RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258083.2

PRADC1-201, Transcript of protease associated domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRADC1, Length 1,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1-201ENST00000258083 LCE3AQ5TA76 89 aa7.93□□□□□ -1.14
PRADC1-201ENST00000258083 PP632Q6XCG6 107 aa7.93□□□□□ -1.14
PRADC1-201ENST00000258083 MT1LQ93083 61 aa7.93□□□□□ -1.14
PRADC1-201ENST00000258083 PRO0628Q9UI54 55 aa7.92□□□□□ -1.14
PRADC1-201ENST00000258083 UQCR11O14957 56 aa7.91□□□□□ -1.14
PRADC1-201ENST00000258083 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.91□□□□□ -1.14
PRADC1-201ENST00000258083 MT1MQ8N339 61 aa7.89□□□□□ -1.15
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.82□□□□□ -1.16
PRADC1-201ENST00000258083 MIR22HGQ0VDD5 57 aa7.81□□□□□ -1.16
PRADC1-201ENST00000258083 GPR98Q8WXG9 6306 aa7.73□□□□□ -1.17
PRADC1-201ENST00000258083 LCE4AQ5TA78 99 aa7.68□□□□□ -1.18
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa7.68□□□□□ -1.18
PRADC1-201ENST00000258083 LCE1DQ5T752 114 aa7.67□□□□□ -1.18
PRADC1-201ENST00000258083 HMCN1Q96RW7 5635 aa7.66□□□□□ -1.18
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP12-3P60328 96 aa7.63□□□□□ -1.19
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa7.59□□□□□ -1.19
PRADC1-201ENST00000258083 PMAIP1Q13794 54 aa7.56□□□□□ -1.2
PRADC1-201ENST00000258083 SVIPQ8NHG7 77 aa7.55□□□□□ -1.2
PRADC1-201ENST00000258083 MT4P47944 62 aa7.54□□□□□ -1.2
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.51□□□□□ -1.21
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.51□□□□□ -1.21
PRADC1-201ENST00000258083 K7ERS5 55 aa7.46□□□□□ -1.22
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.38□□□□□ -1.23
PRADC1-201ENST00000258083 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa7.36□□□□□ -1.23
PRADC1-201ENST00000258083 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa7.32□□□□□ -1.24
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.28□□□□□ -1.24
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.27□□□□□ -1.25
PRADC1-201ENST00000258083 ROMO1P60602 79 aa7.17□□□□□ -1.26
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa7.17□□□□□ -1.26
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.13□□□□□ -1.27
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa7.12□□□□□ -1.27
PRADC1-201ENST00000258083 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.11□□□□□ -1.27
PRADC1-201ENST00000258083 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa7.11□□□□□ -1.27
PRADC1-201ENST00000258083 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP12-4P60329 112 aa7.03□□□□□ -1.28
PRADC1-201ENST00000258083 LCE3CQ5T5A8 94 aa7.03□□□□□ -1.28
PRADC1-201ENST00000258083 PRAC1Q96KF2 57 aa7.03□□□□□ -1.28
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.99□□□□□ -1.29
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.89□□□□□ -1.31
PRADC1-201ENST00000258083 MT1AP04731 61 aa6.75□□□□□ -1.33
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.7□□□□□ -1.34
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.67□□□□□ -1.34
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.65□□□□□ -1.34
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.52□□□□□ -1.37
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.5□□□□□ -1.37
PRADC1-201ENST00000258083 H3BS24 57 aa6.43□□□□□ -1.38
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.39□□□□□ -1.39
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP5-8O75690 187 aa6.3□□□□□ -1.4
PRADC1-201ENST00000258083 OBSCNQ5VST9 7968 aa6.28□□□□□ -1.4
PRADC1-201ENST00000258083 MT3P25713 68 aa6.16□□□□□ -1.42
PRADC1-201ENST00000258083 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
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PRADC1-201ENST00000258083 MUC5ACP98088 5654 aa6.03□□□□□ -1.44
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.96□□□□□ -1.46
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.92□□□□□ -1.46
PRADC1-201ENST00000258083 LUZP6Q538Z0 58 aa5.75□□□□□ -1.49
PRADC1-201ENST00000258083 LCE1EQ5T753 118 aa5.7□□□□□ -1.5
PRADC1-201ENST00000258083 NDUFAF8A1L188 74 aa5.66□□□□□ -1.5
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PRADC1-201ENST00000258083 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.29□□□□□ -1.56
PRADC1-201ENST00000258083 A0A0A0MQY5 61 aa5.06□□□□□ -1.6
PRADC1-201ENST00000258083 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.05□□□□□ -1.6
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.89□□□□□ -1.63
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.8□□□□□ -1.64
PRADC1-201ENST00000258083 INE1O15225 51 aa4.76□□□□□ -1.65
PRADC1-201ENST00000258083 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.75□□□□□ -1.65
PRADC1-201ENST00000258083 LCE1FQ5T754 118 aa4.67□□□□□ -1.66
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.44□□□□□ -1.7
PRADC1-201ENST00000258083 PHGR1C9JFL3 82 aa4.14□□□□□ -1.75
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4□□□□□ -1.77
PRADC1-201ENST00000258083 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.88□□□□□ -1.79
PRADC1-201ENST00000258083 PRM1P04553 51 aa3.72□□□□□ -1.81
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.15□□□□□ -1.91
PRADC1-201ENST00000258083 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.71□□□□□ -1.98
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