RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 MDN1Q9NU22 5596 aa10.06□□□□□ -0.8
CAPNS1-201ENST00000246533 INE1O15225 51 aa10.05□□□□□ -0.8
CAPNS1-201ENST00000246533 SPRR2FQ96RM1 72 aa9.95□□□□□ -0.82
CAPNS1-201ENST00000246533 NEBP20929 6669 aa9.94□□□□□ -0.82
CAPNS1-201ENST00000246533 SPRR2EP22531 72 aa9.67□□□□□ -0.86
CAPNS1-201ENST00000246533 SPRR2BP35325 72 aa9.67□□□□□ -0.86
CAPNS1-201ENST00000246533 SPRR2AP35326 72 aa9.67□□□□□ -0.86
CAPNS1-201ENST00000246533 LCE1AQ5T7P2 110 aa9.64□□□□□ -0.87
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa9.56□□□□□ -0.88
CAPNS1-201ENST00000246533 LCE3CQ5T5A8 94 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa9.48□□□□□ -0.89
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CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa9.35□□□□□ -0.91
CAPNS1-201ENST00000246533 SPRR2DP22532 72 aa9.32□□□□□ -0.92
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa9.23□□□□□ -0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa9.23□□□□□ -0.93
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa9.21□□□□□ -0.94
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CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa8.98□□□□□ -0.97
CAPNS1-201ENST00000246533 MT1MQ8N339 61 aa8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa8.84□□□□□ -0.99
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa8.8□□□□□ -1
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa8.41□□□□□ -1.06
CAPNS1-201ENST00000246533 LOC100996750A0A140TA64 210 aa8.31□□□□□ -1.08
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa8.21□□□□□ -1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 LCE1DQ5T752 114 aa8.21□□□□□ -1.1
CAPNS1-201ENST00000246533 MT4P47944 62 aa8.2□□□□□ -1.1
CAPNS1-201ENST00000246533 LCE4AQ5TA78 99 aa8.19□□□□□ -1.1
CAPNS1-201ENST00000246533 HMCN1Q96RW7 5635 aa8.16□□□□□ -1.1
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CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP12-4P60329 112 aa7.94□□□□□ -1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa7.74□□□□□ -1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 MT1AP04731 61 aa7.72□□□□□ -1.17
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa7.7□□□□□ -1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa7.63□□□□□ -1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR98Q8WXG9 6306 aa7.63□□□□□ -1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa7.51□□□□□ -1.21
CAPNS1-201ENST00000246533 LCE3DQ9BYE3 92 aa7.39□□□□□ -1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.39□□□□□ -1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa7.36□□□□□ -1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 LCE3EQ5T5B0 92 aa7.35□□□□□ -1.23
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP5-2Q701N4 177 aa7.28□□□□□ -1.24
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa7.25□□□□□ -1.25
CAPNS1-201ENST00000246533 OBSCNQ5VST9 7968 aa7.07□□□□□ -1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 PRM1P04553 51 aa7.02□□□□□ -1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 MT3P25713 68 aa6.97□□□□□ -1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.95□□□□□ -1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.94□□□□□ -1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP5-8O75690 187 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa6.48□□□□□ -1.37
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CAPNS1-201ENST00000246533 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CAPNS1-201ENST00000246533 LCE1EQ5T753 118 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.21□□□□□ -1.42
CAPNS1-201ENST00000246533 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.99□□□□□ -1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.98□□□□□ -1.45
CAPNS1-201ENST00000246533 LCE1CQ5T751 118 aa5.85□□□□□ -1.47
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.33□□□□□ -1.56
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa5.25□□□□□ -1.57
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa5.06□□□□□ -1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 LCE1FQ5T754 118 aa4.92□□□□□ -1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.66□□□□□ -1.66
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa4.56□□□□□ -1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 PHGR1C9JFL3 82 aa4.54□□□□□ -1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4.31□□□□□ -1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.93□□□□□ -1.94
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