RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 MT1EP04732 61 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RABGEF1-201ENST00000284957 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.35□□□□□ -1.87
RABGEF1-201ENST00000284957 MT1LQ93083 61 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGEF1-201ENST00000284957 INE1O15225 51 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGEF1-201ENST00000284957 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGEF1-201ENST00000284957 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP5-9P26371 169 aa3.27□□□□□ -1.89
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.27□□□□□ -1.89
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.24□□□□□ -1.89
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGEF1-201ENST00000284957 MDN1Q9NU22 5596 aa3.22□□□□□ -1.89
RABGEF1-201ENST00000284957 MT1GP13640 62 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGEF1-201ENST00000284957 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGEF1-201ENST00000284957 MT1MQ8N339 61 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.17□□□□□ -1.9
RABGEF1-201ENST00000284957 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.17□□□□□ -1.9
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.17□□□□□ -1.9
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.16□□□□□ -1.9
RABGEF1-201ENST00000284957 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RABGEF1-201ENST00000284957 SPRR2EP22531 72 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGEF1-201ENST00000284957 SPRR2BP35325 72 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGEF1-201ENST00000284957 SPRR2AP35326 72 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.05□□□□□ -1.92
RABGEF1-201ENST00000284957 NEBP20929 6669 aa3.01□□□□□ -1.93
RABGEF1-201ENST00000284957 SPRR2DP22532 72 aa3□□□□□ -1.93
RABGEF1-201ENST00000284957 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa2.89□□□□□ -1.95
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa2.89□□□□□ -1.95
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa2.89□□□□□ -1.95
RABGEF1-201ENST00000284957 LCE3BQ5TA77 95 aa2.88□□□□□ -1.95
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGEF1-201ENST00000284957 MT1AP04731 61 aa2.81□□□□□ -1.96
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGEF1-201ENST00000284957 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGEF1-201ENST00000284957 LCE4AQ5TA78 99 aa2.78□□□□□ -1.97
RABGEF1-201ENST00000284957 MT4P47944 62 aa2.75□□□□□ -1.97
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.74□□□□□ -1.97
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP12-4P60329 112 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGEF1-201ENST00000284957 LCE1EQ5T753 118 aa2.68□□□□□ -1.98
RABGEF1-201ENST00000284957 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.68□□□□□ -1.98
RABGEF1-201ENST00000284957 LCE1FQ5T754 118 aa2.68□□□□□ -1.98
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.67□□□□□ -1.98
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa2.67□□□□□ -1.98
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.65□□□□□ -1.99
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.58□□□□□ -2
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.58□□□□□ -2
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.58□□□□□ -2
RABGEF1-201ENST00000284957 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.58□□□□□ -2
RABGEF1-201ENST00000284957 LCE1DQ5T752 114 aa2.57□□□□□ -2
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.55□□□□□ -2
RABGEF1-201ENST00000284957 MT3P25713 68 aa2.53□□□□□ -2
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.49□□□□□ -2.01
RABGEF1-201ENST00000284957 PRM1P04553 51 aa2.48□□□□□ -2.01
RABGEF1-201ENST00000284957 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.47□□□□□ -2.01
RABGEF1-201ENST00000284957 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.46□□□□□ -2.02
RABGEF1-201ENST00000284957 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.39□□□□□ -2.03
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGEF1-201ENST00000284957 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP5-8O75690 187 aa2.14□□□□□ -2.07
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.13□□□□□ -2.07
RABGEF1-201ENST00000284957 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGEF1-201ENST00000284957 MUC5ACP98088 5654 aa2.09□□□□□ -2.07
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.07□□□□□ -2.08
RABGEF1-201ENST00000284957 LCE1CQ5T751 118 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGEF1-201ENST00000284957 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
RABGEF1-201ENST00000284957 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.95□□□□□ -2.1
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.85□□□□□ -2.11
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.81□□□□□ -2.12
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGEF1-201ENST00000284957 PHGR1C9JFL3 82 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.41□□□□□ -2.18
RABGEF1-201ENST00000284957 MUC16Q8WXI7 14507 aa1□□□□□ -2.25
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 229.2 ms