RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.12□□□□□ -1.59
SYP-201ENST00000263233 MT1LQ93083 61 aa5.12□□□□□ -1.59
SYP-201ENST00000263233 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
SYP-201ENST00000263233 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.1□□□□□ -1.59
SYP-201ENST00000263233 MT1EP04732 61 aa5.09□□□□□ -1.59
SYP-201ENST00000263233 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.05□□□□□ -1.6
SYP-201ENST00000263233 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.03□□□□□ -1.6
SYP-201ENST00000263233 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.96□□□□□ -1.62
SYP-201ENST00000263233 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.96□□□□□ -1.62
SYP-201ENST00000263233 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.9□□□□□ -1.62
SYP-201ENST00000263233 MDN1Q9NU22 5596 aa4.87□□□□□ -1.63
SYP-201ENST00000263233 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.85□□□□□ -1.63
SYP-201ENST00000263233 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
SYP-201ENST00000263233 MT1GP13640 62 aa4.8□□□□□ -1.64
SYP-201ENST00000263233 MT1MQ8N339 61 aa4.74□□□□□ -1.65
SYP-201ENST00000263233 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.72□□□□□ -1.65
SYP-201ENST00000263233 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.7□□□□□ -1.66
SYP-201ENST00000263233 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
SYP-201ENST00000263233 KRTAP12-4P60329 112 aa4.62□□□□□ -1.67
SYP-201ENST00000263233 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.54□□□□□ -1.68
SYP-201ENST00000263233 KRTAP5-9P26371 169 aa4.49□□□□□ -1.69
SYP-201ENST00000263233 LCE3BQ5TA77 95 aa4.47□□□□□ -1.69
SYP-201ENST00000263233 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.46□□□□□ -1.7
SYP-201ENST00000263233 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.43□□□□□ -1.7
SYP-201ENST00000263233 SPRR2EP22531 72 aa4.43□□□□□ -1.7
SYP-201ENST00000263233 SPRR2BP35325 72 aa4.43□□□□□ -1.7
SYP-201ENST00000263233 SPRR2AP35326 72 aa4.43□□□□□ -1.7
SYP-201ENST00000263233 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.42□□□□□ -1.7
SYP-201ENST00000263233 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.4□□□□□ -1.71
SYP-201ENST00000263233 MT1AP04731 61 aa4.37□□□□□ -1.71
SYP-201ENST00000263233 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.35□□□□□ -1.71
SYP-201ENST00000263233 NEBP20929 6669 aa4.32□□□□□ -1.72
SYP-201ENST00000263233 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
SYP-201ENST00000263233 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.25□□□□□ -1.73
SYP-201ENST00000263233 SPRR2DP22532 72 aa4.23□□□□□ -1.73
SYP-201ENST00000263233 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.21□□□□□ -1.73
SYP-201ENST00000263233 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
SYP-201ENST00000263233 PRM1P04553 51 aa4.11□□□□□ -1.75
SYP-201ENST00000263233 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.08□□□□□ -1.76
SYP-201ENST00000263233 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.07□□□□□ -1.76
SYP-201ENST00000263233 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.07□□□□□ -1.76
SYP-201ENST00000263233 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.02□□□□□ -1.77
SYP-201ENST00000263233 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.96□□□□□ -1.78
SYP-201ENST00000263233 LCE1DQ5T752 114 aa3.89□□□□□ -1.79
SYP-201ENST00000263233 MT4P47944 62 aa3.84□□□□□ -1.79
SYP-201ENST00000263233 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.84□□□□□ -1.79
SYP-201ENST00000263233 MT3P25713 68 aa3.83□□□□□ -1.8
SYP-201ENST00000263233 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.82□□□□□ -1.8
SYP-201ENST00000263233 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.8□□□□□ -1.8
SYP-201ENST00000263233 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.78□□□□□ -1.8
SYP-201ENST00000263233 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.73□□□□□ -1.81
SYP-201ENST00000263233 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.72□□□□□ -1.81
SYP-201ENST00000263233 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.62□□□□□ -1.83
SYP-201ENST00000263233 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.58□□□□□ -1.84
SYP-201ENST00000263233 LCE4AQ5TA78 99 aa3.56□□□□□ -1.84
SYP-201ENST00000263233 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.38□□□□□ -1.87
SYP-201ENST00000263233 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.36□□□□□ -1.87
SYP-201ENST00000263233 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.27□□□□□ -1.89
SYP-201ENST00000263233 MUC5ACP98088 5654 aa3.23□□□□□ -1.89
SYP-201ENST00000263233 LCE1EQ5T753 118 aa3.23□□□□□ -1.89
SYP-201ENST00000263233 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.11□□□□□ -1.91
SYP-201ENST00000263233 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.08□□□□□ -1.92
SYP-201ENST00000263233 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.04□□□□□ -1.92
SYP-201ENST00000263233 KRTAP5-8O75690 187 aa3.01□□□□□ -1.93
SYP-201ENST00000263233 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.01□□□□□ -1.93
SYP-201ENST00000263233 LCE1CQ5T751 118 aa2.92□□□□□ -1.94
SYP-201ENST00000263233 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
SYP-201ENST00000263233 LCE1FQ5T754 118 aa2.86□□□□□ -1.95
SYP-201ENST00000263233 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.81□□□□□ -1.96
SYP-201ENST00000263233 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
SYP-201ENST00000263233 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
SYP-201ENST00000263233 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.61□□□□□ -1.99
SYP-201ENST00000263233 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.57□□□□□ -2
SYP-201ENST00000263233 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.49□□□□□ -2.01
SYP-201ENST00000263233 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.44□□□□□ -2.02
SYP-201ENST00000263233 PHGR1C9JFL3 82 aa2.16□□□□□ -2.06
SYP-201ENST00000263233 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.46□□□□□ -2.18
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