□□□ -1.82
BRMS1-201ENST00000359957 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.61□□□□□ -1.83
BRMS1-201ENST00000359957 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.47□□□□□ -1.85
BRMS1-201ENST00000359957 LCE1CQ5T751 118 aa3.42□□□□□ -1.86
BRMS1-201ENST00000359957 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.42□□□□□ -1.86
BRMS1-201ENST00000359957 PRM1P04553 51 aa3.2□□□□□ -1.9
BRMS1-201ENST00000359957 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
BRMS1-201ENST00000359957 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.08□□□□□ -1.92
BRMS1-201ENST00000359957 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.05□□□□□ -1.92
BRMS1-201ENST00000359957 LCE1FQ5T754 118 aa2.98□□□□□ -1.93
BRMS1-201ENST00000359957 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.86□□□□□ -1.95
BRMS1-201ENST00000359957 PHGR1C9JFL3 82 aa2.67□□□□□ -1.98
BRMS1-201ENST00000359957 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.6□□□□□ -1.99
BRMS1-201ENST00000359957 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.41□□□□□ -2.02
BRMS1-201ENST00000359957 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.01□□□□□ -2.09
BRMS1-201ENST00000359957 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.73□□□□□ -2.13
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 610.7 ms