RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.75□□□□□ -1.33
SPNS1-204ENST00000352260 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.74□□□□□ -1.33
SPNS1-204ENST00000352260 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.63□□□□□ -1.35
SPNS1-204ENST00000352260 MT1EP04732 61 aa6.61□□□□□ -1.35
SPNS1-204ENST00000352260 KRTAP5-9P26371 169 aa6.59□□□□□ -1.35
SPNS1-204ENST00000352260 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.55□□□□□ -1.36
SPNS1-204ENST00000352260 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.54□□□□□ -1.36
SPNS1-204ENST00000352260 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.54□□□□□ -1.36
SPNS1-204ENST00000352260 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.54□□□□□ -1.36
SPNS1-204ENST00000352260 MT1LQ93083 61 aa6.52□□□□□ -1.37
SPNS1-204ENST00000352260 MDN1Q9NU22 5596 aa6.5□□□□□ -1.37
SPNS1-204ENST00000352260 NEBP20929 6669 aa6.48□□□□□ -1.37
SPNS1-204ENST00000352260 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.44□□□□□ -1.38
SPNS1-204ENST00000352260 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.4□□□□□ -1.38
SPNS1-204ENST00000352260 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.4□□□□□ -1.39
SPNS1-204ENST00000352260 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.29□□□□□ -1.4
SPNS1-204ENST00000352260 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.27□□□□□ -1.41
SPNS1-204ENST00000352260 SPRR2EP22531 72 aa6.26□□□□□ -1.41
SPNS1-204ENST00000352260 SPRR2BP35325 72 aa6.26□□□□□ -1.41
SPNS1-204ENST00000352260 SPRR2AP35326 72 aa6.26□□□□□ -1.41
SPNS1-204ENST00000352260 MT1GP13640 62 aa6.23□□□□□ -1.41
SPNS1-204ENST00000352260 MT1MQ8N339 61 aa6.21□□□□□ -1.42
SPNS1-204ENST00000352260 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.15□□□□□ -1.42
SPNS1-204ENST00000352260 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.14□□□□□ -1.43
SPNS1-204ENST00000352260 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.11□□□□□ -1.43
SPNS1-204ENST00000352260 SPRR2DP22532 72 aa6.04□□□□□ -1.44
SPNS1-204ENST00000352260 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.99□□□□□ -1.45
SPNS1-204ENST00000352260 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
SPNS1-204ENST00000352260 LCE3BQ5TA77 95 aa5.87□□□□□ -1.47
SPNS1-204ENST00000352260 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.87□□□□□ -1.47
SPNS1-204ENST00000352260 KRTAP12-4P60329 112 aa5.78□□□□□ -1.48
SPNS1-204ENST00000352260 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
SPNS1-204ENST00000352260 MT1AP04731 61 aa5.52□□□□□ -1.53
SPNS1-204ENST00000352260 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.5□□□□□ -1.53
SPNS1-204ENST00000352260 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.45□□□□□ -1.54
SPNS1-204ENST00000352260 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.36□□□□□ -1.55
SPNS1-204ENST00000352260 LCE4AQ5TA78 99 aa5.35□□□□□ -1.55
SPNS1-204ENST00000352260 LCE1DQ5T752 114 aa5.33□□□□□ -1.56
SPNS1-204ENST00000352260 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
SPNS1-204ENST00000352260 MT4P47944 62 aa5.3□□□□□ -1.56
SPNS1-204ENST00000352260 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.28□□□□□ -1.56
SPNS1-204ENST00000352260 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.26□□□□□ -1.57
SPNS1-204ENST00000352260 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.25□□□□□ -1.57
SPNS1-204ENST00000352260 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.23□□□□□ -1.57
SPNS1-204ENST00000352260 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.22□□□□□ -1.57
SPNS1-204ENST00000352260 PRM1P04553 51 aa5.15□□□□□ -1.58
SPNS1-204ENST00000352260 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.03□□□□□ -1.6
SPNS1-204ENST00000352260 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.03□□□□□ -1.6
SPNS1-204ENST00000352260 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.01□□□□□ -1.61
SPNS1-204ENST00000352260 MT3P25713 68 aa4.97□□□□□ -1.61
SPNS1-204ENST00000352260 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.95□□□□□ -1.62
SPNS1-204ENST00000352260 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.89□□□□□ -1.63
SPNS1-204ENST00000352260 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.82□□□□□ -1.64
SPNS1-204ENST00000352260 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.74□□□□□ -1.65
SPNS1-204ENST00000352260 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.62□□□□□ -1.67
SPNS1-204ENST00000352260 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.56□□□□□ -1.68
SPNS1-204ENST00000352260 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.53□□□□□ -1.68
SPNS1-204ENST00000352260 KRTAP5-8O75690 187 aa4.38□□□□□ -1.71
SPNS1-204ENST00000352260 LCE1EQ5T753 118 aa4.23□□□□□ -1.73
SPNS1-204ENST00000352260 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.22□□□□□ -1.73
SPNS1-204ENST00000352260 MUC5ACP98088 5654 aa4.1□□□□□ -1.75
SPNS1-204ENST00000352260 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
SPNS1-204ENST00000352260 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.05□□□□□ -1.76
SPNS1-204ENST00000352260 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.04□□□□□ -1.76
SPNS1-204ENST00000352260 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.99□□□□□ -1.77
SPNS1-204ENST00000352260 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
SPNS1-204ENST00000352260 LCE1CQ5T751 118 aa3.95□□□□□ -1.78
SPNS1-204ENST00000352260 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
SPNS1-204ENST00000352260 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.59□□□□□ -1.83
SPNS1-204ENST00000352260 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.47□□□□□ -1.85
SPNS1-204ENST00000352260 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.43□□□□□ -1.86
SPNS1-204ENST00000352260 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.4□□□□□ -1.86
SPNS1-204ENST00000352260 LCE1FQ5T754 118 aa3.25□□□□□ -1.89
SPNS1-204ENST00000352260 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.22□□□□□ -1.89
SPNS1-204ENST00000352260 PHGR1C9JFL3 82 aa2.98□□□□□ -1.93
SPNS1-204ENST00000352260 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.8□□□□□ -1.96
SPNS1-204ENST00000352260 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.02□□□□□ -2.09
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