RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa7.74□□□□□ -1.17
PITX1-201ENST00000265340 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
PITX1-201ENST00000265340 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa7.58□□□□□ -1.2
PITX1-201ENST00000265340 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.2
PITX1-201ENST00000265340 MT1EP04732 61 aa7.37□□□□□ -1.23
PITX1-201ENST00000265340 MUC12Q9UKN1 5478 aa7.36□□□□□ -1.23
PITX1-201ENST00000265340 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.32□□□□□ -1.24
PITX1-201ENST00000265340 MT1LQ93083 61 aa7.29□□□□□ -1.24
PITX1-201ENST00000265340 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.29□□□□□ -1.24
PITX1-201ENST00000265340 KRTAP12-4P60329 112 aa7.25□□□□□ -1.25
PITX1-201ENST00000265340 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.24□□□□□ -1.25
PITX1-201ENST00000265340 KRTAP5-9P26371 169 aa7.21□□□□□ -1.25
PITX1-201ENST00000265340 MDN1Q9NU22 5596 aa7.21□□□□□ -1.26
PITX1-201ENST00000265340 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.2□□□□□ -1.26
PITX1-201ENST00000265340 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa7.2□□□□□ -1.26
PITX1-201ENST00000265340 SPRR2EP22531 72 aa6.99□□□□□ -1.29
PITX1-201ENST00000265340 SPRR2BP35325 72 aa6.99□□□□□ -1.29
PITX1-201ENST00000265340 SPRR2AP35326 72 aa6.99□□□□□ -1.29
PITX1-201ENST00000265340 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.99□□□□□ -1.29
PITX1-201ENST00000265340 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.98□□□□□ -1.29
PITX1-201ENST00000265340 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.97□□□□□ -1.29
PITX1-201ENST00000265340 MT1MQ8N339 61 aa6.92□□□□□ -1.3
PITX1-201ENST00000265340 MT1GP13640 62 aa6.91□□□□□ -1.3
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PITX1-201ENST00000265340 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
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PITX1-201ENST00000265340 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.82□□□□□ -1.32
PITX1-201ENST00000265340 SPRR2DP22532 72 aa6.74□□□□□ -1.33
PITX1-201ENST00000265340 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.72□□□□□ -1.33
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PITX1-201ENST00000265340 LCE3BQ5TA77 95 aa6.48□□□□□ -1.37
PITX1-201ENST00000265340 MT1AP04731 61 aa6.44□□□□□ -1.38
PITX1-201ENST00000265340 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
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PITX1-201ENST00000265340 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.34□□□□□ -1.4
PITX1-201ENST00000265340 LCE3DQ9BYE3 92 aa6.29□□□□□ -1.4
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PITX1-201ENST00000265340 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.96□□□□□ -1.46
PITX1-201ENST00000265340 MT4P47944 62 aa5.93□□□□□ -1.46
PITX1-201ENST00000265340 LCE4AQ5TA78 99 aa5.87□□□□□ -1.47
PITX1-201ENST00000265340 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.84□□□□□ -1.48
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PITX1-201ENST00000265340 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.8□□□□□ -1.48
PITX1-201ENST00000265340 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.78□□□□□ -1.48
PITX1-201ENST00000265340 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.63□□□□□ -1.51
PITX1-201ENST00000265340 MT3P25713 68 aa5.51□□□□□ -1.53
PITX1-201ENST00000265340 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.48□□□□□ -1.53
PITX1-201ENST00000265340 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.41□□□□□ -1.54
PITX1-201ENST00000265340 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.35□□□□□ -1.55
PITX1-201ENST00000265340 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.18□□□□□ -1.58
PITX1-201ENST00000265340 LCE1FQ5T754 118 aa5.14□□□□□ -1.59
PITX1-201ENST00000265340 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.95□□□□□ -1.62
PITX1-201ENST00000265340 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.93□□□□□ -1.62
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PITX1-201ENST00000265340 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.55□□□□□ -1.68
PITX1-201ENST00000265340 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.46□□□□□ -1.69
PITX1-201ENST00000265340 LCE1CQ5T751 118 aa4.4□□□□□ -1.71
PITX1-201ENST00000265340 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.34□□□□□ -1.72
PITX1-201ENST00000265340 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa4.31□□□□□ -1.72
PITX1-201ENST00000265340 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
PITX1-201ENST00000265340 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
PITX1-201ENST00000265340 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.03□□□□□ -1.76
PITX1-201ENST00000265340 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4□□□□□ -1.77
PITX1-201ENST00000265340 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
PITX1-201ENST00000265340 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.9□□□□□ -1.79
PITX1-201ENST00000265340 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.9□□□□□ -1.79
PITX1-201ENST00000265340 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.68□□□□□ -1.82
PITX1-201ENST00000265340 PHGR1C9JFL3 82 aa3.37□□□□□ -1.87
PITX1-201ENST00000265340 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.15□□□□□ -2.06
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