RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 MDN1Q9NU22 5596 aa3.95□□□□□ -1.78
GGPS1-201ENST00000282841 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
GGPS1-201ENST00000282841 MT1EP04732 61 aa3.94□□□□□ -1.78
GGPS1-201ENST00000282841 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.92□□□□□ -1.78
GGPS1-201ENST00000282841 MT1LQ93083 61 aa3.88□□□□□ -1.79
GGPS1-201ENST00000282841 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.85□□□□□ -1.79
GGPS1-201ENST00000282841 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.84□□□□□ -1.79
GGPS1-201ENST00000282841 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.77□□□□□ -1.81
GGPS1-201ENST00000282841 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
GGPS1-201ENST00000282841 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.76□□□□□ -1.81
GGPS1-201ENST00000282841 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.72□□□□□ -1.81
GGPS1-201ENST00000282841 MT1MQ8N339 61 aa3.72□□□□□ -1.81
GGPS1-201ENST00000282841 MT1GP13640 62 aa3.69□□□□□ -1.82
GGPS1-201ENST00000282841 KRTAP5-9P26371 169 aa3.68□□□□□ -1.82
GGPS1-201ENST00000282841 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.68□□□□□ -1.82
GGPS1-201ENST00000282841 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.67□□□□□ -1.82
GGPS1-201ENST00000282841 SPRR2EP22531 72 aa3.66□□□□□ -1.82
GGPS1-201ENST00000282841 SPRR2BP35325 72 aa3.66□□□□□ -1.82
GGPS1-201ENST00000282841 SPRR2AP35326 72 aa3.66□□□□□ -1.82
GGPS1-201ENST00000282841 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.59□□□□□ -1.84
GGPS1-201ENST00000282841 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.57□□□□□ -1.84
GGPS1-201ENST00000282841 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
GGPS1-201ENST00000282841 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.51□□□□□ -1.85
GGPS1-201ENST00000282841 SPRR2DP22532 72 aa3.51□□□□□ -1.85
GGPS1-201ENST00000282841 NEBP20929 6669 aa3.5□□□□□ -1.85
GGPS1-201ENST00000282841 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.4□□□□□ -1.86
GGPS1-201ENST00000282841 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.39□□□□□ -1.87
GGPS1-201ENST00000282841 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.39□□□□□ -1.87
GGPS1-201ENST00000282841 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.39□□□□□ -1.87
GGPS1-201ENST00000282841 LCE3BQ5TA77 95 aa3.36□□□□□ -1.87
GGPS1-201ENST00000282841 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.33□□□□□ -1.88
GGPS1-201ENST00000282841 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.32□□□□□ -1.88
GGPS1-201ENST00000282841 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
GGPS1-201ENST00000282841 KRTAP12-4P60329 112 aa3.26□□□□□ -1.89
GGPS1-201ENST00000282841 LCE1EQ5T753 118 aa3.25□□□□□ -1.89
GGPS1-201ENST00000282841 MT1AP04731 61 aa3.23□□□□□ -1.89
GGPS1-201ENST00000282841 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.22□□□□□ -1.89
GGPS1-201ENST00000282841 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.22□□□□□ -1.89
GGPS1-201ENST00000282841 MT4P47944 62 aa3.17□□□□□ -1.9
GGPS1-201ENST00000282841 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.14□□□□□ -1.91
GGPS1-201ENST00000282841 LCE1DQ5T752 114 aa3.1□□□□□ -1.91
GGPS1-201ENST00000282841 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.1□□□□□ -1.91
GGPS1-201ENST00000282841 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.09□□□□□ -1.92
GGPS1-201ENST00000282841 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.07□□□□□ -1.92
GGPS1-201ENST00000282841 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.07□□□□□ -1.92
GGPS1-201ENST00000282841 LCE1FQ5T754 118 aa3.01□□□□□ -1.93
GGPS1-201ENST00000282841 PRM1P04553 51 aa3□□□□□ -1.93
GGPS1-201ENST00000282841 LCE4AQ5TA78 99 aa2.96□□□□□ -1.94
GGPS1-201ENST00000282841 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.95□□□□□ -1.94
GGPS1-201ENST00000282841 MT3P25713 68 aa2.93□□□□□ -1.94
GGPS1-201ENST00000282841 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.91□□□□□ -1.94
GGPS1-201ENST00000282841 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.91□□□□□ -1.94
GGPS1-201ENST00000282841 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.81□□□□□ -1.96
GGPS1-201ENST00000282841 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.81□□□□□ -1.96
GGPS1-201ENST00000282841 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.8□□□□□ -1.96
GGPS1-201ENST00000282841 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.79□□□□□ -1.96
GGPS1-201ENST00000282841 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.63□□□□□ -1.99
GGPS1-201ENST00000282841 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
GGPS1-201ENST00000282841 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.55□□□□□ -2
GGPS1-201ENST00000282841 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.54□□□□□ -2
GGPS1-201ENST00000282841 MUC5ACP98088 5654 aa2.53□□□□□ -2
GGPS1-201ENST00000282841 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.51□□□□□ -2.01
GGPS1-201ENST00000282841 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.51□□□□□ -2.01
GGPS1-201ENST00000282841 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.49□□□□□ -2.01
GGPS1-201ENST00000282841 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.48□□□□□ -2.01
GGPS1-201ENST00000282841 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.47□□□□□ -2.01
GGPS1-201ENST00000282841 KRTAP5-8O75690 187 aa2.44□□□□□ -2.02
GGPS1-201ENST00000282841 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.43□□□□□ -2.02
GGPS1-201ENST00000282841 LCE1CQ5T751 118 aa2.32□□□□□ -2.04
GGPS1-201ENST00000282841 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.14□□□□□ -2.07
GGPS1-201ENST00000282841 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
GGPS1-201ENST00000282841 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.09□□□□□ -2.08
GGPS1-201ENST00000282841 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.02□□□□□ -2.09
GGPS1-201ENST00000282841 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
GGPS1-201ENST00000282841 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.88□□□□□ -2.11
GGPS1-201ENST00000282841 PHGR1C9JFL3 82 aa1.78□□□□□ -2.12
GGPS1-201ENST00000282841 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.08□□□□□ -2.24
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 129.3 ms