RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325558.10

PGA3-201, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGA3, Length 1,748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-201ENST00000325558 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.05□□□□□ -1.76
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PGA3-201ENST00000325558 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.91□□□□□ -1.78
PGA3-201ENST00000325558 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.9□□□□□ -1.79
PGA3-201ENST00000325558 NEBP20929 6669 aa3.86□□□□□ -1.79
PGA3-201ENST00000325558 A0A0A0MQY5 61 aa3.85□□□□□ -1.79
PGA3-201ENST00000325558 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.84□□□□□ -1.8
PGA3-201ENST00000325558 MT1GP13640 62 aa3.82□□□□□ -1.8
PGA3-201ENST00000325558 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.82□□□□□ -1.8
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PGA3-201ENST00000325558 MDN1Q9NU22 5596 aa3.68□□□□□ -1.82
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PGA3-201ENST00000325558 SPRR2AP35326 72 aa3.5□□□□□ -1.85
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PGA3-201ENST00000325558 SPRR2DP22532 72 aa3.39□□□□□ -1.87
PGA3-201ENST00000325558 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.37□□□□□ -1.87
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PGA3-201ENST00000325558 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.1□□□□□ -1.91
PGA3-201ENST00000325558 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.06□□□□□ -1.92
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PGA3-201ENST00000325558 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.01□□□□□ -1.93
PGA3-201ENST00000325558 MT4P47944 62 aa2.99□□□□□ -1.93
PGA3-201ENST00000325558 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.96□□□□□ -1.93
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PGA3-201ENST00000325558 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.94□□□□□ -1.94
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PGA3-201ENST00000325558 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.88□□□□□ -1.95
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PGA3-201ENST00000325558 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.87□□□□□ -1.95
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PGA3-201ENST00000325558 KRTAP5-8O75690 187 aa2.47□□□□□ -2.01
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PGA3-201ENST00000325558 LCE1CQ5T751 118 aa2.45□□□□□ -2.02
PGA3-201ENST00000325558 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.45□□□□□ -2.02
PGA3-201ENST00000325558 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
PGA3-201ENST00000325558 LCE1FQ5T754 118 aa2.26□□□□□ -2.05
PGA3-201ENST00000325558 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.24□□□□□ -2.05
PGA3-201ENST00000325558 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.14□□□□□ -2.07
PGA3-201ENST00000325558 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.91□□□□□ -2.1
PGA3-201ENST00000325558 PHGR1C9JFL3 82 aa1.85□□□□□ -2.11
PGA3-201ENST00000325558 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.76□□□□□ -2.13
PGA3-201ENST00000325558 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.66□□□□□ -2.14
PGA3-201ENST00000325558 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.22□□□□□ -2.21
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