RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-201ENST00000296642 P0C880 135 aa2.99□□□□□ -1.93
PGGT1B-201ENST00000296642 PSPHP1O15172 72 aa2.98□□□□□ -1.93
PGGT1B-201ENST00000296642 PP632Q6XCG6 107 aa2.98□□□□□ -1.93
PGGT1B-201ENST00000296642 MP68P56378 58 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-201ENST00000296642 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa2.96□□□□□ -1.94
PGGT1B-201ENST00000296642 A8MU10 97 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-201ENST00000296642 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa2.95□□□□□ -1.94
PGGT1B-201ENST00000296642 H0Y9P7 68 aa2.94□□□□□ -1.94
PGGT1B-201ENST00000296642 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-201ENST00000296642 H3BPC8 53 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-201ENST00000296642 MT1EP04732 61 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-201ENST00000296642 MT1GP13640 62 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-201ENST00000296642 SPTSSBQ8NFR3 76 aa2.92□□□□□ -1.94
PGGT1B-201ENST00000296642 A6NED7 52 aa2.91□□□□□ -1.94
PGGT1B-201ENST00000296642 PRR15LQ9BU68 103 aa2.91□□□□□ -1.94
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa2.91□□□□□ -1.94
PGGT1B-201ENST00000296642 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.91□□□□□ -1.94
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa2.9□□□□□ -1.95
PGGT1B-201ENST00000296642 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa2.9□□□□□ -1.95
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00208Q96KT6 92 aa2.9□□□□□ -1.95
PGGT1B-201ENST00000296642 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.88□□□□□ -1.95
PGGT1B-201ENST00000296642 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.87□□□□□ -1.95
PGGT1B-201ENST00000296642 COA5Q86WW8 74 aa2.82□□□□□ -1.96
PGGT1B-201ENST00000296642 DMAC1Q96GE9 116 aa2.82□□□□□ -1.96
PGGT1B-201ENST00000296642 PRAC1Q96KF2 57 aa2.82□□□□□ -1.96
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.8□□□□□ -1.96
PGGT1B-201ENST00000296642 MT1MQ8N339 61 aa2.8□□□□□ -1.96
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A0D9SG42 100 aa2.79□□□□□ -1.96
PGGT1B-201ENST00000296642 SPATA8Q6RVD6 105 aa2.79□□□□□ -1.96
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.79□□□□□ -1.96
PGGT1B-201ENST00000296642 ROMO1P60602 79 aa2.78□□□□□ -1.96
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa2.77□□□□□ -1.97
PGGT1B-201ENST00000296642 ACYP2P14621 99 aa2.76□□□□□ -1.97
PGGT1B-201ENST00000296642 MT1LQ93083 61 aa2.74□□□□□ -1.97
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.73□□□□□ -1.97
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.73□□□□□ -1.97
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP12-4P60329 112 aa2.72□□□□□ -1.97
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa2.7□□□□□ -1.98
PGGT1B-201ENST00000296642 UQCR11O14957 56 aa2.68□□□□□ -1.98
PGGT1B-201ENST00000296642 MIR22HGQ0VDD5 57 aa2.68□□□□□ -1.98
PGGT1B-201ENST00000296642 MT3P25713 68 aa2.66□□□□□ -1.98
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1B0GU69 56 aa2.63□□□□□ -1.99
PGGT1B-201ENST00000296642 SPINT4Q6UDR6 99 aa2.63□□□□□ -1.99
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa2.62□□□□□ -1.99
PGGT1B-201ENST00000296642 C10orf95Q9H7T3 257 aa2.61□□□□□ -1.99
PGGT1B-201ENST00000296642 TNP1P09430 55 aa2.58□□□□□ -2
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
PGGT1B-201ENST00000296642 K7ERS5 55 aa2.56□□□□□ -2
PGGT1B-201ENST00000296642 LCE3AQ5TA76 89 aa2.55□□□□□ -2
PGGT1B-201ENST00000296642 LUZP6Q538Z0 58 aa2.54□□□□□ -2
PGGT1B-201ENST00000296642 NDUFAF8A1L188 74 aa2.53□□□□□ -2
PGGT1B-201ENST00000296642 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP5-8O75690 187 aa2.5□□□□□ -2.01
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP12-3P60328 96 aa2.5□□□□□ -2.01
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1B0GU33 70 aa2.49□□□□□ -2.01
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP12-1P59990 96 aa2.49□□□□□ -2.01
PGGT1B-201ENST00000296642 MUC5ACP98088 5654 aa2.48□□□□□ -2.01
PGGT1B-201ENST00000296642 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
PGGT1B-201ENST00000296642 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
PGGT1B-201ENST00000296642 MT1AP04731 61 aa2.35□□□□□ -2.03
PGGT1B-201ENST00000296642 LCE1FQ5T754 118 aa2.34□□□□□ -2.03
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.3□□□□□ -2.04
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.29□□□□□ -2.04
PGGT1B-201ENST00000296642 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.28□□□□□ -2.04
PGGT1B-201ENST00000296642 INE1O15225 51 aa2.19□□□□□ -2.06
PGGT1B-201ENST00000296642 LCE1CQ5T751 118 aa2.11□□□□□ -2.07
PGGT1B-201ENST00000296642 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.11□□□□□ -2.07
PGGT1B-201ENST00000296642 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.07□□□□□ -2.08
PGGT1B-201ENST00000296642 PHGR1C9JFL3 82 aa1.82□□□□□ -2.12
PGGT1B-201ENST00000296642 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.81□□□□□ -2.12
PGGT1B-201ENST00000296642 LCE3DQ9BYE3 92 aa1.6□□□□□ -2.15
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.55□□□□□ -2.16
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.41□□□□□ -2.18
PGGT1B-201ENST00000296642 PRM1P04553 51 aa1.3□□□□□ -2.2
PGGT1B-201ENST00000296642 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.95□□□□□ -2.26
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