RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 MT1LQ93083 61 aa7.9□□□□□ -1.14
CTU2-201ENST00000312060 NEBP20929 6669 aa7.87□□□□□ -1.15
CTU2-201ENST00000312060 SPRR2EP22531 72 aa7.86□□□□□ -1.15
CTU2-201ENST00000312060 SPRR2BP35325 72 aa7.86□□□□□ -1.15
CTU2-201ENST00000312060 SPRR2AP35326 72 aa7.86□□□□□ -1.15
CTU2-201ENST00000312060 LCE1AQ5T7P2 110 aa7.86□□□□□ -1.15
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa7.86□□□□□ -1.15
CTU2-201ENST00000312060 MT1GP13640 62 aa7.78□□□□□ -1.16
CTU2-201ENST00000312060 LCE5AQ5TCM9 118 aa7.76□□□□□ -1.17
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.7□□□□□ -1.18
CTU2-201ENST00000312060 MT1MQ8N339 61 aa7.66□□□□□ -1.18
CTU2-201ENST00000312060 LCE3CQ5T5A8 94 aa7.63□□□□□ -1.19
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.6□□□□□ -1.19
CTU2-201ENST00000312060 SPRR2DP22532 72 aa7.57□□□□□ -1.2
CTU2-201ENST00000312060 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa7.5□□□□□ -1.21
CTU2-201ENST00000312060 NDUFAF8A1L188 74 aa7.34□□□□□ -1.23
CTU2-201ENST00000312060 LCE3BQ5TA77 95 aa7.32□□□□□ -1.24
CTU2-201ENST00000312060 H3BS24 57 aa7.28□□□□□ -1.24
CTU2-201ENST00000312060 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa7.27□□□□□ -1.25
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa7.25□□□□□ -1.25
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa7.25□□□□□ -1.25
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa7.2□□□□□ -1.26
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa7.19□□□□□ -1.26
CTU2-201ENST00000312060 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.16□□□□□ -1.26
CTU2-201ENST00000312060 LUZP6Q538Z0 58 aa7.16□□□□□ -1.26
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa7.08□□□□□ -1.28
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa7.08□□□□□ -1.28
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.77□□□□□ -1.32
CTU2-201ENST00000312060 LCE4AQ5TA78 99 aa6.73□□□□□ -1.33
CTU2-201ENST00000312060 MT1AP04731 61 aa6.71□□□□□ -1.33
CTU2-201ENST00000312060 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.65□□□□□ -1.34
CTU2-201ENST00000312060 A0A0A0MQY5 61 aa6.6□□□□□ -1.35
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.6□□□□□ -1.35
CTU2-201ENST00000312060 MT4P47944 62 aa6.59□□□□□ -1.35
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP12-4P60329 112 aa6.55□□□□□ -1.36
CTU2-201ENST00000312060 LCE1DQ5T752 114 aa6.52□□□□□ -1.37
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.5□□□□□ -1.37
CTU2-201ENST00000312060 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.46□□□□□ -1.38
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.42□□□□□ -1.38
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.35□□□□□ -1.39
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.19□□□□□ -1.42
CTU2-201ENST00000312060 INE1O15225 51 aa6.13□□□□□ -1.43
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.13□□□□□ -1.43
CTU2-201ENST00000312060 MT3P25713 68 aa6.12□□□□□ -1.43
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.08□□□□□ -1.44
CTU2-201ENST00000312060 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.94□□□□□ -1.46
CTU2-201ENST00000312060 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.82□□□□□ -1.48
CTU2-201ENST00000312060 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.69□□□□□ -1.5
CTU2-201ENST00000312060 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.67□□□□□ -1.5
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.59□□□□□ -1.52
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.59□□□□□ -1.52
CTU2-201ENST00000312060 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.49□□□□□ -1.53
CTU2-201ENST00000312060 LCE1EQ5T753 118 aa5.39□□□□□ -1.55
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP5-8O75690 187 aa5.37□□□□□ -1.55
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.31□□□□□ -1.56
CTU2-201ENST00000312060 MUC5ACP98088 5654 aa5.24□□□□□ -1.57
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.23□□□□□ -1.57
CTU2-201ENST00000312060 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.05□□□□□ -1.6
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.02□□□□□ -1.61
CTU2-201ENST00000312060 LCE1CQ5T751 118 aa5□□□□□ -1.61
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.94□□□□□ -1.62
CTU2-201ENST00000312060 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.66
CTU2-201ENST00000312060 PRM1P04553 51 aa4.64□□□□□ -1.67
CTU2-201ENST00000312060 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.44□□□□□ -1.7
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.36□□□□□ -1.71
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.27□□□□□ -1.73
CTU2-201ENST00000312060 LCE1FQ5T754 118 aa4.1□□□□□ -1.75
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.9□□□□□ -1.78
CTU2-201ENST00000312060 PHGR1C9JFL3 82 aa3.82□□□□□ -1.8
CTU2-201ENST00000312060 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.52□□□□□ -1.85
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.92□□□□□ -1.94
CTU2-201ENST00000312060 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.49□□□□□ -2.01
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