RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000274606.7

NHP2-201, Transcript of NHP2 ribonucleoprotein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NHP2, Length 865 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHP2-201ENST00000274606 SPRR2AP35326 72 aa4.98□□□□□ -1.61
NHP2-201ENST00000274606 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.95□□□□□ -1.62
NHP2-201ENST00000274606 MDN1Q9NU22 5596 aa4.95□□□□□ -1.62
NHP2-201ENST00000274606 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.94□□□□□ -1.62
NHP2-201ENST00000274606 A0A0A0MQY5 61 aa4.9□□□□□ -1.63
NHP2-201ENST00000274606 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.87□□□□□ -1.63
NHP2-201ENST00000274606 SPRR2DP22532 72 aa4.81□□□□□ -1.64
NHP2-201ENST00000274606 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.8□□□□□ -1.64
NHP2-201ENST00000274606 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.8□□□□□ -1.64
NHP2-201ENST00000274606 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.71□□□□□ -1.66
NHP2-201ENST00000274606 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.71□□□□□ -1.66
NHP2-201ENST00000274606 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.7□□□□□ -1.66
NHP2-201ENST00000274606 MT1EP04732 61 aa4.68□□□□□ -1.66
NHP2-201ENST00000274606 LCE3BQ5TA77 95 aa4.65□□□□□ -1.67
NHP2-201ENST00000274606 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.65□□□□□ -1.67
NHP2-201ENST00000274606 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.65□□□□□ -1.67
NHP2-201ENST00000274606 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4.64□□□□□ -1.67
NHP2-201ENST00000274606 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.63□□□□□ -1.67
NHP2-201ENST00000274606 LCE3AQ5TA76 89 aa4.62□□□□□ -1.67
NHP2-201ENST00000274606 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.62□□□□□ -1.67
NHP2-201ENST00000274606 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.59□□□□□ -1.67
NHP2-201ENST00000274606 INE1O15225 51 aa4.52□□□□□ -1.69
NHP2-201ENST00000274606 MT1GP13640 62 aa4.49□□□□□ -1.69
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NHP2-201ENST00000274606 KRTAP12-3P60328 96 aa4.46□□□□□ -1.7
NHP2-201ENST00000274606 MT1MQ8N339 61 aa4.45□□□□□ -1.7
NHP2-201ENST00000274606 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.44□□□□□ -1.7
NHP2-201ENST00000274606 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.35□□□□□ -1.71
NHP2-201ENST00000274606 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
NHP2-201ENST00000274606 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.29□□□□□ -1.72
NHP2-201ENST00000274606 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.28□□□□□ -1.72
NHP2-201ENST00000274606 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.23□□□□□ -1.73
NHP2-201ENST00000274606 LCE4AQ5TA78 99 aa4.22□□□□□ -1.73
NHP2-201ENST00000274606 MT4P47944 62 aa4.2□□□□□ -1.74
NHP2-201ENST00000274606 LCE1DQ5T752 114 aa4.2□□□□□ -1.74
NHP2-201ENST00000274606 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.14□□□□□ -1.75
NHP2-201ENST00000274606 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.13□□□□□ -1.75
NHP2-201ENST00000274606 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.13□□□□□ -1.75
NHP2-201ENST00000274606 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.07□□□□□ -1.76
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NHP2-201ENST00000274606 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.97□□□□□ -1.77
NHP2-201ENST00000274606 KRTAP12-4P60329 112 aa3.94□□□□□ -1.78
NHP2-201ENST00000274606 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.93□□□□□ -1.78
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NHP2-201ENST00000274606 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.82□□□□□ -1.8
NHP2-201ENST00000274606 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.79□□□□□ -1.8
NHP2-201ENST00000274606 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.78□□□□□ -1.8
NHP2-201ENST00000274606 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.77□□□□□ -1.81
NHP2-201ENST00000274606 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
NHP2-201ENST00000274606 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.67□□□□□ -1.82
NHP2-201ENST00000274606 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.66□□□□□ -1.82
NHP2-201ENST00000274606 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.65□□□□□ -1.83
NHP2-201ENST00000274606 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.61□□□□□ -1.83
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NHP2-201ENST00000274606 KRTAP5-8O75690 187 aa3.41□□□□□ -1.86
NHP2-201ENST00000274606 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.27□□□□□ -1.89
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NHP2-201ENST00000274606 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.26□□□□□ -1.89
NHP2-201ENST00000274606 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.25□□□□□ -1.89
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NHP2-201ENST00000274606 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
NHP2-201ENST00000274606 LCE1EQ5T753 118 aa3.14□□□□□ -1.91
NHP2-201ENST00000274606 PRM1P04553 51 aa3.07□□□□□ -1.92
NHP2-201ENST00000274606 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.02□□□□□ -1.93
NHP2-201ENST00000274606 LCE1CQ5T751 118 aa2.92□□□□□ -1.94
NHP2-201ENST00000274606 LCE1FQ5T754 118 aa2.85□□□□□ -1.95
NHP2-201ENST00000274606 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
NHP2-201ENST00000274606 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.65□□□□□ -1.99
NHP2-201ENST00000274606 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.47□□□□□ -2.01
NHP2-201ENST00000274606 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.3□□□□□ -2.04
NHP2-201ENST00000274606 PHGR1C9JFL3 82 aa2.28□□□□□ -2.04
NHP2-201ENST00000274606 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.05□□□□□ -2.08
NHP2-201ENST00000274606 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2□□□□□ -2.09
NHP2-201ENST00000274606 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.48□□□□□ -2.17
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 6.3 ms